]> git.donarmstrong.com Git - ape.git/blob - man/xenarthra.Rd
current 2.1 release
[ape.git] / man / xenarthra.Rd
1 \name{xenarthra}
2 \alias{xenarthra}
3 \title{Molecular Phylogeny of Living Xenarthrans}
4 \description{
5   This phylogeny was inferred by maximum likelihood analysis of the
6   nuclear gene BRCA1 (breast cancer susceptibility, 2788 sites)
7   sequences for 47 placental and 3 marsupial taxa.
8 }
9 \usage{
10 data(xenarthra)
11 }
12 \format{
13   The data are stored as an object of class \code{"phylo"} which
14   structure is described in the help page of the function
15   \code{\link{read.tree}}.
16 }
17 \source{
18   Delsuc, F., Scally, M., Madsen, O., Stanhope, M. J., de Jong, W. W.,
19   Catzeflis, F. M., Springer, M. S. and Douzery, E. J. P. (2002)
20   Molecular phylogeny of living xenarthrans and the impact of character
21   and taxon sampling on the placental tree rooting. \emph{Molecular
22     Biology and Evolution}, \bold{19}, 1656--1671.
23 }
24 \seealso{
25   \code{\link{read.tree}}
26 }
27 \examples{
28 data(xenarthra)
29 plot(xenarthra)
30 ### remove the margins...
31 plot(xenarthra, no.margin = TRUE)
32 ### ... and use a smaller font size
33 plot(xenarthra, no.margin = TRUE, cex = 0.8)
34 }
35 \keyword{datasets}