]> git.donarmstrong.com Git - mothur.git/blobdiff - blastdb.hpp
fixed id match
[mothur.git] / blastdb.hpp
index d61aaecb5e0712b47458e000416b881719cc7e65..844f7f1fdc78abe8e3a1e38ca6045e1584a454db 100644 (file)
@@ -12,7 +12,6 @@
  */
 
 #include "mothur.h"
-#include "globaldata.hpp"
 
 class BlastDB : public Database {
 
@@ -26,11 +25,6 @@ public:
        vector<int> findClosestSequences(Sequence*, int);
        vector<int> findClosestMegaBlast(Sequence*, int);
        
-       #ifdef USE_MPI  
-       int MPISend(int); //just sends gapOpen, gapExtend, match and mismatch
-       int MPIRecv(int);
-       #endif
-       
 private:
        string dbFileName;
        string queryFileName;
@@ -42,7 +36,7 @@ private:
        float gapExtend;
        float match;
        float misMatch;
-       GlobalData* globaldata;
+       
 };
 
 #endif