]> git.donarmstrong.com Git - ape.git/blobdiff - man/njs.Rd
various bug fixes
[ape.git] / man / njs.Rd
index 90a3444cca2004d04fe12ab9cfe3610c35610625..04bafb97fe6a7ab6c3c086c926c045fb6b854372 100644 (file)
@@ -12,15 +12,16 @@ bionjs(X, fs = 15)
 }
 \arguments{
   \item{X}{a distance matrix.}
-  \item{fs}{argument \emph{s} of the agglomerative criterion.}
+  \item{fs}{argument \emph{s} of the agglomerative criterion: it is
+    coerced as an integer and must at least equal to one.}
 }
 \details{
   Missing values represented by either \code{NA} or any negative number.
 
   Basically, the Q* criterion is applied to all the pairs of leaves, and
   the \emph{s} highest scoring ones are chosen for further analysis by
-  the agglomeration criteria that better handle handle missing
-  distances (see references for details).
+  the agglomeration criteria that better handle missing distances (see
+  references for details).
 }
 \value{
   an object of class \code{"phylo"}.