man/weight.taxo.Rd

   1 \name{weight.taxo}
   2 \alias{weight.taxo}
   3 \alias{weight.taxo2}
   4 \title{Define Similarity Matrix}
   5 \usage{
   6   weight.taxo(x)
   7   weight.taxo2(x, y)
   8 }
   9 \arguments{
  10   \item{x, y}{a vector or a factor.}
  11 }
  12 \description{
  13   \code{weight.taxo} computes a matrix whose entries [i, j] are set to 1
  14   if x[i] == x[j], 0 otherwise.
  15
  16   \code{weight.taxo2} computes a matrix whose entries [i, j] are set to 1
  17   if x[i] == x[j] AND y[i] != y[j], 0 otherwise.
  18
  19   The diagonal [i, i] is always set to 0.
  20
  21   The returned matrix can be used as a weight matrix in
  22   \code{\link{Moran.I}}. \code{x} and \code{y} may be vectors of
  23   factors.
  24
  25   See further details in \code{vignette("MoranI")}.
  26 }
  27 \value{
  28   a square numeric matrix.
  29 }
  30 \author{Emmanuel Paradis}
  31 \seealso{
  32   \code{\link{Moran.I}}, \code{\link{correlogram.formula}}
  33 }
  34 \keyword{manip}