man/bird.families.Rd

   1 \name{bird.families}
   2 \alias{bird.families}
   3 \title{Phylogeny of the Families of Birds From Sibley and Ahlquist}
   4 \description{
   5   This data set describes the phylogenetic relationships of the families
   6   of birds as reported by Sibley and Ahlquist (1990). Sibley and
   7   Ahlquist inferred this phylogeny from an extensive number of DNA/DNA
   8   hybridization experiments. The ``tapestry'' reported by these two
   9   authors (more than 1000 species out of the ca. 9000 extant bird
  10   species) generated a lot of debates.
  11
  12   The present tree is based on the relationships among families. A few
  13   families were not included in the figures in Sibley and Ahlquist, and
  14   thus are not included here as well. The branch lengths were calculated
  15   from the values of \eqn{\Delta T_{50}H}{Delta T50H} as found in Sibley
  16   and Ahlquist (1990, figs. 354, 355, 356, and 369).
  17 }
  18 \usage{
  19 data(bird.families)
  20 }
  21 \format{
  22   The data are stored as an object of class \code{"phylo"} which
  23   structure is described in the help page of the function
  24   \code{\link{read.tree}}.
  25 }
  26 \source{
  27   Sibley, C. G. and Ahlquist, J. E. (1990) Phylogeny and classification
  28   of birds: a study in molecular evolution. New Haven: Yale University Press.
  29 }
  30 \seealso{
  31   \code{\link{read.tree}}, \code{\link{bird.orders}}
  32 }
  33 \examples{
  34 data(bird.families)
  35 op <- par()
  36 par(cex = 0.3)
  37 plot(bird.families)
  38 par(op)
  39 }
  40 \keyword{datasets}