man/plot.correlogram.Rd

   1 \name{plot.correlogram}
   2 \alias{plot.correlogram}
   3 \alias{plot.correlogramList}
   4 \title{Plot a Correlogram}
   5 \usage{
   6   \method{plot}{correlogram}(x, legend = TRUE, test.level = 0.05,
   7                 col = c("grey", "red"), type = "b", xlab = "",
   8                 ylab = "Moran's I", pch = 21, cex = 2, ...)
   9   \method{plot}{correlogramList}(x, lattice = TRUE, legend = TRUE,
  10                 test.level = 0.05, col = c("grey", "red"),
  11                 xlab = "", ylab = "Moran's I",
  12                 type = "b", pch = 21, cex = 2, ...)
  13 }
  14 \arguments{
  15   \item{x}{an object of class \code{"correlogram"} or of class
  16     \code{"correlogramList"} (both produced by
  17     \code{\link{correlogram.formula}}).}
  18   \item{legend}{should a legend be added on the plot?}
  19   \item{test.level}{the level used to discriminate the plotting symbols
  20     with colours considering the P-values.}
  21   \item{col}{two colours for the plotting symbols: the first one is used
  22     if the P-value is greater than or equal to \code{test.level}, the
  23     second one otherwise.}
  24   \item{type}{the type of plot to produce (see
  25     \code{\link[graphics]{plot}} for possible choices).}
  26   \item{xlab}{an optional character string for the label on the x-axis
  27     (none by default).}
  28   \item{ylab}{the default label on the y-axis.}
  29   \item{pch}{the type of plotting symbol.}
  30   \item{cex}{the default size for the plotting symbols.}
  31   \item{lattice}{when plotting several correlograms, should they be
  32     plotted in trellis-style with lattice (the default), or together on
  33     the same plot?}
  34   \item{\dots}{other parameters passed to the \code{plot} or \code{lines}
  35     function.}
  36 }
  37 \description{
  38   These functions plot correlagrams previously computed with
  39   \code{\link{correlogram.formula}}.
  40 }
  41 \details{
  42   When plotting several correlograms with lattice, some options have no
  43   effect: \code{legend}, \code{type}, and \code{pch} (\code{pch=19} is
  44   always used in this situation).
  45
  46   When using \code{pch} between 1 and 20 (i.e., non-filled symbols, the
  47   colours specified in \code{col} are also used for the lines joining
  48   the points. To keep black lines, it is better to leave \code{pch}
  49   between 21 and 25.
  50 }
  51 \author{Emmanuel Paradis}
  52 \seealso{
  53   \code{\link{correlogram.formula}}, \code{\link{Moran.I}}
  54 }
  55 \keyword{hplot}