]> git.donarmstrong.com Git - mothur.git/blobdiff - sharedlistvector.h
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[mothur.git] / sharedlistvector.h
index f62248db77da9895e25fcb57f687fcf24922b47d..8cfb7e000a9427921ce9e951c040c06c50cc71d8 100644 (file)
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 #include "globaldata.hpp"
 #include "sharedrabundvector.h"
 #include "sharedsabundvector.h"
-#include <iostream>
-#include <map>
 
 /* This class is a child to datavector.  It represents OTU information at a certain distance. 
        A sharedlistvector can be converted into a sharedordervector, sharedrabundvector or sharedsabundvectorand 
@@ -56,6 +54,7 @@ public:
        SharedOrderVector* getSharedOrderVector();
        SharedRAbundVector getSharedRAbundVector(string);  //get sharedrabundvector for a certain group
        SharedSAbundVector getSharedSAbundVector(string);                       //get sharedsabundvector for a certain group
+       vector<SharedRAbundVector*> getSharedRAbundVector(); //returns sharedRabundVectors for all the users groups
        
 private:
        vector<string> data;  //data[i] is a list of names of sequences in the ith OTU.