-
-CREATE TABLE [AlleleFlagCode] (
- [code] [tinyint] NOT NULL ,
- [abbrev] [varchar] (12) NOT NULL ,
- [descrip] [varchar] (255) NOT NULL ,
- [create_time] [smalldatetime] NOT NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [AlleleMotif] (
- [allele_id] [int] NOT NULL ,
- [motif_order] [int] NOT NULL ,
- [motif_id] [int] NOT NULL ,
- [repeat_cnt] [real] NOT NULL ,
- [create_time] [smalldatetime] NOT NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [AllocIds] (
- [name] [varchar] (30) NOT NULL ,
- [id] [int] NOT NULL ,
- [cycle] [int] NULL ,
- [create_time] [smalldatetime] NULL ,
- [last_updated_time] [smalldatetime] NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [Author] (
- [pub_id] [int] NOT NULL ,
- [position] [tinyint] NOT NULL ,
- [author] [varchar] (255) NOT NULL ,
- [create_time] [smalldatetime] NULL ,
- [last_updated_time] [smalldatetime] NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [Batch_tax_id] (
- [batch_id] [int] NOT NULL ,
- [tax_id] [int] NOT NULL ,
- [update_time] [datetime] NOT NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [ChiSqPValueLookUp] (
- [df] [tinyint] NOT NULL ,
- [chisq_from] [float] NOT NULL ,
- [chisq_to] [float] NOT NULL ,
- [pvalue_upper_bound] [float] NOT NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [CpGCode] (
- [code] [tinyint] NOT NULL ,
- [abbrev] [varchar] (12) NOT NULL ,
- [descrip] [varchar] (255) NOT NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [GenBankDivisionCode] (
- [code] [varchar] (6) NOT NULL ,
- [abbrev] [varchar] (40) NOT NULL ,
- [descrip] [varchar] (255) NOT NULL ,
- [display_order] [tinyint] NOT NULL ,
- [create_time] [smalldatetime] NOT NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [GenderCode] (
- [code] [char] (1) NOT NULL ,
- [gender] [varchar] (6) NOT NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [GenomeBuildInfo] (
- [snp_build_id] [int] NOT NULL ,
- [tax_id] [int] NOT NULL ,
- [database_name] [varchar] (32) NOT NULL ,
- [ncbi_build_id] [int] NOT NULL ,
- [ncbi_build_ver] [tinyint] NOT NULL ,
- [insert_time] [smalldatetime] NOT NULL ,
- [is_major] [tinyint] NOT NULL ,
- [ncbi_genome_tax_id] [int] NOT NULL ,
- [ref_assembly] [varchar] (255) NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [GtyAllele] (
- [gty_id] [int] NOT NULL ,
- [rev_flag] [bit] NOT NULL ,
- [chr_num] [tinyint] NOT NULL ,
- [fwd_allele_id] [int] NOT NULL ,
- [unigty_id] [int] NULL ,
- [create_time] [smalldatetime] NOT NULL ,
- [last_updated_time] [smalldatetime] NOT NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [IUPACna] (
- [allele] [varchar] (1) NOT NULL ,
- [meaning] [varchar] (10) NOT NULL ,
- [bitcode] [varchar] (4) NOT NULL ,
- [value] [tinyint] NOT NULL ,
- [rev_base] [char] (1) NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [LoadHistory] (
- [build_id] [int] NOT NULL ,
- [loaddate] [smalldatetime] NOT NULL ,
- [status] [char] (30) NOT NULL ,
- [comments] [varchar] (255) NULL ,
- [script] [varchar] (255) NULL ,
- [ftp_done_date] [smalldatetime] NULL ,
- [entrez_done_date] [smalldatetime] NULL ,
- [blastdb_done_date] [smalldatetime] NULL ,
- [web_date] [smalldatetime] NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [LocTypeCode] (
- [code] [tinyint] NOT NULL ,
- [abbrev] [varchar] (12) NOT NULL ,
- [descrip] [varchar] (255) NOT NULL ,
- [create_time] [smalldatetime] NOT NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [MapLinkCode] (
- [which_code] [varchar] (20) NOT NULL ,
- [code] [tinyint] NOT NULL ,
- [abbr] [varchar] (10) NULL ,
- [note] [varchar] (255) NULL ,
- [create_time] [smalldatetime] NULL ,
- [last_updated_time] [smalldatetime] NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [Method] (
- [method_id] [int] NOT NULL ,
- [handle] [varchar] (20) NOT NULL ,
- [loc_method_id] [varchar] (64) NOT NULL ,
- [loc_method_id_upp] [varchar] (64) NOT NULL ,
- [method_class] [tinyint] NULL ,
- [template_type] [tinyint] NULL ,
- [seq_both_strands] [varchar] (3) NULL ,
- [mult_pcr_amplification] [varchar] (3) NULL ,
- [mult_clones_tested] [varchar] (3) NULL ,
- [create_time] [smalldatetime] NULL ,
- [last_updated_time] [smalldatetime] NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [MethodClass] (
- [meth_class_id] [tinyint] NOT NULL ,
- [name] [varchar] (64) NOT NULL ,
- [last_updated_time] [smalldatetime] NOT NULL ,
- [validation_status] [tinyint] NOT NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [MethodLine] (
- [method_id] [int] NOT NULL ,
- [line_num] [tinyint] NOT NULL ,
- [line] [varchar] (255) NOT NULL ,
- [create_time] [smalldatetime] NULL ,
- [last_updated_time] [smalldatetime] NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [Moltype] (
- [code] [tinyint] NOT NULL ,
- [moltype] [varchar] (10) NOT NULL ,
- [descrip] [varchar] (255) NOT NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [Motif] (
- [motif_id] [int] NOT NULL ,
- [motif] [varchar] (253) NOT NULL ,
- [rev_motif_id] [int] NULL ,
- [last_updated_time] [smalldatetime] NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [ObsGenotype] (
- [gty_id] [int] NOT NULL ,
- [obs] [varchar] (512) NOT NULL ,
- [obs_upp_fix] [varchar] (512) NOT NULL ,
- [last_updated_time] [smalldatetime] NOT NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [ObsVariation] (
- [var_id] [int] NOT NULL ,
- [pattern] [varchar] (255) NOT NULL ,
- [create_time] [smalldatetime] NOT NULL ,
- [last_updated_time] [smalldatetime] NULL ,
- [univar_id] [int] NULL ,
- [var_flag] [tinyint] NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [OrgDbStatus] (
- [database_name] [varchar] (32) NOT NULL ,
- [SNP_cnt] [int] NULL ,
- [SubSNP_cnt] [int] NULL ,
- [cluster_cnt] [int] NULL ,
- [unmapped_rs_cnt] [int] NULL ,
- [SubInd_cnt] [int] NULL ,
- [ind_cnt] [int] NULL ,
- [SubInd_ss_cnt] [int] NULL ,
- [SubPop_cnt] [int] NULL ,
- [pop_cnt] [int] NULL ,
- [SubPop_ss_cnt] [int] NULL ,
- [GtyFreqBySsPop_ss_cnt] [int] NULL ,
- [AlleleFreqBySsPop_ss_cnt] [int] NULL ,
- [SNPGtyFreq_rs_cnt] [int] NULL ,
- [SNPAlleleFreq_rs_cnt] [int] NULL ,
- [snp_build_max] [int] NULL ,
- [genome_build_max] [varchar] (8) NULL ,
- [map_time] [smalldatetime] NULL ,
- [cluster_time_max] [smalldatetime] NULL ,
- [create_time] [smalldatetime] NULL ,
- [last_SNPBatch_time] [smalldatetime] NULL ,
- [last_POPBatch_time] [smalldatetime] NULL ,
- [last_INDBatch_time] [smalldatetime] NULL ,
- [rsMax] [int] NULL ,
- [rsMissenseMax] [int] NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [OrganismTax] (
- [organism] [varchar] (40) NOT NULL ,
- [tax_id] [int] NOT NULL ,
- [common_name] [varchar] (32) NULL ,
- [gpipe_abbr] [varchar] (7) NOT NULL ,
- [create_time] [smalldatetime] NOT NULL ,
- [last_updated_time] [smalldatetime] NOT NULL ,
- [comment] [varchar] (255) NULL ,
- [division_cd] [varchar] (6) NULL ,
- [database_name] [varchar] (32) NOT NULL ,
- [short_common_name] [varchar] (32) NOT NULL ,
- [tax_id_rank] [varchar] (5) NOT NULL ,
- [species_tax_id] [int] NOT NULL ,
- [no_freq_summary] [bit] NULL ,
- [entrez_index] [smallint] NULL ,
- [pub_genome_build] [decimal](4, 1) NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [PopClass] (
- [pop_id] [int] NOT NULL ,
- [pop_class_id] [int] NOT NULL ,
- [snp_count] [int] NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [PopClassCode] (
- [pop_class_id] [int] NOT NULL ,
- [pop_class] [char] (50) NOT NULL ,
- [pop_class_text] [char] (255) NOT NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [Publication] (
- [pub_id] [int] NOT NULL ,
- [pmid] [int] NULL ,
- [handle] [varchar] (20) NOT NULL ,
- [meduid] [int] NULL ,
- [title] [varchar] (235) NOT NULL ,
- [journal] [varchar] (255) NULL ,
- [vol] [varchar] (255) NULL ,
- [suppl] [varchar] (128) NULL ,
- [issue] [varchar] (128) NULL ,
- [i_suppl] [varchar] (128) NULL ,
- [pages] [varchar] (255) NULL ,
- [year] [smallint] NOT NULL ,
- [status] [tinyint] NOT NULL ,
- [blobflag] [tinyint] NULL ,
- [last_updated] [smalldatetime] NOT NULL ,
- [create_time] [smalldatetime] NULL ,
- [last_updated_time] [smalldatetime] NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [SNPGlossary] (
- [term] [varchar] (256) NOT NULL ,
- [description] [varchar] (4000) NULL ,
- [last_updated] [smalldatetime] NULL ,
- [used_in] [varchar] (32) NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [SNP_tax_id] (
- [snp_id] [int] NOT NULL ,
- [tax_id] [int] NULL ,
- [update_time] [smalldatetime] NULL ,
- [status] [char] (1) NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [SnpChrCode] (
- [code] [varchar] (8) NOT NULL ,
- [abbrev] [varchar] (20) NOT NULL ,
- [descrip] [varchar] (255) NOT NULL ,
- [create_time] [smalldatetime] NOT NULL ,
- [sort_order] [tinyint] NULL ,
- [db_name] [varchar] (32) NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [SnpClassCode] (
- [code] [tinyint] NOT NULL ,
- [abbrev] [varchar] (20) NOT NULL ,
- [descrip] [varchar] (255) NOT NULL ,
- [display_str] [varchar] (255) NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [SnpFunctionCode] (
- [code] [tinyint] NOT NULL ,
- [abbrev] [varchar] (20) NOT NULL ,
- [descrip] [varchar] (255) NOT NULL ,
- [create_time] [smalldatetime] NOT NULL ,
- [top_level_class] [char] (5) NOT NULL ,
- [is_coding] [tinyint] NOT NULL ,
- [is_exon] [bit] NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [SnpValidationCode] (
- [code] [tinyint] NOT NULL ,
- [abbrev] [varchar] (40) NOT NULL ,
- [descrip] [varchar] (255) NOT NULL ,
- [create_time] [smalldatetime] NULL ,
- [last_updated_time] [smalldatetime] NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [StrandCode] (
- [code] [tinyint] NOT NULL ,
- [abbrev] [varchar] (20) NOT NULL ,
- [rs_to_ss_orien] [bit] NOT NULL ,
- [descrip] [varchar] (255) NOT NULL ,
- [create_time] [smalldatetime] NOT NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [SubSNPDelComm] (
- [comment_id] [smallint] NOT NULL ,
- [comment] [varchar] (255) NOT NULL ,
- [create_time] [smalldatetime] NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [SubSNPSeqTypeCode] (
- [code] [tinyint] NOT NULL ,
- [abbrev] [varchar] (20) NOT NULL ,
- [descrip] [varchar] (255) NOT NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [Submitter] (
- [handle] [varchar] (20) NOT NULL ,
- [name] [varchar] (255) NOT NULL ,
- [fax] [varchar] (255) NULL ,
- [phone] [varchar] (255) NULL ,
- [email] [varchar] (255) NULL ,
- [lab] [varchar] (255) NULL ,
- [institution] [varchar] (255) NULL ,
- [address] [varchar] (255) NULL ,
- [create_time] [smalldatetime] NULL ,
- [last_updated_time] [smalldatetime] NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [TemplateType] (
- [temp_type_id] [tinyint] NOT NULL ,
- [name] [varchar] (64) NOT NULL ,
- [last_updated_time] [smalldatetime] NOT NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [UniGty] (
- [unigty_id] [int] NOT NULL ,
- [gty_str] [varchar] (255) NULL ,
- [allele_id_1] [int] NOT NULL ,
- [allele_id_2] [int] NULL ,
- [create_time] [smalldatetime] NOT NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [UniVariAllele] (
- [univar_id] [int] NOT NULL ,
- [allele_id] [int] NOT NULL ,
- [create_time] [smalldatetime] NOT NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [UniVariation] (
- [univar_id] [int] NOT NULL ,
- [var_str] [varchar] (900) NULL ,
- [allele_cnt] [smallint] NOT NULL ,
- [subsnp_class] [tinyint] NOT NULL ,
- [iupack_code] [char] (1) NOT NULL ,
- [top_or_bot_strand] [char] (1) NOT NULL ,
- [create_time] [smalldatetime] NOT NULL ,
- [last_updated_time] [smalldatetime] NOT NULL ,
- [src_code] [tinyint] NULL ,
- [rev_univar_id] [int] NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [UniVariationSrcCode] (
- [code] [tinyint] NOT NULL ,
- [abbrev] [varchar] (20) NOT NULL ,
- [descrip] [varchar] (255) NOT NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [VariAllele] (
- [var_id] [int] NOT NULL ,
- [allele_id] [int] NOT NULL ,
- [create_time] [smalldatetime] NOT NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [db_DataDictionaryNew] (
- [tab] [varchar] (64) NULL ,
- [col] [varchar] (32) NULL ,
- [col_order] [int] NULL ,
- [typ] [varchar] (16) NULL ,
- [length] [int] NULL ,
- [description] [varchar] (6000) NULL ,
- [todo] [varchar] (1000) NULL ,
- [update_time] [smalldatetime] NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [db_ftp_table_list] (
- [table_name] [varchar] (32) NOT NULL ,
- [db_str] [varchar] (64) NOT NULL ,
- [create_time] [smalldatetime] NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [db_map_table_name] (
- [table_name] [varchar] (32) NOT NULL ,
- [to_index] [bit] NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [dn_Allele_rev] (
- [allele_id] [int] NOT NULL ,
- [rev_flag] [tinyint] NOT NULL ,
- [fwd_allele_id] [int] NOT NULL ,
- [fwd_allele] [varchar] (255) NOT NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [dn_Motif_rev] (
- [motif_id] [int] NOT NULL ,
- [rev_flag] [tinyint] NOT NULL ,
- [fwd_motif] [varchar] (253) NULL ,
- [fwd_motif_id] [int] NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [dn_UniGty_allele] (
- [unigty_id] [int] NOT NULL ,
- [chr_num] [tinyint] NOT NULL ,
- [allele_id] [int] NOT NULL ,
- [create_time] [smalldatetime] NOT NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [dn_UniGty_rev] (
- [unigty_id] [int] NOT NULL ,
- [rev_flag] [tinyint] NOT NULL ,
- [fwd_unigty_id] [int] NOT NULL ,
- [fwd_gty_str] [varchar] (255) NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [dn_UniVariation_rev] (
- [univar_id] [int] NOT NULL ,
- [rev_flag] [tinyint] NOT NULL ,
- [fwd_univar_id] [int] NULL ,
- [fwd_univar_str] [varchar] (900) NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [dn_baseFlip] (
- [base] [char] (1) NULL ,
- [rev_flag] [tinyint] NULL ,
- [fwd_base] [char] (1) NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [dn_gty2unigty_trueSNP] (
- [gty_id] [int] NOT NULL ,
- [rev_flag] [bit] NOT NULL ,
- [unigty_id] [int] NULL ,
- [obs] [varchar] (512) NOT NULL ,
- [gty_str] [varchar] (255) NULL
-)
-GO
-
-
-CREATE TABLE [dn_summary] (
- [tax_id] [int] NOT NULL ,
- [build_id] [int] NOT NULL ,
- [type] [varchar] (20) NOT NULL ,
- [cnt] [int] NOT NULL ,
- [create_time] [smalldatetime] NOT NULL ,
- [last_updated_time] [smalldatetime] NOT NULL
-)
-GO
-
-