man/ladderize.Rd

   1 \name{ladderize}
   2 \alias{ladderize}
   3 \title{Ladderize a Tree}
   4 \usage{
   5 ladderize(phy, right = TRUE)
   6 }
   7 \arguments{
   8   \item{phy}{an object of class \code{"phylo"}.}
   9   \item{right}{a logical specifying whether the smallest clade is on the
  10     right-hand side (when the tree is plotted upwards), or the opposite
  11     (if \code{FALSE}).}
  12 }
  13 \description{
  14   This function reorganizes the internal structure of the tree to get
  15   the ladderized effect when plotted.
  16 }
  17 \author{Emmanuel Paradis}
  18 \seealso{
  19   \code{\link{plot.phylo}}, \code{\link{reorder.phylo}}
  20 }
  21 \examples{
  22 tr <- rcoal(50)
  23 layout(matrix(1:4, 2, 2))
  24 plot(tr, main = "normal")
  25 plot(ladderize(tr), main = "right-ladderized")
  26 plot(ladderize(tr, FALSE), main = "left-ladderized")
  27 layout(matrix(1, 1))
  28 }
  29 \keyword{manip}