]> git.donarmstrong.com Git - ape.git/blob - man/consensus.Rd
current 2.1 release
[ape.git] / man / consensus.Rd
1 \name{consensus}
2 \alias{consensus}
3 \title{Concensus Trees}
4 \usage{
5 consensus(..., p = 1)
6 }
7 \arguments{
8   \item{...}{either (i) a single object of class \code{"phylo"}, (ii) a
9     series of such objects separated by commas, or (iii) a list
10     containing such objects.}
11   \item{p}{a numeric value between 0.5 and 1 giving the proportion for a
12     clade to be represented in the consensus tree.}
13 }
14 \description{
15   Given a series of trees, this function returns the consensus tree. By
16   default, the strict-consensus tree is computed. To get the
17   majority-rule consensus tree, use \code{p = 0.5}. Any value between
18   0.5 and 1 can be used.
19 }
20 \value{
21   an object of class \code{"phylo"}.
22 }
23 \author{Emmanuel Paradis \email{Emmanuel.Paradis@mpl.ird.fr}}
24 \seealso{
25   \code{\link{prop.part}}, \code{\link{dist.topo}}
26 }
27 \keyword{manip}