]> git.donarmstrong.com Git - mothur.git/blobdiff - sharedkulczynski.cpp
done testing 1.13.0
[mothur.git] / sharedkulczynski.cpp
index 5eadd16691e770453f0ed0053aa3a42ffa3e7b73..c19df537a4f382f5404d8d2c643725599fba2478 100644 (file)
@@ -2,7 +2,7 @@
  *  sharedkulczynski.cpp
  *  Mothur
  *
- *  Created by John Westcott on 3/24/09.
+ *  Created by Sarah Westcott on 3/24/09.
  *  Copyright 2009 Schloss Lab UMASS Amherst. All rights reserved.
  *
  */
@@ -13,7 +13,7 @@
 
 EstOutput Kulczynski::getValues(vector<SharedRAbundVector*> shared) {
        try {
-               int S1, S2, S12, tempA, tempB;
+               double S1, S2, S12, tempA, tempB;
                S1 = 0; S2 = 0; S12 = 0; tempA = 0; tempB = 0; 
                
                /*S1, S2 = number of OTUs observed or estimated in A and B 
@@ -40,13 +40,9 @@ EstOutput Kulczynski::getValues(vector<SharedRAbundVector*> shared) {
                return data;
        }
        catch(exception& e) {
-               cout << "Standard Error: " << e.what() << " has occurred in the Kulczynski class Function getValues. Please contact Pat Schloss at pschloss@microbio.umass.edu." << "\n";
+               m->errorOut(e, "Kulczynski", "getValues");
                exit(1);
        }
-       catch(...) {
-               cout << "An unknown error has occurred in the Kulczynski class Function getValues. Please contact Pat Schloss at pschloss@microbio.umass.edu." << "\n";
-               exit(1);
-       }       
 }
 
 /***********************************************************************/