// if((letter == '>')){ qFile.putback(letter); break; }
// else if (isprint(letter)) { scores += letter; }
// }
-// cout << scores << endl;
// m->gobble(qFile);
//
// break;
string QualityScores::getName(){
try {
- cout << qScores.size() << '\t';
return seqName;
}
catch(exception& e) {
void QualityScores::trimQScores(int start, int end){
try {
vector<int> hold;
-
- cout << seqName << '\t' << qScores.size() << '\t' << start << '\t' << end << endl;
-
+
if(end == -1){
hold = vector<int>(qScores.begin()+start, qScores.end());
qScores = hold;