man/branching.times.Rd

   1 \name{branching.times}
   2 \alias{branching.times}
   3 \title{Branching Times of a Phylogenetic Tree}
   4 \usage{
   5 branching.times(phy)
   6 }
   7 \arguments{
   8   \item{phy}{an object of class \code{"phylo"}.}
   9 }
  10 \description{
  11   This function computes the branching times of a phylogenetic tree,
  12   that is the distance from each node to the tips, under the assumption that
  13   the tree is ultrametric. Note that the function does not check that the
  14   tree is effectively ultrametric, so if it is not, the returned result
  15   may not be meaningful.
  16 }
  17 \value{
  18   a numeric vector with the branching times. If the phylogeny \code{phy}
  19   has an element \code{node.label}, this is used as names for the
  20   returned vector; otherwise the numbers (of mode character) of the
  21   matrix \code{edge} of \code{phy} are used as names.
  22 }
  23 \author{Emmanuel Paradis}
  24 \seealso{
  25 \code{\link{is.ultrametric}}
  26 }
  27 \keyword{manip}