]> git.donarmstrong.com Git - mothur.git/blobdiff - groupmap.h
added get.oturep command
[mothur.git] / groupmap.h
index de69ca4d94c5e98342c666c7de0a768f61a3b267..20048a59a5f5aaa3658dd5697f26e3f255a978e1 100644 (file)
@@ -9,10 +9,7 @@
  *
  */
 
-#include <map>
-#include <string>
-#include <iostream>
-#include <fstream>
+#include "mothur.h"
 #include "utilities.hpp"
 
 /* This class is a representation of the groupfile.  It is used by all the shared commands to determine what group a 
@@ -25,6 +22,7 @@ public:
        ~GroupMap();
        void readMap();
        int getNumGroups();
+       bool isValidGroup(string);  //return true if string is a valid group
        string getGroup(string);
        void setGroup(string, string);
        vector<string> namesOfGroups;