]> git.donarmstrong.com Git - fastq-tools.git/blobdiff - src/hash.h
a program to output a nonredundant list of readss
[fastq-tools.git] / src / hash.h
diff --git a/src/hash.h b/src/hash.h
new file mode 100644 (file)
index 0000000..f101824
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,37 @@
+
+#ifndef FASTQ_TOOLS_HASH_H
+#define FASTQ_TOOLS_HASH_H
+
+#include <stdlib.h>
+#include <stdint.h>
+
+
+typedef struct hashed_value_
+{
+    char*    value;
+    size_t   len;
+    uint32_t count;
+    struct hashed_value_* next;
+} hashed_value;
+
+
+typedef struct
+{
+    hashed_value** A; /* table proper */
+    size_t n;         /* table size */
+    size_t m;         /* hashed items */
+    size_t max_m;     /* max hashed items before rehash */
+} hash_table;
+
+
+hash_table* create_hash_table();
+
+void destroy_hash_table(hash_table*);
+
+void inc_hash_table(hash_table*, const char* value, size_t len);
+
+hashed_value** dump_hash_table(hash_table*);
+
+
+#endif
+