R/ape-defunct.R

   1 klastorin <- function(phy)
   2     .Defunct(msg = '\'klastorin\' has been removed from ape,
   3     see help("ape-defunct") for details.')
   4
   5 mlphylo <-
   6     function(x, phy, model = DNAmodel(), search.tree = FALSE,
   7              quiet = FALSE, value = NULL, fixed = FALSE)
   8     .Defunct(msg = '\'mlphylo\' has been removed from ape,
   9     see help("ape-defunct") for details.')
  10
  11 DNAmodel <- function(model = "K80", partition = 1,
  12          ncat.isv = 1, invar = FALSE,
  13          equal.isv = TRUE, equal.invar = 1)
  14     .Defunct(msg = '\'DNAmodel\' has been removed from ape,
  15     see help("ape-defunct") for details.')
  16
  17 sh.test <- function(..., x, model = DNAmodel(), B = 100)
  18     .Defunct(msg = '\'sh.test\' has been removed from ape,
  19     see help("ape-defunct") for details.')