]> git.donarmstrong.com Git - mothur.git/blobdiff - binsequencecommand.cpp
some alterations to chimera.slayer
[mothur.git] / binsequencecommand.cpp
index d1764acec4602f5d90783f7a0abf35195b63149d..34965f624cc789e830783302f4ccd36993e28ea4 100644 (file)
@@ -41,7 +41,7 @@ string BinSeqCommand::getHelpString(){
                helpString += "The default value for label is all lines in your inputfile.\n";
                helpString += "The bin.seqs command outputs a .fasta file for each distance you specify appending the OTU number to each name.\n";
                helpString += "If you provide a groupfile, then it also appends the sequences group to the name.\n";
-               helpString += "Note: No spaces between parameter labels (i.e. fasta), '=' and parameters (i.e.yourFastaFile).\n\n";
+               helpString += "Note: No spaces between parameter labels (i.e. fasta), '=' and parameters (i.e.yourFastaFile).\n";
                return helpString;
        }
        catch(exception& e) {
@@ -281,10 +281,6 @@ int BinSeqCommand::execute(){
                
                if(m->control_pressed) { for (int i = 0; i < outputNames.size(); i++) { remove(outputNames[i].c_str());         }  return 0; }  
                
-               delete input;  
-               delete fasta; 
-               if (groupfile != "") {  delete groupMap;   } 
-               
                m->mothurOutEndLine();
                m->mothurOut("Output File Names: "); m->mothurOutEndLine();
                for (int i = 0; i < outputNames.size(); i++) {  m->mothurOut(outputNames[i]); m->mothurOutEndLine();    }