if (key == "freq" ) { freq = value; }
if (key == "method" ) { method = value; }
if (key == "fileroot" ) { fileroot = value; }
if (key == "freq" ) { freq = value; }
if (key == "method" ) { method = value; }
if (key == "fileroot" ) { fileroot = value; }
if (key == "random" ) { randomtree = value; }
if (key == "groups" ) { groups = value; }
if (key == "calc") { calc = value; }
if (key == "random" ) { randomtree = value; }
if (key == "groups" ) { groups = value; }
if (key == "calc") { calc = value; }
if (key == "groups") {//stores groups to be used in a vector
Groups.clear();
groups = value;
splitAtDash(value, Groups);
}
if (key == "groups") {//stores groups to be used in a vector
Groups.clear();
groups = value;
splitAtDash(value, Groups);
}
if (key == "freq" ) { freq = value; }
if (key == "method" ) { method = value; }
if (key == "fileroot" ) { fileroot = value; }
if (key == "freq" ) { freq = value; }
if (key == "method" ) { method = value; }
if (key == "fileroot" ) { fileroot = value; }
if (key == "random" ) { randomtree = value; }
if (key == "groups" ) { groups = value; }
if (key == "calc") { calc = value; }
if (key == "random" ) { randomtree = value; }
if (key == "groups" ) { groups = value; }
if (key == "calc") { calc = value; }
string GlobalData::getIters() { return iters; }
string GlobalData::getJumble() { return jumble; }
string GlobalData::getFreq() { return freq; }
string GlobalData::getIters() { return iters; }
string GlobalData::getJumble() { return jumble; }
string GlobalData::getFreq() { return freq; }
string GlobalData::getRandomTree() { return randomtree; }
void GlobalData::setListFile(string file) { listfile = file; inputFileName = file;}
void GlobalData::setRabundFile(string file) { rabundfile = file; inputFileName = file;}
string GlobalData::getRandomTree() { return randomtree; }
void GlobalData::setListFile(string file) { listfile = file; inputFileName = file;}
void GlobalData::setRabundFile(string file) { rabundfile = file; inputFileName = file;}