]> git.donarmstrong.com Git - mothur.git/blobdiff - hclustercommand.h
added check to make sure shhh.flows child processes finish properly. added subsamplin...
[mothur.git] / hclustercommand.h
index 9241e94c35441e1b0d09d3bddae9a76d8f6c4cc6..aeeb3bc9cb295d93bbec1c33f405dcab27e55673 100644 (file)
@@ -39,7 +39,9 @@ public:
        string getCommandName()                 { return "hcluster";    }
        string getCommandCategory()             { return "Clustering";  }
        string getHelpString(); 
-       
+       string getCitation() { return "Sun Y, Cai Y, Liu L, Yu F, Farrell ML, Mckendree W, Farmerie W (2009). ESPRIT: estimating species richness using large collections of 16S rRNA pyrosequences. Nucleic Acids Res 37: e76. \nhttp://www.mothur.org/wiki/Hcluster"; }
+       string getDescription()         { return "cluster your sequences into OTUs using a distance matrix"; }
+
        int execute(); 
        void help() { m->mothurOut(getHelpString()); }