]> git.donarmstrong.com Git - mothur.git/blobdiff - chimeraperseuscommand.h
working on mgcluster count file change
[mothur.git] / chimeraperseuscommand.h
index 45627500f6f8f9944aee508db3ffbbd8960956c1..1c4baa3f8f0d5a8b5724af661f51850b6d0b4762 100644 (file)
@@ -28,6 +28,7 @@ public:
        vector<string> setParameters();
        string getCommandName()                 { return "chimera.perseus";             }
        string getCommandCategory()             { return "Sequence Processing"; }
+       string getOutputFileNameTag(string, string);
        string getHelpString(); 
        string getCitation() { return "http://www.mothur.org/wiki/Chimera.perseus\n"; }
        string getDescription()         { return "detect chimeric sequences"; }
@@ -98,7 +99,7 @@ struct perseusData {
        }
 };
 /**************************************************************************************************/
-#if defined (__APPLE__) || (__MACH__) || (linux) || (__linux)
+#if defined (__APPLE__) || (__MACH__) || (linux) || (__linux) || (__linux__) || (__unix__) || (__unix)
 #else
 static DWORD WINAPI MyPerseusThreadFunction(LPVOID lpParam){ 
        perseusData* pDataArray;