man/bird.orders.Rd

   1 \name{bird.orders}
   2 \alias{bird.orders}
   3 \title{Phylogeny of the Orders of Birds From Sibley and Ahlquist}
   4 \description{
   5   This data set describes the phylogenetic relationships of the orders
   6   of birds as reported by Sibley and Ahlquist (1990). Sibley and
   7   Ahlquist inferred this phylogeny from an extensive number of DNA/DNA
   8   hybridization experiments. The ``tapestry'' reported by these two
   9   authors (more than 1000 species out of the ca. 9000 extant bird
  10   species) generated a lot of debates.
  11
  12   The present tree is based on the relationships among orders. The
  13   branch lengths were calculated from the values of \eqn{\Delta
  14     T_{50}H}{Delta T50H} as found in Sibley and Ahlquist (1990,
  15   fig. 353).
  16 }
  17 \usage{
  18 data(bird.orders)
  19 }
  20 \format{
  21   The data are stored as an object of class \code{"phylo"} which
  22   structure is described in the help page of the function
  23   \code{\link{read.tree}}.
  24 }
  25 \source{
  26   Sibley, C. G. and Ahlquist, J. E. (1990) Phylogeny and classification
  27   of birds: a study in molecular evolution. New Haven: Yale University Press.
  28 }
  29 \seealso{
  30   \code{\link{read.tree}}, \code{\link{bird.families}}
  31 }
  32 \examples{
  33 data(bird.orders)
  34 plot(bird.orders)
  35 }
  36 \keyword{datasets}