man/which.edge.Rd

   1 \name{which.edge}
   2 \alias{which.edge}
   3 \title{Identifies Edges of a Tree}
   4 \usage{
   5 which.edge(phy, group)
   6 }
   7 \arguments{
   8   \item{phy}{an object of class \code{"phylo"}.}
   9   \item{group}{a vector of mode numeric or character specifying the tips
  10     for which the edges are to be identified.}
  11 }
  12 \description{
  13   This function identifies the edges that belong to a group (possibly
  14   non-monophyletic) specified as a set of tips.
  15 }
  16 \details{
  17   The group of tips specified in `group' may be non-monophyletic
  18   (paraphyletic or polyphyletic), in which case all edges from the tips
  19   to their most recent common ancestor are identified.
  20
  21   The identification is made with the indices of the rows of the matrix
  22   `edge' of the "phylo" object.
  23 }
  24 \value{
  25   a numeric vector.
  26 }
  27 \author{Emmanuel Paradis}
  28 \seealso{
  29   \code{\link{bind.tree}}, \code{\link{drop.tip}}, \code{\link{root}}
  30 }
  31 \keyword{manip}