emacs_el/configuration/don-configuration.org

   1 #+PROPERTY: header-args:emacs-lisp :tangle don-configuration.el
   2 #+OPTIONS: auto-id:f
   3
   4 * General Notes
   5
   6 ** Delight
   7 To look up options for symbols for delight, check out https://en.wikipedia.org/wiki/Emoji#Unicode_blocks
   8
   9 * Load debugger
  10
  11 # if for some reason, things get pear-shaped, we want to be able to
  12 # enter the debugger by sending -USR2 to emacs
  13
  14 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
  15 (setq debug-on-event 'siguser2)
  16 #+END_SRC
  17 * Paths
  18 ** Update PATH
  19 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
  20 (add-to-list 'exec-path '"/usr/local/bin")
  21 (add-to-list 'exec-path '"~/bin/")
  22 #+END_SRC
  23 ** Add library paths
  24 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
  25 (let ((default-directory "~/lib/emacs_el/"))
  26   (normal-top-level-add-subdirs-to-load-path))
  27 ;; (eval-and-compile
  28 ;;   (let ((default-directory "~/var/emacs/elpa"))
  29 ;;     (normal-top-level-add-subdirs-to-load-path))
  30 ;; )
  31 (add-to-list 'load-path '"~/lib/emacs_el")
  32 (setq package-user-dir "~/var/emacs/elpa")
  33
  34 #+END_SRC
  35 * Initial startup stuff
  36 ** Disable startup screen
  37 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
  38 (setq inhibit-startup-screen t)
  39 #+END_SRC
  40 ** Disable cluter
  41 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
  42 ; (if (fboundp 'menu-bar-mode) (menu-bar-mode -1))
  43 (if (fboundp 'tool-bar-mode) (tool-bar-mode -1))
  44 (if (fboundp 'scroll-bar-mode) (scroll-bar-mode -1))
  45 #+END_SRC
  46 ** Fullscreen
  47 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
  48 (setq frame-resize-pixelwise t)
  49 (add-to-list 'default-frame-alist '(fullscreen . maximixed))
  50 #+END_SRC
  51 * Package management
  52 ** Bootstrap straight.el
  53 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
  54 (defvar bootstrap-version)
  55 (setq straight-base-dir '"~/var/emacs/")
  56 (let ((bootstrap-file
  57        (expand-file-name "straight/repos/straight.el/bootstrap.el" straight-base-dir))
  58       (bootstrap-version 6))
  59   (unless (file-exists-p bootstrap-file)
  60     (with-current-buffer
  61         (url-retrieve-synchronously
  62          "https://raw.githubusercontent.com/radian-software/straight.el/develop/install.el"
  63          'silent 'inhibit-cookies)
  64       (goto-char (point-max))
  65       (eval-print-last-sexp)))
  66   (load bootstrap-file nil 'nomessage))
  67 #+END_SRC
  68 ** package repositories and package manager
  69 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
  70 (straight-use-package 'use-package)
  71 (setq straight-use-package-by-default t)
  72 (setq use-package-verbose (not (bound-and-true-p byte-compile-current-file)))
  73 (require 'gnutls)
  74 (add-to-list 'gnutls-trustfiles "/etc/ssl/ca-global/ca-certificates.crt")
  75 #+END_SRC
  76 ** Paradox
  77 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
  78 (use-package paradox
  79   ;:ensure paradox
  80   :commands (paradox-upgrade-packages paradox-list-packages)
  81   :config
  82   (setq paradox-execute-asynchronously t)
  83   (setq paradox-github-token t) ; I don't want to be prompted about this integration
  84   )
  85 #+END_SRC
  86 * Disable custom-vars
  87 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
  88 ;; Set the custom file to /dev/null and don't bother to load it
  89 (setq custom-file "/dev/null")
  90 #+END_SRC
  91 * Misc functions
  92 ** with-library
  93 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
  94 ;; From http://www.emacswiki.org/emacs/LoadingLispFiles
  95 ;; execute conditional code when loading libraries
  96 ; (defmacro with-library (symbol &rest body)
  97 ;   `(when (require ,symbol nil t)
  98 ;     ,@body))
  99 ; (put 'with-library 'lisp-indent-function 1)
 100 #+END_SRC
 101
 102 * Variables
 103 ** Safe Local Variables
 104 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 105 (setq safe-local-variable-values
 106       (quote ((auto-save-default)
 107               (make-backup-files)
 108               (cperl-indent-level . 4)
 109               (indent-level . 4)
 110               (indent-tabs-mode . f)
 111               (vcl-indent-level . 4)
 112               )))
 113 #+END_SRC
 114 * Memory
 115 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 116 (setq global-mark-ring-max 128
 117       mark-ring-max 128
 118       kill-ring-max 128)
 119
 120 (defun don/minibuffer-setup-hook ()
 121   (setq gc-cons-threshold most-positive-fixnum))
 122
 123 (defun don/minibuffer-exit-hook ()
 124   (setq gc-cons-threshold 1048576))
 125
 126 (add-hook 'minibuffer-setup-hook #'don/minibuffer-setup-hook)
 127 (add-hook 'minibuffer-exit-hook #'don/minibuffer-exit-hook)
 128 #+END_SRC
 129 * Modules
 130 ** Tree sitter
 131 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 132 (use-package tree-sitter
 133   :defer t
 134   :config
 135   (global-tree-sitter-mode)
 136   )
 137 (use-package tree-sitter-langs
 138   :ensure t
 139   :defer 1
 140   :after tree-sitter
 141 ;   :config
 142 ;   (defun dla/python-function-at-point ()
 143 ;     "Return a list of function arguments
 144 ;
 145 ; Borrowed from https://xenodium.com/emacs-generate-a-swift-initializer/
 146 ; "
 147 ;   (interactive)
 148 ;   (cl-assert (seq-contains-p local-minor-modes 'tree-sitter-mode) "tree-sitter-mode not enabled")
 149 ;   (let* ((node (tree-sitter-node-at-point 'function_definition)
 150 ;                )
 151 ;          (args)
 152 ;          (arg)
 153 ;          (ret))
 154 ;     (unless node
 155 ;       (error "Not in function"))
 156 ;     (mapc
 157 ;      (lambda (item)
 158 ;        (cond ((eq 'func_name
 159 ;                   (car item))
 160 ;               ; (when arg
 161 ;               ;   (setq args (append args (list arg)))
 162 ;               ;   )
 163 ;               (setq arg (list (cons 'function (tsc-node-text
 164 ;                                            (cdr item))))))
 165 ;              ((eq 'ident
 166 ;                   (car item))
 167 ;               (setq arg (map-insert arg 'ident (tsc-node-text
 168 ;                                                (cdr item)))))
 169 ;              ((eq 'ident_type
 170 ;                   (car item))
 171 ;               (setq arg (map-insert arg 'ident_type (tsc-node-text
 172 ;                                                (cdr item)))))
 173 ;              ((eq 'ret_type
 174 ;                   (car item))
 175 ;               (setq arg (map-insert arg 'ret_type (tsc-node-text
 176 ;                                                (cdr item)))))
 177 ;              ))
 178 ;      (tsc-query-captures
 179 ;       (tsc-make-query tree-sitter-language
 180 ;                       "(function_definition (identifier) @func_name (parameters [(identifier) @ident (typed_parameter (identifier) @ident (type) @ident_type)]) (type)? @ret_type)")
 181 ;       (tree-sitter-node-at-point 'function_definition) nil))
 182 ;     (when arg
 183 ;       (setq args (append args (list arg))))
 184 ;     args))
 185
 186 )
 187 #+END_SRC
 188 ** Spacemacs theme
 189 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 190 (use-package spacemacs-theme
 191   :config
 192   (load-theme 'spacemacs-dark t)
 193   )
 194 #+END_SRC
 195 ** Hippie Expand
 196 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 197 (use-package hippie-exp
 198   :bind* (("M-<SPC>" . hippie-expand))
 199   )
 200 #+END_SRC
 201 ** Flyspell 🐝
 202 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 203 (use-package flyspell
 204   ; :delight flyspell-mode 🐝
 205   :config
 206   (setq flyspell-mode-line-string " 🐝")
 207   (add-hook 'text-mode-hook 'turn-on-flyspell)
 208   (add-hook 'c-mode-common-hook 'flyspell-prog-mode)
 209   (add-hook 'cperl-mode-hook 'flyspell-prog-mode)
 210   (add-hook 'tcl-mode-hook 'flyspell-prog-mode)
 211   :init
 212   (setq ispell-program-name "ispell")
 213   )
 214 #+END_SRC
 215
 216 ** Flycheck
 217 #+begin_src emacs-lisp :tangle yes
 218 (use-package flycheck
 219   :delight 🦋
 220   :if (version<= "24.4" emacs-version)
 221   :commands flycheck-mode
 222   :hook ((prog-mode . flycheck-mode)
 223          )
 224 )
 225 ;; Other pkgs
 226 (use-package flycheck-tip
 227   :commands 'flycheck-tip-cycle
 228   :after flycheck
 229   :bind (:map flycheck-mode-map
 230               ("C-c C-n" . flycheck-tip-cycle)))
 231
 232 (use-package flycheck-package)
 233
 234 (use-package flycheck-checkpatch
 235   :config (flycheck-checkpatch-setup)
 236   :config (setq flycheck-checkers (delete 'checkpatch
 237   flycheck-checkers))
 238   :config (add-to-list 'flycheck-checkers 'checkpatch t))
 239 #+end_src
 240
 241 ** Flymake
 242 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 243   (use-package flymake
 244     :delight "Φ")
 245 #+END_SRC
 246
 247 ** Winnermode
 248 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 249   (winner-mode 1)
 250 #+END_SRC
 251 ** Eyebrowse
 252
 253 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 254   (use-package eyebrowse
 255     :ensure t
 256     :delight eyebrowse-mode
 257     :init (setq eyebrowse-keymap-prefix (kbd "C-c e"))
 258     :config (progn
 259               (setq eyebrowse-wrap-around t)
 260               (eyebrowse-mode t)
 261
 262               (defun my/eyebrowse-new-window-config ()
 263                 (interactive)
 264                 (let ((done nil))
 265                   (dotimes (i 10)
 266                     ;; start at 1 run till 0
 267                     (let ((j (mod (+ i 1) 10)))
 268                       (when (and (not done)
 269                                  (not (eyebrowse--window-config-present-p j)))
 270                         (eyebrowse-switch-to-window-config j)
 271                         (call-interactively 'eyebrowse-rename-window-config2 j)
 272                         (setq done t)
 273                         ))
 274                     )))
 275
 276               ;; I don't use latex-preview-pane
 277               ;; (require 'latex-preview-pane)
 278               ;; (defun my/close-latex-preview-pane-before-eyebrowse-switch ()
 279               ;;   ;; latex-preview-pane uses window-parameters which are
 280               ;;   ;; not preserved by eyebrowse, so we close the preview
 281               ;;   ;; pane before switching, it will be regenerated when we
 282               ;;   ;; edit the TeX file.
 283               ;;   (when (lpp/window-containing-preview)
 284               ;;     (delete-window (lpp/window-containing-preview))))
 285
 286               ;; (add-to-list 'eyebrowse-pre-window-switch-hook
 287               ;;              #'my/close-latex-preview-pane-before-eyebrowse-switch)
 288
 289               ;; (my/set-menu-key "["  #'my/eyebrowse-new-window-config)
 290               ;; (my/set-menu-key ";"  #'eyebrowse-prev-window-config)
 291               ;; (my/set-menu-key "'"  #'eyebrowse-next-window-config)
 292               ;; (my/set-menu-key "]"  #'eyebrowse-close-window-config)
 293               ;; (my/set-menu-key "\\" #'eyebrowse-rename-window-config)
 294               )
 295     )
 296 #+END_SRC
 297
 298 ** Window handling
 299
 300 *** Splitting
 301 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 302   (defun my/vsplit-last-buffer ()
 303     "Split the window vertically and display the previous buffer."
 304     (interactive)
 305     (split-window-vertically)
 306     (other-window 1 nil)
 307     (switch-to-next-buffer))
 308
 309   (defun my/hsplit-last-buffer ()
 310     "Split the window horizontally and display the previous buffer."
 311     (interactive)
 312     (split-window-horizontally)
 313     (other-window 1 nil)
 314     (switch-to-next-buffer))
 315
 316   (bind-key "C-x 2" 'my/vsplit-last-buffer)
 317   (bind-key "C-x 3" 'my/hsplit-last-buffer)
 318
 319   (setq split-width-threshold  100)
 320   (setq split-height-threshold 60)
 321
 322   (defun my/split-window-prefer-vertically (window)
 323     "If there's only one window (excluding any possibly active
 324            minibuffer), then split the current window horizontally."
 325     (if (and (one-window-p t)
 326              (not (active-minibuffer-window))
 327              ( < (frame-width) (frame-height))
 328              )
 329         (let ((split-width-threshold nil))
 330           (split-window-sensibly window))
 331       (split-window-sensibly window)))
 332
 333   (setq split-window-preferred-function #'my/split-window-prefer-vertically)
 334   (setq window-combination-resize t)
 335 #+END_SRC
 336
 337 *** Compilation window
 338
 339 If there is no compilation window, open one at the bottom, spanning
 340 the complete width of the frame. Otherwise, reuse existing window. In
 341 the former case, if there was no error the window closes
 342 automatically.
 343
 344 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 345   (add-to-list 'display-buffer-alist
 346                `(,(rx bos "*compilation*" eos)
 347                  (display-buffer-reuse-window
 348                   display-buffer-in-side-window)
 349                  (reusable-frames . visible)
 350                  (side            . bottom)
 351                  (window-height   . 0.4)))
 352 #+END_SRC
 353
 354 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 355   (defun my/compilation-exit-autoclose (status code msg)
 356     ;; If M-x compile exists with a 0
 357     (when (and (eq status 'exit) (zerop code))
 358       ;; and delete the *compilation* window
 359       (let ((compilation-window (get-buffer-window (get-buffer "*compilation*"))))
 360         (when (and (not (window-at-side-p compilation-window 'top))
 361                    (window-at-side-p compilation-window 'left)
 362                    (window-at-side-p compilation-window 'right))
 363           (delete-window compilation-window))))
 364     ;; Always return the anticipated result of compilation-exit-message-function
 365     (cons msg code))
 366
 367   ;; Specify my function (maybe I should have done a lambda function)
 368   (setq compilation-exit-message-function #'my/compilation-exit-autoclose)
 369 #+END_SRC
 370
 371 If you change the variable ~compilation-scroll-output~ to a ~non-nil~
 372 value, the compilation buffer scrolls automatically to follow the
 373 output. If the value is ~first-error~, scrolling stops when the first
 374 error appears, leaving point at that error. For any other non-nil
 375 value, scrolling continues until there is no more output.
 376
 377 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 378   (setq compilation-scroll-output 'first-error)
 379 #+END_SRC
 380
 381 ** Mode line cleaning
 382 *** Delight
 383 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 384 (use-package delight
 385   :demand t)
 386 #+END_SRC
 387
 388 ** Jumping
 389 *** Avy
 390 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 391   (use-package avy
 392     :if (>= emacs-major-version 25)
 393     :ensure t
 394     :bind (("C-c C-<SPC>" . avy-goto-word-or-subword-1)
 395            ("C-c j j" . avy-goto-word-or-subword-1)
 396            ("M-g g" . avy-goto-line))
 397     :config (progn (setq avy-background t))
 398     )
 399 #+END_SRC
 400 *** Ace-link (jumping to links)
 401 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 402   (use-package ace-link
 403     :ensure t
 404     ; bind o in most modes
 405     :config (ace-link-setup-default))
 406 #+END_SRC
 407 *** Jumping through edit points (goto-chg)
 408 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 409   (use-package goto-chg
 410     :ensure t
 411     :bind (("C-c j ," . goto-last-change)
 412            ("C-c j ." . goto-last-change-reverse))
 413     )
 414 #+END_SRC
 415 *** Jumping to bookmarks (visible bookmarks, bm)
 416 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 417   (use-package bm
 418     :ensure t
 419     :bind (("C-c j b ." . bm-next)
 420            ("C-c j b ," . bm-previous)
 421            ("C-c j b SPC" . bm-toggle)))
 422 #+END_SRC
 423
 424 ** Snippets
 425 *** Yasnippet
 426 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 427 (use-package yasnippet
 428   :ensure t
 429   :delight yas-minor-mode
 430   :config (progn
 431             (yas-global-mode)
 432             (setq yas-verbosity 1)
 433             (define-key yas-minor-mode-map (kbd "<tab>") nil)
 434             (define-key yas-minor-mode-map (kbd "TAB") nil)
 435             (define-key yas-minor-mode-map (kbd "<backtab>") nil)
 436             (setq yas-snippet-dirs '("~/lib/emacs_el/snippets/"
 437                                      "~/lib/emacs_el/yasnippet-snippets/snippets/"))
 438             (add-to-list 'hippie-expand-try-functions-list
 439                              'yas-hippie-try-expand)
 440             (yas-reload-all)
 441             )
 442   )
 443 #+END_SRC
 444 *** Auto-YASnippet
 445 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 446 (use-package auto-yasnippet
 447   :ensure t
 448   :bind (("H-w" . aya-create)
 449          ("H-y" . aya-expand)
 450          )
 451   )
 452 #+END_SRC
 453 ** Treemacs: Tree file viewer
 454 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 455 ;; Provides workspaces with file browsing (tree file viewer)
 456 ;; and project management when coupled with `projectile`.
 457
 458 ; (use-package treemacs
 459 ;   :ensure t
 460 ;   :defer t
 461 ;   :config
 462 ;   (setq treemacs-no-png-images t
 463 ;         treemacs-width 24)
 464 ;   :bind ("C-c t" . treemacs))
 465 #+END_SRC
 466 ** LSP mode
 467 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 468 (use-package lsp-mode
 469   :defer t
 470   :commands (lsp lsp-deferred)
 471   :init (setq lsp-keymap-prefix "C-c l")
 472   (defun my/orderless-dispatch-flex-first (_pattern index _total)
 473     (and (eq index 0) 'orderless-flex))
 474
 475   (defun my/lsp-mode-setup-completion ()
 476     (setf (alist-get 'styles (alist-get 'lsp-capf completion-category-defaults))
 477           '(orderless)))
 478
 479   ;; Optionally configure the first word as flex filtered.
 480   (add-hook 'orderless-style-dispatchers #'my/orderless-dispatch-flex-first nil 'local)
 481
 482   ;; Optionally configure the cape-capf-buster.
 483   ; (setq-local completion-at-point-functions (list (cape-capf-buster #'lsp-completion-at-point)))
 484
 485   :hook (python-mode . lsp-deferred)
 486         (cperl-mode . lsp-deferred)
 487   (lsp-completion-mode . my/lsp-mode-setup-completion)
 488   :custom
 489   (lsp-completion-provider :none) ;; we use Corfu!
 490   :config
 491    (add-to-list 'lsp-file-watch-ignored-directories "[/\\\\]venv\\'")
 492 )
 493 #+END_SRC
 494 ** LSP mode
 495 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 496 ;; provides visual help in the buffer
 497 ;; for example definitions on hover.
 498 ;; the `imenu` lets me browse definitions quickly.
 499 (use-package lsp-ui
 500   :defer t
 501   :after lsp-mode
 502   :config
 503   (setq lsp-ui-sideline-enable t
 504             lsp-ui-doc-delay 2)
 505   :hook (lsp-mode . lsp-ui-mode)
 506   :bind (:map lsp-ui-mode-map
 507               ("c-c i" . lsp-ui-imenu)))
 508 #+END_SRC
 509 *** LSP Pyright -- Python language server
 510 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 511 ;; language server for python
 512 ;; read the docs for the different variables set in the config.
 513 (use-package lsp-pyright
 514   :defer t
 515   :config
 516   (setq lsp-clients-python-library-directories '("/usr/"))
 517   (setq lsp-pyright-disable-language-service nil
 518         lsp-pyright-disable-organize-imports nil
 519         lsp-pyright-auto-import-completions t
 520         lsp-pyright-use-library-code-for-types t
 521         lsp-pyright-venv-path "venv")
 522   :hook ((python-mode . (lambda ()
 523                           (require 'lsp-pyright) (lsp-deferred)))))
 524 #+END_SRC
 525 ** Corfu
 526 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 527 (use-package corfu
 528   ;; Optional customizations
 529   :custom
 530   (corfu-cycle t)                ;; Enable cycling for `corfu-next/previous'
 531   (corfu-auto t)                 ;; Enable auto completion
 532   (corfu-separator ?\s)          ;; Orderless field separator
 533   (corfu-quit-at-boundary t)
 534   (corfu-quit-no-match 'separator)
 535   (corfu-preview-current nil)    ;; Disable current candidate preview
 536   (corfu-preselect 'prompt)      ;; Preselect the prompt
 537   (corfu-on-exact-match nil)     ;; Configure handling of exact matches
 538   (corfu-scroll-margin 5)        ;; Use scroll margin
 539
 540   :bind (
 541          :map corfu-map
 542               ("M-m" . corfu-move-to-minibuffer)
 543               )
 544   :init
 545   (global-corfu-mode)
 546   (setq completion-cycle-threshold 3)
 547   (setq tab-always-indent 'complete)
 548   :config
 549   (defun corfu-move-to-minibuffer ()
 550     (interactive)
 551     (when completion-in-region--data
 552       (let ((completion-extra-properties corfu--extra)
 553             completion-cycle-threshold completion-cycling)
 554         (apply #'consult-completion-in-region completion-in-region--data))))
 555   (add-to-list 'corfu-continue-commands #'corfu-move-to-minibuffer)
 556   )
 557 #+END_SRC
 558 ** Dabbrv
 559 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 560 (use-package dabbrev
 561   :ensure t
 562   ;; Swap M-/ and C-M-/
 563   :bind (("M-/" . dabbrev-completion)
 564          ("C-M-/" . dabbrev-expand))
 565   ;; Other useful Dabbrev configurations.
 566   :custom
 567   (dabbrev-ignored-buffer-regexps '("\\.\\(?:pdf\\|jpe?g\\|png\\)\\'")))
 568 #+END_SRC
 569 ** Tinyprocmail
 570
 571 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 572 ;; load tinyprocmail
 573 (use-package tinyprocmail
 574   :straight (tinytools :type git :type git :host github :repo "jaalto/project--emacs-tiny-tools")
 575   ; :load-path "~/lib/emacs_el/tiny-tools/lisp/tiny"
 576   :mode (".procmailrc" . turn-on-tinyprocmail-mode)
 577   )
 578 #+END_SRC
 579
 580 ** Magit
 581 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 582 (use-package magit
 583   :defer t
 584   :bind (("C-x g" . magit-status)
 585          ("C-x C-g" . magit-status))
 586   :config
 587   ;; refine diffs always (hilight words)
 588   (setq magit-diff-refine-hunk nil)
 589   )
 590 (use-package magit-annex
 591   :defer t
 592   :after magit
 593   )
 594 (use-package magit-vcsh
 595   :defer t
 596   :after magit
 597   )
 598 #+END_SRC
 599
 600 *** Forge (github/gitlab)
 601 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 602 (use-package forge
 603   :defer t
 604   :after magit
 605   )
 606 #+END_SRC
 607
 608 ** Perl
 609 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 610 (use-package cperl-mode
 611   :mode ("\\.pl'" . cperl-mode)
 612   ("\\.perl5\\'" . cperl-mode)
 613   ("\\.perl\\'" . cperl-mode)
 614   ("\\.miniperl\\'" . cperl-mode)
 615   ("\\.\\([Pp][Llm]\\|al\\)\\'" . cperl-mode)
 616     ;; use c-mode for perl .xs files
 617   ("\\.xs\\'" . c-mode)
 618   :config
 619        (setq cperl-hairy t
 620           cperl-indent-level 4
 621           cperl-auto-newline nil
 622           cperl-auto-newline-after-colon nil
 623           cperl-continued-statement-offset 4
 624           cperl-brace-offset -1
 625           cperl-continued-brace-offset 0
 626           cperl-label-offset -4
 627           cperl-highlight-variables-indiscriminately t
 628           cperl-electric-lbrace-space nil
 629           cperl-indent-parens-as-block nil
 630           cperl-close-paren-offset -1
 631           cperl-tab-always-indent t)
 632     (setq cperl-lazy-help-time nil)
 633     ;;(add-hook 'cperl-mode-hook (lambda () (cperl-set-style "PerlStyle")))
 634 )
 635 #+END_SRC
 636
 637 ** Markdown mode
 638 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 639 (use-package markdown-mode
 640   :defer t
 641   :mode (("\\.md\\'" . markdown-mode)
 642          ("\\.mdwn\\'" . markdown-mode)
 643          ("README\\.md\\'" . gfm-mode)
 644          )
 645   :config
 646   (setq markdown-enable-math t)
 647   (setq markdown-follow-wiki-link-on-enter nil)
 648   (bind-key "M-." #'markdown-jump markdown-mode-map)
 649   (add-hook 'markdown-mode-hook #'flyspell-mode)
 650   (add-hook 'markdown-mode-hook #'outline-minor-mode)
 651   (bind-key "C-<tab>" #'outline-cycle markdown-mode-map)
 652 )
 653
 654 #+END_SRC
 655 ** SQL mode
 656 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 657 ; load sql-indent when sql is loaded
 658 (use-package sql-indent
 659   :after sql
 660   :hook sql-mode
 661   )
 662 (use-package sql
 663   :commands (sql-mode)
 664   :mode (("\\.sql\\'" . sql-mode))
 665   )
 666 #+END_SRC
 667 ** Ediff
 668 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 669 (use-package ediff
 670   :commands ediff ediff3
 671   :config
 672   ;; ediff configuration
 673   ;; don't use the multi-window configuration
 674   (setq ediff-window-setup-function 'ediff-setup-windows-plain)
 675 )
 676 #+END_SRC
 677 ** Do the Right Thing Indenting
 678 Attempts to automatically identify the right indentation for a file
 679 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 680 (use-package dtrt-indent
 681 )
 682 #+END_SRC
 683 ** VCL --editing varnish configuration files
 684 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 685 (use-package vcl-mode
 686   :mode "\\.vcl\\'"
 687   )
 688 #+END_SRC
 689 ** Vertico
 690 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 691 (use-package vertico
 692   :demand t
 693   :config
 694   (vertico-mode)
 695   ; (define-key vertico-map "\r" #'vertico-directory-enter)
 696   ; (define-key vertico-map "\d" #'vertico-directory-delete-char)
 697   ; (define-key vertico-map "\M-\d" #'vertico-directory-delete-word)
 698   ; (add-hook 'rfn-eshadow-update-overlay-hook #'vertico-directory-tidy)
 699
 700   ;; Different scroll margin
 701   ;; (setq vertico-scroll-margin 0)
 702
 703   ;; Show more candidates
 704   ;; (setq vertico-count 20)
 705
 706   ;; Grow and shrink the Vertico minibuffer
 707   ;; (setq vertico-resize t)
 708
 709   ;; Optionally enable cycling for `vertico-next' and `vertico-previous'.
 710   ;; (setq vertico-cycle t)
 711   :custom
 712   (vertico-grid-separator "       ")
 713   (vertico-grid-lookahead 50)
 714 )
 715 (use-package vertico-multiform
 716   :straight nil
 717   :load-path "~/var/emacs/straight/build/vertico/extensions/"
 718   :after vertico
 719   :config
 720   (setq vertico-multiform-categories
 721      '((file reverse)
 722        (consult-grep buffer)
 723        (consult-location)
 724        (imenu buffer)
 725        (library reverse indexed)
 726        (org-roam-node reverse indexed)
 727        ; (t reverse)
 728        )
 729      )
 730   (setq vertico-multiform-commands
 731         '(("flyspell-correct-*" grid reverse)
 732           (org-refile grid reverse indexed)
 733           (consult-yank-pop indexed)
 734           (consult-flycheck)
 735           (consult-lsp-diagnostics)
 736           )
 737         )
 738   (vertico-multiform-mode)
 739   )
 740
 741 (use-package vertico-grid
 742   :straight nil
 743   :after vertico
 744   )
 745 (use-package vertico-reverse
 746   :straight nil
 747   :after vertico
 748   )
 749 (use-package vertico-indexed
 750   :straight nil
 751   :after vertico
 752   )
 753 (use-package vertico-buffer
 754   :straight nil
 755   :after vertico
 756   )
 757
 758
 759 ;; Persist history over Emacs restarts. Vertico sorts by history position.
 760 (use-package savehist
 761   :demand t
 762   :config
 763   (savehist-mode))
 764
 765 #+END_SRC
 766 ** Orderless: advanced completion style
 767 #+begin_src emacs-lisp
 768 (use-package orderless
 769   :init
 770   ;; Configure a custom style dispatcher (see the Consult wiki)
 771   ;; (setq orderless-style-dispatchers '(+orderless-dispatch)
 772   ;;       orderless-component-separator #'orderless-escapable-split-on-space)
 773   (setq completion-styles '(orderless basic)
 774         completion-category-defaults nil
 775         completion-category-overrides '((file (styles partial-completion)))))
 776 #+end_src
 777 ** Marginalia: Rich annotations in the minibuffer
 778 #+begin_src emacs-lisp
 779 (use-package marginalia
 780   :demand t
 781   :bind (:map minibuffer-local-map
 782          ("M-A" . marginalia-cycle))
 783   :config
 784   (marginalia-mode)
 785   )
 786 #+end_src
 787 ** Embark: Minibuffer actions and context menu
 788 #+begin_src emacs-lisp
 789 (use-package embark
 790   :bind
 791   (("C-." . embark-act)         ;; pick some comfortable binding
 792    ("C-;" . embark-dwim)        ;; good alternative: M-.
 793    ("C-h B" . embark-bindings)) ;; alternative for `describe-bindings'
 794
 795   :init
 796
 797   ;; Optionally replace the key help with a completing-read interface
 798   (setq prefix-help-command #'embark-prefix-help-command)
 799
 800   :config
 801
 802   ;; Hide the mode line of the Embark live/completions buffers
 803   (add-to-list 'display-buffer-alist
 804                '("\\`\\*Embark Collect \\(Live\\|Completions\\)\\*"
 805                  nil
 806                  (window-parameters (mode-line-format . none)))))
 807
 808 (use-package embark-consult
 809   :hook
 810   (embark-collect-mode . consult-preview-at-point-mode))
 811 #+end_src
 812 ** which-key (show possible completions of a key combination)
 813 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 814 (use-package which-key
 815   :demand t
 816   )
 817 #+END_SRC
 818 ** Consult
 819 #+begin_src emacs-lisp
 820 (use-package consult
 821   ;; Replace bindings. Lazily loaded due by `use-package'.
 822   :bind (;; C-c bindings in `mode-specific-map'
 823          ("C-c M-x" . consult-mode-command)
 824          ("C-c h" . consult-history)
 825          ("C-c k" . consult-kmacro)
 826          ("C-c m" . consult-man)
 827          ("C-c i" . consult-info)
 828          ([remap Info-search] . consult-info)
 829          ;; C-x bindings in `ctl-x-map'
 830          ("C-x M-:" . consult-complex-command)     ;; orig. repeat-complex-command
 831          ("C-x b" . consult-buffer)                ;; orig. switch-to-buffer
 832          ("C-x 4 b" . consult-buffer-other-window) ;; orig. switch-to-buffer-other-window
 833          ("C-x 5 b" . consult-buffer-other-frame)  ;; orig. switch-to-buffer-other-frame
 834          ("C-x r b" . consult-bookmark)            ;; orig. bookmark-jump
 835          ("C-x p b" . consult-project-buffer)      ;; orig. project-switch-to-buffer
 836          ;; Custom M-# bindings for fast register access
 837          ("M-#" . consult-register-load)
 838          ("M-'" . consult-register-store)          ;; orig. abbrev-prefix-mark (unrelated)
 839          ("C-M-#" . consult-register)
 840          ;; Other custom bindings
 841          ("M-y" . consult-yank-pop)                ;; orig. yank-pop
 842          ;; M-g bindings in `goto-map'
 843          ("M-g e" . consult-compile-error)
 844          ("M-g f" . consult-flymake)               ;; Alternative: consult-flycheck
 845          ("M-g g" . consult-goto-line)             ;; orig. goto-line
 846          ("M-g M-g" . consult-goto-line)           ;; orig. goto-line
 847          ("M-g o" . consult-outline)               ;; Alternative: consult-org-heading
 848          ("M-g m" . consult-mark)
 849          ("M-g k" . consult-global-mark)
 850          ("M-g i" . consult-imenu)
 851          ("M-g I" . consult-imenu-multi)
 852          ;; M-s bindings in `search-map'
 853          ("M-s d" . consult-find)
 854          ("M-s D" . consult-locate)
 855          ("M-s g" . consult-grep)
 856          ("M-s G" . consult-git-grep)
 857          ("M-s r" . consult-ripgrep)
 858          ("M-s l" . consult-line)
 859          ("M-s L" . consult-line-multi)
 860          ("M-s k" . consult-keep-lines)
 861          ("M-s u" . consult-focus-lines)
 862          ;; Isearch integration
 863          ("M-s e" . consult-isearch-history)
 864          :map isearch-mode-map
 865          ("M-e" . consult-isearch-history)         ;; orig. isearch-edit-string
 866          ("M-s e" . consult-isearch-history)       ;; orig. isearch-edit-string
 867          ("M-s l" . consult-line)                  ;; needed by consult-line to detect isearch
 868          ("M-s L" . consult-line-multi)            ;; needed by consult-line to detect isearch
 869          ;; Minibuffer history
 870          :map minibuffer-local-map
 871          ("M-s" . consult-history)                 ;; orig. next-matching-history-element
 872          ("M-r" . consult-history))                ;; orig. previous-matching-history-element
 873
 874   ;; Enable automatic preview at point in the *Completions* buffer. This is
 875   ;; relevant when you use the default completion UI.
 876   :hook (completion-list-mode . consult-preview-at-point-mode)
 877
 878   :commands (consult-xref)
 879
 880   ;; The :init configuration is always executed (Not lazy)
 881   :init
 882
 883   ;; Optionally configure the register formatting. This improves the register
 884   ;; preview for `consult-register', `consult-register-load',
 885   ;; `consult-register-store' and the Emacs built-ins.
 886   (setq register-preview-delay 0.5
 887         register-preview-function #'consult-register-format)
 888
 889   ;; Optionally tweak the register preview window.
 890   ;; This adds thin lines, sorting and hides the mode line of the window.
 891   (advice-add #'register-preview :override #'consult-register-window)
 892
 893   ;; Use Consult to select xref locations with preview
 894   (setq xref-show-xrefs-function #'consult-xref
 895         xref-show-definitions-function #'consult-xref)
 896
 897   ;; Configure other variables and modes in the :config section,
 898   ;; after lazily loading the package.
 899   :config
 900   ;; Optionally configure preview. The default value
 901   ;; is 'any, such that any key triggers the preview.
 902   ;; (setq consult-preview-key 'any)
 903   ;; (setq consult-preview-key "M-.")
 904   ;; (setq consult-preview-key '("S-<down>" "S-<up>"))
 905   ;; For some commands and buffer sources it is useful to configure the
 906   ;; :preview-key on a per-command basis using the `consult-customize' macro.
 907   (consult-customize
 908    consult-theme :preview-key '(:debounce 0.2 any)
 909    consult-ripgrep consult-git-grep consult-grep
 910    consult-bookmark consult-recent-file consult-xref
 911    consult--source-bookmark consult--source-file-register
 912    consult--source-recent-file consult--source-project-recent-file
 913    ;; :preview-key "M-."
 914    :preview-key '(:debounce 0.4 any))
 915
 916   ;; Optionally configure the narrowing key.
 917   ;; Both < and C-+ work reasonably well.
 918   (setq consult-narrow-key "<") ;; "C-+"
 919
 920   ;; Optionally make narrowing help available in the minibuffer.
 921   ;; You may want to use `embark-prefix-help-command' or which-key instead.
 922   ;; (define-key consult-narrow-map (vconcat consult-narrow-key "?") #'consult-narrow-help)
 923
 924   ;; By default `consult-project-function' uses `project-root' from project.el.
 925   ;; Optionally configure a different project root function.
 926   ;;;; 1. project.el (the default)
 927   ;; (setq consult-project-function #'consult--default-project--function)
 928   ;;;; 2. vc.el (vc-root-dir)
 929   ;; (setq consult-project-function (lambda (_) (vc-root-dir)))
 930   ;;;; 3. locate-dominating-file
 931   ;; (setq consult-project-function (lambda (_) (locate-dominating-file "." ".git")))
 932   ;;;; 4. projectile.el (projectile-project-root)
 933   ;; (autoload 'projectile-project-root "projectile")
 934   ;; (setq consult-project-function (lambda (_) (projectile-project-root)))
 935   ;;;; 5. No project support
 936   ;; (setq consult-project-function nil)
 937 )
 938 #+end_src
 939 ** Projectile -- Project management
 940 #+begin_src emacs-lisp
 941 (use-package projectile
 942   :bind (("<f5>" . projectile-compile-project)
 943          ("<f6>" . next-error))
 944   :config (projectile-global-mode))
 945 #+end_src
 946
 947 ** Zap to char
 948 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 949 (use-package avy-zap
 950   :bind ("M-z" . avy-zap-up-to-char-dwim))
 951 #+END_SRC
 952 ** Hydra
 953 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 954 (use-package hydra
 955   :bind (("C-c 2" . my/hydra-orgmodes/body)
 956          ("C-c @" . my/hydra-orgmodes/body)
 957          ("C-c #" . my/hydra-outline/body)
 958          ("C-c 3" . my/hydra-outline/body)
 959          )
 960   :config
 961   (defhydra my/hydra-orgmodes (:color blue :hint nil)
 962   "
 963 _n_: notes _c_: chaim _w_: wildman _o_: ool
 964 _u_: uddin _s_: steve _r_: refile  _f_: fh
 965 _p_: read papers      _R_: paper notes
 966 _h_: hpcbio
 967 _q_: quit
 968 _z_: quit
 969 "
 970   ("n" (find-file "~/projects/org-notes/notes.org"))
 971   ("c" (find-file "~/projects/org-notes/chaim.org"))
 972   ("w" (find-file "~/projects/org-notes/wildman.org"))
 973   ("u" (find-file "~/projects/org-notes/uddin.org"))
 974   ("o" (find-file "~/projects/org-notes/ool.org"))
 975   ("f" (find-file "~/projects/org-notes/fh.org"))
 976   ("s" (find-file "~/projects/org-notes/sndservers.org"))
 977   ("r" (find-file my/org-refile-file))
 978   ("p" (find-file "~/projects/research/papers_to_read.org"))
 979   ("R" (find-file "~/projects/research/paper_notes.org"))
 980   ("h" (find-file "~/projects/org-notes/hpcbio.org"))
 981   ("q" nil "quit")
 982   ("z" nil "quit")
 983   )
 984
 985   ;; from https://github.com/abo-abo/hydra/wiki/Emacs
 986   (defhydra my/hydra-outline (:color pink :hint nil)
 987   "
 988 ^Hide^             ^Show^           ^Move
 989 ^^^^^^------------------------------------------------------
 990 _q_: sublevels     _a_: all         _u_: up
 991 _t_: body          _e_: entry       _n_: next visible
 992 _o_: other         _i_: children    _p_: previous visible
 993 _c_: entry         _k_: branches    _f_: forward same level
 994 _l_: leaves        _s_: subtree     _b_: backward same level
 995 _d_: subtree
 996
 997 "
 998   ;; Hide
 999   ("q" outline-hide-sublevels)    ; Hide everything but the top-level headings
1000   ("t" outline-hide-body)         ; Hide everything but headings (all body lines)
1001   ("o" outline-hide-other)        ; Hide other branches
1002   ("c" outline-hide-entry)        ; Hide this entry's body
1003   ("l" outline-hide-leaves)       ; Hide body lines in this entry and sub-entries
1004   ("d" outline-hide-subtree)      ; Hide everything in this entry and sub-entries
1005   ;; Show
1006   ("a" outline-show-all)          ; Show (expand) everything
1007   ("e" outline-show-entry)        ; Show this heading's body
1008   ("i" outline-show-children)     ; Show this heading's immediate child sub-headings
1009   ("k" outline-show-branches)     ; Show all sub-headings under this heading
1010   ("s" outline-show-subtree)      ; Show (expand) everything in this heading & below
1011   ;; Move
1012   ("u" outline-up-heading)                ; Up
1013   ("n" outline-next-visible-heading)      ; Next
1014   ("p" outline-previous-visible-heading)  ; Previous
1015   ("f" outline-forward-same-level)        ; Forward - same level
1016   ("b" outline-backward-same-level)       ; Backward - same level
1017   ("z" nil "leave"))
1018 )
1019 #+END_SRC
1020
1021 ** Tramp
1022 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1023 (use-package tramp
1024   :demand t
1025   ; use the built in tramp
1026   :straight nil
1027   :config
1028   (setq tramp-use-ssh-controlmaster-options nil)
1029   (add-to-list 'tramp-methods '("vcsh"
1030                                 (tramp-login-program "vcsh")
1031                                 (tramp-login-args
1032                                  (("enter")
1033                                   ("%h")))
1034                                 (tramp-remote-shell "/bin/sh")
1035                                 (tramp-remote-shell-args
1036                                  ("-c")))))
1037 #+END_SRC
1038 ** Reftex
1039 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1040 (use-package reftex
1041   :hook ((LaTeX-mode latex-mode) . reftex-mode)
1042   :config
1043   (setq-default reftex-default-bibliography
1044                   '("~/projects/research/references.bib"))
1045   (setq-default reftex-plug-into-AUCTeX t)
1046   )
1047 #+END_SRC
1048 ** BibTex
1049 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1050 (use-package bibtex
1051   :mode "\\.bib\\'"
1052   :config (setq bibtex-user-optional-fields
1053                 (quote (("annote" "Personal annotation (ignored)")
1054                         ("abstract" "")
1055                 ("pmid" "")
1056                 ("doi" ""))))
1057   )
1058
1059 #+END_SRC
1060 ** LaTeX
1061 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1062 (use-package tex
1063   :straight auctex
1064   :mode ("\\.tex\\'" . LaTeX-mode)
1065   :config
1066   ; (add-to-list 'TeX-style-path '"/home/don/lib/emacs_el/auctex/style")
1067   (add-hook 'LaTeX-mode-hook 'outline-minor-mode)   ; with AUCTeX LaTeX mode
1068   (add-hook 'latex-mode-hook 'outline-minor-mode)   ; with Emacs latex mode
1069
1070   ;; support fake section headers
1071   (setq TeX-outline-extra
1072         '(("%chapter" 1)
1073           ("%section" 2)
1074           ("%subsection" 3)
1075           ("%subsubsection" 4)
1076           ("%paragraph" 5)))
1077   ;; add font locking to the headers
1078   (font-lock-add-keywords
1079    'latex-mode
1080    '(("^%\\(chapter\\|\\(sub\\|subsub\\)?section\\|paragraph\\)"
1081       0 'font-lock-keyword-face t)
1082      ("^%chapter{\\(.*\\)}"       1 'font-latex-sectioning-1-face t)
1083      ("^%section{\\(.*\\)}"       1 'font-latex-sectioning-2-face t)
1084      ("^%subsection{\\(.*\\)}"    1 'font-latex-sectioning-3-face t)
1085      ("^%subsubsection{\\(.*\\)}" 1 'font-latex-sectioning-4-face t)
1086      ("^%paragraph{\\(.*\\)}"     1 'font-latex-sectioning-5-face t)))
1087
1088   ;; use smart quotes by default instead of `` and ''
1089   ;; taken from http://kieranhealy.org/esk/kjhealy.html
1090   (setq TeX-open-quote "“")
1091   (setq TeX-close-quote "”")
1092
1093   ;; (TeX-add-style-hook
1094   ;;  "latex"
1095   ;;  (lambda ()
1096   ;;    (TeX-add-symbols
1097   ;;     '("DLA" 1))))
1098   ;; (custom-set-variables
1099   ;;  '(font-latex-user-keyword-classes
1100   ;;    '(("fixme"
1101   ;;       ("DLA" "RZ")
1102   ;;       font-lock-function-name-face 2 (command 1 t))))
1103   ;; )
1104   (setq-default TeX-parse-self t)
1105   (setq-default TeX-auto-save t)
1106   (setq-default TeX-master nil)
1107   (add-to-list 'LaTeX-font-list
1108                '(?\C-a "\\alert{","}"))
1109   (eval-after-load
1110       "latex"
1111     '(TeX-add-style-hook
1112       "cleveref"
1113       (lambda ()
1114         (if (boundp 'reftex-ref-style-alist)
1115             (add-to-list
1116              'reftex-ref-style-alist
1117              '("Cleveref" "cleveref"
1118                (("\\cref" ?c) ("\\Cref" ?C) ("\\cpageref" ?d) ("\\Cpageref" ?D)))))
1119         (reftex-ref-style-activate "Cleveref")
1120         (TeX-add-symbols
1121          '("cref" TeX-arg-ref)
1122          '("Cref" TeX-arg-ref)
1123          '("cpageref" TeX-arg-ref)
1124          '("Cpageref" TeX-arg-ref)))))
1125   (eval-after-load
1126       "latex"
1127     '(add-to-list 'LaTeX-fill-excluded-macros
1128                   '("Sexpr")))
1129
1130   (setq font-latex-match-reference-keywords
1131         '(
1132           ("fref" "{")
1133           ("Fref" "{")
1134           ("citep" "{")
1135           ("citet" "{")
1136           ("acs" "{")
1137           ("acsp" "{")
1138           ("ac" "{")
1139           ("acp" "{")
1140           ("acl" "{")
1141           ("aclp" "{")
1142           ("acsu" "{")
1143           ("aclu" "{")
1144           ("acused" "{")
1145           ("DLA" "{")
1146           ("RZ" "{")
1147           ("OM" "{")
1148           ("DL" "{")
1149           ("fixme" "{"))
1150         )
1151   (setq font-latex-fontify-script nil)
1152   (setq font-latex-fontify-sectioning (quote color))
1153   (setq font-latex-script-display (quote (nil)))
1154 )
1155
1156 #+END_SRC
1157 ** ESS
1158 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1159 (use-package ess
1160   :commands R
1161   :mode ("\\.R\\'" . ess-r-mode)
1162   :bind (:map ess-mode-map
1163               ("C-c C-R" . dla/ess-region-remote-eval))
1164   :init
1165   (autoload 'ess-r-mode "ess-site" nil t)
1166   (autoload 'R "ess-site" nil t)
1167   :config
1168   ; actually load the rest of ess
1169   (require 'ess-site)
1170   (defun ess-change-directory (path)
1171     "Set the current working directory to PATH for both *R* and Emacs."
1172     (interactive "Directory to change to: ")
1173
1174     (when (file-exists-p path)
1175       (ess-command (concat "setwd(\"" path "\")\n"))
1176       ;; use file-name-as-directory to ensure it has trailing /
1177       (setq default-directory (file-name-as-directory path))))
1178   (add-hook 'ess-mode-hook 'flyspell-prog-mode)
1179   ;; outlining support for ess modes
1180   (add-hook
1181    'ess-mode-hook
1182    '(lambda ()
1183       (outline-minor-mode)
1184       (setq outline-regexp "\\(^#\\{4,5\\} \\)\\|\\(^[a-zA-Z0-9_\.]+ ?<- ?function\\)")
1185       (defun outline-level ()
1186         (cond ((looking-at "^##### ") 1)
1187               ((looking-at "^#### ") 2)
1188               ((looking-at "^[a-zA-Z0-9_\.]+ ?<- ?function(.*{") 3)
1189               (t 1000)))
1190       ))
1191   (defun dla/ess-region-remote-eval (start end)
1192     "Evaluate region in a remote ESS instance"
1193     (interactive "r")
1194     (shell-command-on-region start end "eval_r" (get-buffer-create "***essregionremoteeval***") nil nil nil)
1195     (kill-buffer "***essregionremoteeval***"))
1196   ;; Don't restore history or save workspace image
1197   '(inferior-R-args "--no-restore-history --no-save")
1198   )
1199 #+END_SRC
1200
1201 ** Rainbowmode
1202 From http://julien.danjou.info/projects/emacs-packages#rainbow-mode, this colorizes color strings
1203
1204 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1205 (use-package rainbow-mode
1206   :delight 🌈
1207   ;; add ess to the x major mode
1208   :config (add-to-list 'rainbow-x-colors-major-mode-list 'ESS[S])
1209   (add-to-list 'rainbow-x-colors-major-mode-list 'ESS[R])
1210 )
1211 #+END_SRC
1212
1213 ** YAML Mode
1214 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1215 (use-package yaml-mode
1216   ;; add ess to the x major mode
1217   :mode ("\\.\\(yaml|yml\\)\\'" . yaml-mode)
1218 )
1219 #+END_SRC
1220
1221 ** Polymode
1222 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1223 (use-package poly-noweb
1224   :after polymode
1225
1226   )
1227 (use-package poly-markdown
1228   :after polymode
1229   )
1230 (use-package poly-R
1231   :after (:all polymode poly-markdown poly-noweb)
1232   :mode ("\\.Snw" . poly-noweb+r-mode)
1233   :mode ("\\.Rnw" . poly-noweb+r-mode)
1234   :mode ("\\.Rmd" . poly-markdown+r-mode)
1235   )
1236 (use-package polymode
1237   :defer t
1238   )
1239
1240 #+END_SRC
1241
1242 ** Outlining
1243 *** outline minor mode
1244 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1245 (use-package outline
1246    :straight nil
1247    :delight
1248    :init
1249    (setq outline-minor-mode-prefix "C-c C-2")
1250    :config
1251    (global-set-key "\M-o" cm-map)
1252    ; Outline-minor-mode key map
1253 (define-prefix-command 'cm-map nil "Outline-")
1254 ; HIDE
1255 (define-key cm-map "q" 'outline-hide-sublevels)    ; Hide everything but the top-level headings
1256 (define-key cm-map "t" 'outline-hide-body)         ; Hide everything but headings (all body lines)
1257 (define-key cm-map "o" 'outline-hide-other)        ; Hide other branches
1258 (define-key cm-map "c" 'outline-hide-entry)        ; Hide this entry's body
1259 (define-key cm-map "l" 'outline-hide-leaves)       ; Hide body lines in this entry and sub-entries
1260 (define-key cm-map "d" 'outline-hide-subtree)      ; Hide everything in this entry and sub-entries
1261 ; SHOW
1262 (define-key cm-map "a" 'outline-show-all)          ; Show (expand) everything
1263 (define-key cm-map "e" 'outline-show-entry)        ; Show this heading's body
1264 (define-key cm-map "i" 'outline-show-children)     ; Show this heading's immediate child sub-headings
1265 (define-key cm-map "k" 'outline-show-branches)     ; Show all sub-headings under this heading
1266 (define-key cm-map "s" 'outline-show-subtree)      ; Show (expand) everything in this heading & below
1267 ; MOVE
1268 (define-key cm-map "u" 'outline-up-heading)                ; Up
1269 (define-key cm-map "n" 'outline-next-visible-heading)      ; Next
1270 (define-key cm-map "p" 'outline-previous-visible-heading)  ; Previous
1271 (define-key cm-map "f" 'outline-forward-same-level)        ; Forward - same level
1272 (define-key cm-map "b" 'outline-backward-same-level)       ; Backward - same level
1273
1274 )
1275 #+END_SRC
1276 *** outshine (outlining) integration
1277 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1278 ; (use-package outshine
1279 ;   :after outline
1280 ;   :hook (outline-minor-mode . outshine-mode)
1281 ; )
1282 #+END_SRC
1283 ** Writeroom Mode
1284 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1285 (use-package writeroom-mode
1286   :config
1287   (defun my/writing-mode ()
1288     "Start my writing mode; enable visual-line-mode and auto-fill-mode"
1289     (interactive)
1290     (if writeroom-mode
1291         (progn
1292           (writeroom-mode -1)
1293           (visual-line-mode -1)
1294           (auto-fill-mode -1)
1295           (visual-fill-column-mode -1)
1296           )
1297       (visual-line-mode 1)
1298       (auto-fill-mode 1)
1299       (visual-fill-column-mode 1)
1300       (writeroom-mode 1))
1301     )
1302   )
1303 #+END_SRC
1304 ** GhostText/Atomic Chrome
1305 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1306 (use-package atomic-chrome
1307   :config
1308   (ignore-errors (atomic-chrome-start-server))
1309   (setq atomic-chrome-buffer-open-style 'full)
1310   )
1311 #+END_SRC
1312 ** Edit Server
1313 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1314 (use-package edit-server
1315   :commands edit-server-start
1316   :init (if after-init-time
1317             (edit-server-start)
1318           (add-hook 'after-init-hook
1319                     #'(lambda() (edit-server-start))))
1320   :config (setq edit-server-new-frame-alist
1321                 '((name . "Edit with Emacs FRAME")
1322                   (top . 200)
1323                   (left . 200)
1324                   (width . 80)
1325                   (height . 25)
1326                   (minibuffer . t)
1327                   (menu-bar-lines . t)
1328                   (window-system . x)))
1329   )
1330 #+END_SRC
1331 ** Multiple Cursors
1332 [[https://github.com/magnars/multiple-cursors.el][Multiple Cursors]]
1333 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1334 (use-package multiple-cursors
1335   :bind* (("C-;" . mc/mark-all-dwim)
1336           ("C-<" . mc/mark-previous-like-this)
1337           ("C->" . mc/mark-next-like-this)
1338           ("C-S-c C-S-c" . mc/edit-lines))
1339   )
1340 #+END_SRC
1341 ** Web Mode
1342 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1343 (use-package web-mode
1344   :mode ("\\.\\(tx|tmpl\\)\\'" . web-mode)
1345   :config
1346   (add-to-list 'auto-mode-alist '("\\.tmpl\\'" . web-mode))
1347   (setq web-mode-enable-engine-detection t)
1348   (setq web-mode-engines-alist
1349         '(("template-toolkit" . "\\.tmpl\\'")))
1350   )
1351 #+END_SRC
1352 ** Spamassassin Mode
1353 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1354 (use-package spamassassin-mode
1355   :straight nil
1356   :load-path "~/lib/emacs_el"
1357   :commands spamassassin-mode
1358   )
1359 #+END_SRC
1360 ** Password Store
1361 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1362 (use-package password-store
1363   :commands password-store-edit password-store-generate
1364   :config
1365   (defun dla/password-store-edit (entry)
1366     "Edit password for ENTRY which doesn't require it to already exist"
1367     (interactive (list (password-store--completing-read nil)))
1368     (password-store--run-edit entry))
1369   (advice-add 'password-store-edit :override #'dla/password-store-edit)
1370   )
1371 #+END_SRC
1372 ** CSS mode
1373 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1374 (use-package css
1375   :straight css-mode
1376   :mode "\\.css'"
1377   :config
1378   ;; fix up css mode to not be silly
1379   ;; from http://www.stokebloke.com/wordpress/2008/03/21/css-mode-indent-buffer-fix/
1380   (setq cssm-indent-level 4)
1381   (setq cssm-newline-before-closing-bracket t)
1382   (setq cssm-indent-function #'cssm-c-style-indenter)
1383   (setq cssm-mirror-mode nil))
1384 #+END_SRC
1385 ** Abbrev Mode
1386 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1387 (use-package abbrev
1388   :straight nil
1389   :delight abbrev-mode
1390   :config
1391   ;; load abbreviations from
1392   (setq abbrev-file-name
1393         "~/.emacs_abbrev_def")
1394
1395   ;; read the abbrev file if it exists
1396   (if (file-exists-p abbrev-file-name)
1397       (quietly-read-abbrev-file))
1398
1399   ;; for now, use abbrev mode everywhere
1400   :init
1401   (setq default-abbrev-mode t))
1402 #+END_SRC
1403
1404 ** Debugging (realgud)
1405 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1406 (use-package realgud
1407   :commands (realgud:pdb realgud:gdb)
1408   )
1409 #+END_SRC
1410 ** Python Programming
1411 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1412 (use-package python-mode
1413   :delight Py 🐍
1414   :hook
1415   (python-mode . pyvenv-mode)
1416   (python-mode . flycheck-mode)
1417   (python-mode . blacken-mode)
1418   (python-mode . yas-minor-mode)
1419   (python-mode . anaconda-mode)
1420   )
1421 (use-package pyvenv
1422   :delight
1423   :after python-mode
1424   )
1425 (use-package blacken
1426   :delight
1427   :after python-mode
1428   :commands (blacken-buffer)
1429   :config
1430   (setq-default blacken-fast-unsafe t)
1431 )
1432 #+END_SRC
1433 *** Black
1434 #+begin_src emacs-lisp :tangle yes
1435 (use-package python-black
1436   :delight
1437   :commands (python-black-buffer python-black-statement)
1438   :after python)
1439 #+end_src
1440 *** Sphinx Documentation
1441 #+begin_src emacs-lisp :tangle yes
1442 (use-package numpydoc
1443   :after python
1444   :bind (:map python-mode-map
1445               ("C-c C-n" . numpydoc-generate)))
1446 (use-package sphinx-doc
1447   :delight 🐈
1448   :config
1449   (setq sphinx-doc-include-types t)
1450   :after python
1451   :hook (python-mode . sphinx-doc-mode)
1452   )
1453 (use-package python-docstring
1454   :delight
1455   :after python
1456   :hook (python-mode . python-docstring-mode)
1457   )
1458 #+end_src
1459 *** Anaconda Mode (Documentation lookup and completion)
1460 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1461 (use-package anaconda-mode
1462   :delight
1463   :after python
1464 )
1465 #+END_SRC
1466 ** Go language
1467 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1468 (use-package go-mode
1469              :delight "go"
1470              :mode "\\.go"
1471              )
1472 #+END_SRC
1473
1474 ** Expand region
1475 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1476 (use-package expand-region
1477   :bind (("C-=" . 'er/expand-region))
1478   )
1479 #+END_SRC
1480
1481 ** Dockerfile
1482 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1483 (use-package dockerfile-mode
1484   :mode "Dockerfile"
1485   )
1486 #+END_SRC
1487
1488 ** Beancount
1489 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1490 (use-package beancount
1491   :straight nil
1492   :load-path "~/lib/emacs_el/beancount-mode/"
1493   :mode "\\.beancount\\'"
1494
1495   )
1496 #+END_SRC
1497 ** Apache
1498 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1499 (use-package apache-mode
1500   :delight 🪶
1501   :mode "apache\\.conf\\'"
1502   )
1503 #+END_SRC
1504 ** ELDoc
1505 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1506 (use-package eldoc
1507   :delight
1508   :commands eldoc-mode
1509   :straight nil
1510   )
1511 #+END_SRC
1512
1513 * Email
1514 ** Mutt
1515 *** Message-mode
1516 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1517 (use-package message
1518   :straight nil
1519   :delight (message "✉")
1520   :delight (message-mode "✉")
1521   :mode ("muttng-[a-z0-9]+-[0-9]+-" . message-mode)
1522   :mode ("mutt-[a-z0-9]+-[0-9]+-" . message-mode)
1523   :hook 'my/message-mode-settings
1524   :hook 'turn-on-flyspell
1525   :bind (:map message-mode-map
1526       ("C-c C-a" . my/post-attach-file)
1527       ("C-x p" . my/message-kill-buffer)
1528       )
1529   :config
1530   (defun my/message-mode-settings ()
1531     (font-lock-add-keywords nil
1532                 '(("^[ \t]*>[ \t]*>[ \t]*>.*$"
1533                (0 'message-multiply-quoted-text-face))
1534               ("^[ \t]*>[ \t]*>.*$"
1535                (0 'message-double-quoted-text-face))))
1536     )
1537   (defun my/message-kill-buffer ()
1538     (interactive)
1539     (kill-buffer nil)
1540     )
1541   (defun my/post-attach-file ()
1542     "Prompt for an attachment."
1543     (interactive)
1544     (let ((file (read-file-name "Attach file: " nil nil t nil)))
1545       (my/header-attach-file file "")))
1546
1547   (defun my/header-attach-file (file description)
1548     "Attach a FILE to the current message (works with Mutt).
1549   Argument DESCRIPTION MIME description."
1550     (interactive "fAttach file: \nsDescription: ")
1551     (when (> (length file) 0)
1552   (save-excursion
1553     (save-match-data
1554       (save-restriction
1555         (widen)
1556         (goto-char (point-min))
1557         (search-forward-regexp "^$")
1558         (insert (concat "Attach: " (replace-regexp-in-string "\\([[:space:]\\]\\)" "\\\\\\1" (file-truename file)) " "
1559                 description "\n"))
1560         (message (concat "Attached '" file "'."))
1561         (setq post-has-attachment t))))))
1562
1563   (setq mail-yank-prefix "> ")
1564   (setq mail-header-separator "") ; fix broken header detection
1565 )
1566 #+END_SRC
1567 *** Muttrc mode
1568 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1569 (use-package mutt-mode
1570   :mode "muttngrc"
1571   :mode "muttrc"
1572 )
1573 #+END_SRC
1574 *** Set mail User agent
1575 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1576 (setq mail-user-agent (quote sendmail-user-agent))
1577 #+END_SRC
1578 *** Mail aliases
1579 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1580 ; (use-package
1581 ;   :straight t
1582 ;   :hook message
1583 ;   :config
1584 ;   (setq mutt-alias-file-list (quote ("~/.mutt/aliases" "~/.mail_aliases")))
1585 ; )
1586 #+END_SRC
1587 * Base emacs
1588 ** Reverting buffers
1589 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1590 (use-package autorevert
1591   :delight auto-revert-mode
1592   :config
1593   (setq global-auto-revert-non-file-buffers t
1594         global-auto-revert-ignore-modes '(pdf-view-mode)
1595         auto-revert-verbose nil)
1596   (global-auto-revert-mode 1))
1597 #+END_SRC
1598 * Org Mode
1599 ** Use-package and load things
1600 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1601
1602 (use-package org
1603   :delight (org-mode "ø")
1604   :mode ("\\.\\(org\\|org_archive\\|txt\\)\\'" . org-mode)
1605   :bind (("C-c l l" . org-store-link)
1606          ("C-c a"  . org-agenda)
1607          ("C-c b"  . org-iswitchb))
1608 #+END_SRC
1609 ** Agenda Configuration
1610 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1611   :config
1612   (setq-default org-log-done 'time)
1613   (setq-default org-agenda-ndays 5)
1614
1615   (setq org-agenda-sticky t)
1616   (defun dla/show-org-agenda ()
1617     (interactive)
1618     (let (agendabuffer
1619           '(delq nil
1620                 (mapcar (lambda (x)
1621                           (and (string-match-p
1622                                 "\*Org Agenda.*\*"
1623                                 (buffer-name x))
1624                                x)
1625                           )
1626                         (buffer-list))))
1627       (if agendabuffer
1628           (switch-to-buffer
1629            (buffer-name agendabuffer))
1630         (org-agenda-list)))
1631       (delete-other-windows))
1632
1633   ;; agenda configuration
1634   ;; Do not dim blocked tasks
1635   (setq org-agenda-dim-blocked-tasks nil)
1636   (setq org-agenda-inhibit-startup t)
1637   (setq org-agenda-use-tag-inheritance nil)
1638
1639   ;; Compact the block agenda view
1640   (setq org-agenda-compact-blocks t)
1641
1642   ;; Custom agenda command definitions
1643   (setq org-agenda-custom-commands
1644         (quote (("N" "Notes" tags "NOTE"
1645                  ((org-agenda-overriding-header "Notes")
1646                   (org-tags-match-list-sublevels t)))
1647                 ("h" "Habits" tags-todo "STYLE=\"habit\""
1648                  ((org-agenda-overriding-header "Habits")
1649                   (org-agenda-sorting-strategy
1650                    '(todo-state-down effort-up category-keep))))
1651                 (" " "Agenda"
1652                  ((agenda "" nil)
1653                   (tags "REFILE"
1654                         ((org-agenda-overriding-header "Tasks to Refile")
1655                          (org-tags-match-list-sublevels nil)))
1656                   (tags-todo "-CANCELLED/!"
1657                              ((org-agenda-overriding-header "Stuck Projects")
1658                               (org-agenda-skip-function 'bh/skip-non-stuck-projects)
1659                               (org-agenda-sorting-strategy
1660                                '(category-keep))))
1661                   (tags-todo "-HOLD-CANCELLED/!"
1662                              ((org-agenda-overriding-header "Projects")
1663                               (org-agenda-skip-function 'bh/skip-non-projects)
1664                               (org-tags-match-list-sublevels 'indented)
1665                               (org-agenda-sorting-strategy
1666                                '(category-keep))))
1667                   (tags-todo "-CANCELLED/!NEXT"
1668                              ((org-agenda-overriding-header (concat "Project Next Tasks"
1669                                                                     (if bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks
1670                                                                         ""
1671                                                                       " (including WAITING and SCHEDULED tasks)")))
1672                               (org-agenda-skip-function 'bh/skip-projects-and-habits-and-single-tasks)
1673                               (org-tags-match-list-sublevels t)
1674                               (org-agenda-todo-ignore-scheduled bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
1675                               (org-agenda-todo-ignore-deadlines bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
1676                               (org-agenda-todo-ignore-with-date bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
1677                               (org-agenda-sorting-strategy
1678                                '(todo-state-down effort-up category-keep))))
1679                   (tags-todo "-REFILE-CANCELLED-WAITING-HOLD/!"
1680                              ((org-agenda-overriding-header (concat "Project Subtasks"
1681                                                                     (if bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks
1682                                                                         ""
1683                                                                       " (including WAITING and SCHEDULED tasks)")))
1684                               (org-agenda-skip-function 'bh/skip-non-project-tasks)
1685                               (org-agenda-todo-ignore-scheduled bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
1686                               (org-agenda-todo-ignore-deadlines bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
1687                               (org-agenda-todo-ignore-with-date bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
1688                               (org-agenda-sorting-strategy
1689                                '(category-keep))))
1690                   (tags-todo "-REFILE-CANCELLED-WAITING-HOLD/!"
1691                              ((org-agenda-overriding-header (concat "Standalone Tasks"
1692                                                                     (if bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks
1693                                                                         ""
1694                                                                       " (including WAITING and SCHEDULED tasks)")))
1695                               (org-agenda-skip-function 'bh/skip-project-tasks)
1696                               (org-agenda-todo-ignore-scheduled bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
1697                               (org-agenda-todo-ignore-deadlines bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
1698                               (org-agenda-todo-ignore-with-date bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
1699                               (org-agenda-sorting-strategy
1700                                '(category-keep))))
1701                   (tags-todo "-CANCELLED+WAITING|HOLD/!"
1702                              ((org-agenda-overriding-header "Waiting and Postponed Tasks")
1703                               (org-agenda-skip-function 'bh/skip-stuck-projects)
1704                               (org-tags-match-list-sublevels nil)
1705                               (org-agenda-todo-ignore-scheduled t)
1706                               (org-agenda-todo-ignore-deadlines t)))
1707                   (tags "-REFILE/"
1708                         ((org-agenda-overriding-header "Tasks to Archive")
1709                          (org-agenda-skip-function 'bh/skip-non-archivable-tasks)
1710                          (org-tags-match-list-sublevels nil))))
1711                  nil))))
1712
1713   ; org mode agenda files
1714   (setq org-agenda-files
1715         (append
1716         (file-expand-wildcards "~/projects/org-notes/*.org")
1717         (file-expand-wildcards "~/org-mode/from-mobile.org")
1718         (file-expand-wildcards "~/org-notes-*/*.org")
1719         )
1720   )
1721   (setq my/org-refile-file
1722         (car (seq-filter
1723               (lambda (file) (string-match-p (regexp-quote "/refile.org") file))
1724               org-agenda-files)))
1725
1726   (set-register ?n (cons 'file "~/projects/org-notes/notes.org"))
1727   (set-register ?r (cons 'file my/org-refile-file))
1728   (set-register ?o (cons 'file "~/projects/org-notes/ool.org"))
1729   (set-register ?s (cons 'file "~/projects/org-notes/sndservers.org"))
1730   (set-register ?c (cons 'file "~/projects/org-notes/chaim.org"))
1731   (set-register ?w (cons 'file "~/projects/org-notes/wildman.org"))
1732   (set-register ?u (cons 'file "~/projects/org-notes/uddin.org"))
1733   (set-register ?R (cons 'file "~/projects/reviews/reviews.org"))
1734   (set-register ?d (cons 'file "~/projects/org-notes/diary.org"))
1735   ; from https://emacs.stackexchange.com/questions/909/how-can-i-have-an-agenda-timeline-view-of-multiple-files
1736   ; (defun org-agenda-timeline-all (&optional arg)
1737   ;   (interactive "P")
1738   ;   (with-temp-buffer
1739   ;     (dolist (org-agenda-file org-agenda-files)
1740   ;       (insert-file-contents org-agenda-file nil)
1741   ;       (goto-char (point-max))
1742   ;       (newline))
1743   ;     (write-file "/tmp/timeline.org")
1744   ;     (org-agenda arg "L")))
1745   ; (define-key org-mode-map (kbd "C-c t") 'org-agenda-timeline-all)
1746
1747 #+END_SRC
1748 ** General config
1749 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1750   (setq org-global-properties '(("Effort_ALL 0 0:10 0:30 1:00 2:00 3:00 4:00 5:00 6:00 7:00")))
1751   (setq org-columns-default-format "%40ITEM(Task) %6Effort{:} %CLOCKSUM %PRIORITY %TODO %13SCHEDULED %13DEADLINE %TAGS")
1752
1753   (setq org-default-notes-file "~/projects/org-notes/notes.org")
1754   (setq org-id-link-to-org-use-id 'use-existing)
1755 #+END_SRC
1756 ** Capture Templates
1757 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1758   (setq org-capture-templates  ;; mail-specific note template, identified by "m"
1759         `(("m" "Mail" entry (file my/org-refile-file)
1760            "* %?\n\n  Source: %u, [[%:link][%:description]]\n  %:initial")
1761           ("t" "todo" entry (file my/org-refile-file)
1762            "* TODO %?\n  :PROPERTIES:\n  :END:\n  :LOGBOOK:\n  :END:\n%U\n%a\n" :clock-in t :clock-resume t)
1763           ("r" "respond" entry (file my/org-refile-file)
1764            "* NEXT Respond to %:from on %:subject\nSCHEDULED: %t\n%U\n%a\n" :clock-in t :clock-resume t :immediate-finish t)
1765           ("n" "note" entry (file my/org-refile-file)
1766            "* %? :NOTE:\n%U\n%a\n" :clock-in t :clock-resume t)
1767           ("s" "schedule" entry (file my/org-refile-file)
1768            "* %? :cal:\n%^{scheduled:}t\n%U\n%a\n" :clock-in t :clock-resume t)
1769           ("j" "Journal" entry (file+datetree "~/projects/org-notes/diary.org")
1770            "* %?\n%U\n" :clock-in t :clock-resume t)
1771           ("w" "org-protocol" entry (file my/org-refile-file)
1772            "* TODO Review %c\n%U\n" :immediate-finish t)
1773           ("M" "Meeting" entry (file my/org-refile-file)
1774            "* MEETING with %? :MEETING:\n%U" :clock-in t :clock-resume t)
1775           ("S" "Seminar" entry (file my/org-refile-file)
1776            "* SEMINAR notes %? :SEMINAR:\n%U" :clock-in t :clock-resume t)
1777           ("P" "Paper to read" entry (file+headline "~/projects/research/papers_to_read.org" "Refile")
1778            "* TODO Get/Read %? \n%U" :clock-in t :clock-resume t)
1779           ("p" "Phone call" entry (file my/org-refile-file)
1780            "* PHONE %? :PHONE:\n%U" :clock-in t :clock-resume t)
1781            ("J" "job" entry (file+olp "~/projects/org-notes/notes.org"
1782                                        "Jobs"
1783                                        ,(format-time-string "Positions %Y"))
1784            "* TODO Apply for %? :job:\nSCHEDULED: <%<%Y-%m-%d>>\n%U\n%x\n" :clock-in t :clock-resume t)
1785           ("h" "Habit" entry (file my/org-refile-file)
1786            "* NEXT %?\n%U\n%a\nSCHEDULED: %(format-time-string \"<%Y-%m-%d .+1d/3d>\")\n:PROPERTIES:\n:STYLE: habit\n:REPEAT_TO_STATE: NEXT\n:END:\n%a\n")
1787           )
1788         )
1789
1790   ;; Remove empty LOGBOOK drawers on clock out
1791   (defun bh/remove-empty-drawer-on-clock-out ()
1792     (interactive)
1793     (save-excursion
1794       (beginning-of-line 0)
1795       (org-remove-empty-drawer-at (point))))
1796
1797   (defun my/org-add-id ()
1798     (interactive)
1799     (save-excursion
1800       (if (org-current-level)
1801           ()
1802         (forward-char 1)
1803         )
1804       (org-id-get-create)
1805       )
1806   )
1807
1808 #+END_SRC
1809 ** Org mode key bindings
1810 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1811   ;; org mode configuration from http://doc.norang.ca/org-mode.html
1812   ;; Custom Key Bindings
1813   :bind* (("<f9> a" . org-agenda)
1814           ("<f9> I" . bh/punch-in)
1815           ("<f9> O" . bh/punch-out)
1816           ("<f9> SPC" . bh/clock-in-last-task)
1817           ("<f12>" . dla/show-org-agenda)
1818           ;; ("<f5>" . bh/org-todo)
1819           ("<S-f5>" . bh/widen)
1820           ("<f7>" . bh/set-truncate-lines)
1821           ("<f8>" . org-cycle-agenda-files)
1822           ("<f9> <f9>" . dla/show-org-agenda)
1823           ("<f9> b" . bbdb)
1824           ("<f9> c" . calendar)
1825           ("<f9> f" . boxquote-insert-file)
1826           ("<f9> h" . bh/hide-other)
1827           ("<f9> n" . bh/toggle-next-task-display)
1828           ("<f9> w" . widen)
1829
1830           ("<f9> r" . boxquote-region)
1831           ("<f9> s" . bh/switch-to-scratch)
1832
1833           ("<f9> t" . bh/insert-inactive-timestamp)
1834           ("<f9> T" . bh/toggle-insert-inactive-timestamp)
1835
1836           ("<f9> v" . visible-mode)
1837           ("<f9> l" . org-toggle-link-display)
1838           ("<f9> SPC" . bh/clock-in-last-task)
1839           ("C-<f9>" . previous-buffer)
1840           ("M-<f9>" . org-toggle-inline-images)
1841           ("C-x n r" . narrow-to-region)
1842           ("C-<f10>" . next-buffer)
1843           ("<f11>" . org-clock-goto)
1844           ("C-<f11>" . org-clock-in)
1845           ("C-s-<f12>" . bh/save-then-publish)
1846           ("C-c c" . org-capture))
1847   :config
1848 #+END_SRC
1849 ** Utility Functions
1850 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1851 (defun bh/hide-other ()
1852   (interactive)
1853   (save-excursion
1854     (org-back-to-heading 'invisible-ok)
1855     (outline-hide-other)
1856     (org-cycle)
1857     (org-cycle)
1858     (org-cycle)))
1859
1860 (defun bh/set-truncate-lines ()
1861   "Toggle value of truncate-lines and refresh window display."
1862   (interactive)
1863   (setq truncate-lines (not truncate-lines))
1864   ;; now refresh window display (an idiom from simple.el):
1865   (save-excursion
1866     (set-window-start (selected-window)
1867                       (window-start (selected-window)))))
1868
1869 (defun bh/switch-to-scratch ()
1870   (interactive)
1871   (switch-to-buffer "*scratch*"))
1872
1873 (setq org-use-fast-todo-selection t)
1874 (setq org-treat-S-cursor-todo-selection-as-state-change nil)
1875
1876 ; create function to create headlines in file. This comes from
1877 ; http://stackoverflow.com/questions/13340616/assign-ids-to-every-entry-in-org-mode
1878 (defun my/org-add-ids-to-headlines-in-file ()
1879   "Add ID properties to all headlines in the current file which
1880 do not already have one."
1881   (interactive)
1882   (save-excursion
1883     (widen)
1884     (goto-char (point-min))
1885     (when (not (re-search-forward "^#\\+OPTIONS:.*auto-id:f" (point-max) t))
1886       (org-map-entries 'org-id-get-create))))
1887 (defun dla/org-update-ids-to-headlines-in-file ()
1888   "Add or replace ID properties to all headlines in the current file
1889 (or narrowed region)."
1890   (interactive)
1891
1892   (org-map-entries '(lambda () (org-id-get-create t))))
1893 ; if we wanted to do this to every buffer, do the following:
1894 (add-hook 'org-mode-hook
1895           (lambda ()
1896             (add-hook 'before-save-hook 'my/org-add-ids-to-headlines-in-file nil 'local)))
1897 #+END_SRC
1898 ** Org ID locations
1899 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1900 (use-package find-lisp
1901   :demand t)
1902 (setq org-agenda-text-search-extra-files
1903       (append '(agenda-archives)
1904               (find-lisp-find-files "~/projects/org-notes" "\.org$")
1905               (find-lisp-find-files "~/projects/org-notes" "\.org_archive$")
1906               ))
1907 #+END_SRC
1908 ** Keywords (TODO)
1909 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1910 (setq org-todo-keywords
1911       (quote ((sequence "TODO(t)" "NEXT(n)" "|" "DONE(d)")
1912               (sequence "WAITING(w@/!)" "HOLD(h@/!)" "|" "CANCELLED(c@/!)" "PHONE" "MEETING"))))
1913
1914 (setq org-todo-keyword-faces
1915       (quote (("TODO" :foreground "red" :weight bold)
1916               ("NEXT" :foreground "blue" :weight bold)
1917               ("DONE" :foreground "forest green" :weight bold)
1918               ("WAITING" :foreground "orange" :weight bold)
1919               ("HOLD" :foreground "magenta" :weight bold)
1920               ("CANCELLED" :foreground "forest green" :weight bold)
1921               ("MEETING" :foreground "forest green" :weight bold)
1922               ("PHONE" :foreground "forest green" :weight bold))))
1923
1924 (setq org-todo-state-tags-triggers
1925       (quote (("CANCELLED" ("CANCELLED" . t))
1926               ("WAITING" ("WAITING" . t))
1927               ("HOLD" ("WAITING") ("HOLD" . t))
1928               (done ("WAITING") ("HOLD"))
1929               ("TODO" ("WAITING") ("CANCELLED") ("HOLD"))
1930               ("NEXT" ("WAITING") ("CANCELLED") ("HOLD"))
1931               ("DONE" ("WAITING") ("CANCELLED") ("HOLD")))))
1932
1933
1934
1935 ; (add-hook 'org-clock-out-hook 'bh/remove-empty-drawer-on-clock-out 'append)
1936 ; add ids on creation of nodes
1937 (add-hook 'org-capture-prepare-finalize-hook 'my/org-add-id)
1938
1939
1940 ; resolve clocks after 10 minutes of idle; use xprintidle
1941 ; (setq org-clock-idle-time 10)
1942 ; (setq org-clock-x11idle-program-name "xprintidle")
1943
1944 ; this is from http://doc.norang.ca/org-mode.html#Capture
1945 ; use C-M-r for org mode capture
1946 (global-set-key (kbd "C-M-r") 'org-capture)
1947
1948 ; Targets include this file and any file contributing to the agenda - up to 9 levels deep
1949 (setq org-refile-targets (quote ((nil :maxlevel . 9)
1950                                  (org-agenda-files :maxlevel . 9))))
1951
1952 ; Use full outline paths for refile targets - we file directly with IDO
1953 (setq org-refile-use-outline-path t)
1954
1955 ; Targets complete directly with IDO
1956 (setq org-outline-path-complete-in-steps nil)
1957
1958 ; Allow refile to create parent tasks with confirmation
1959 (setq org-refile-allow-creating-parent-nodes (quote confirm))
1960
1961 ; ; Use IDO for both buffer and file completion and ido-everywhere to t
1962 ; (setq org-completion-use-ido t)
1963 ; (setq ido-everywhere t)
1964 ; (setq ido-max-directory-size 100000)
1965 ; (ido-mode (quote both))
1966 ; ; Use the current window when visiting files and buffers with ido
1967 ; (setq ido-default-file-method 'selected-window)
1968 ; (setq ido-default-buffer-method 'selected-window)
1969 ; ; Use the current window for indirect buffer display
1970 ; (setq org-indirect-buffer-display 'current-window)
1971
1972
1973 ;;;; Refile settings
1974 ; Exclude DONE state tasks from refile targets
1975 (defun bh/verify-refile-target ()
1976   "Exclude todo keywords with a done state from refile targets"
1977   (not (member (nth 2 (org-heading-components)) org-done-keywords)))
1978
1979 (setq org-refile-target-verify-function 'bh/verify-refile-target)
1980
1981 ;; ensure that emacsclient will show just the note to be edited when invoked
1982 ;; from Mutt, and that it will shut down emacsclient once finished;
1983 ;; fallback to legacy behavior when not invoked via org-protocol.
1984 (require 'org-protocol)
1985 ; (add-hook 'org-capture-mode-hook 'delete-other-windows)
1986 (setq my-org-protocol-flag nil)
1987 (defadvice org-capture-finalize (after delete-frame-at-end activate)
1988   "Delete frame at remember finalization"
1989   (progn (if my-org-protocol-flag (delete-frame))
1990          (setq my-org-protocol-flag nil)))
1991 (defadvice org-capture-refile (around delete-frame-after-refile activate)
1992   "Delete frame at remember refile"
1993   (if my-org-protocol-flag
1994       (progn
1995         (setq my-org-protocol-flag nil)
1996         ad-do-it
1997         (delete-frame))
1998     ad-do-it)
1999   )
2000 (defadvice org-capture-kill (after delete-frame-at-end activate)
2001   "Delete frame at remember abort"
2002   (progn (if my-org-protocol-flag (delete-frame))
2003          (setq my-org-protocol-flag nil)))
2004 (defadvice org-protocol-capture (before set-org-protocol-flag activate)
2005   (setq my-org-protocol-flag t))
2006
2007 (defadvice org-insert-todo-heading (after dla/create-id activate)
2008   (unless (org-in-item-p)
2009     (org-id-get-create)
2010     )
2011   )
2012
2013 ;; org modules
2014 (add-to-list 'org-modules 'org-habit)
2015
2016 ; this comes from http://upsilon.cc/~zack/blog/posts/2010/02/integrating_Mutt_with_Org-mode/
2017 (defun open-mail-in-mutt (message)
2018   "Open a mail message in Mutt, using an external terminal.
2019
2020 Message can be specified either by a path pointing inside a
2021 Maildir, or by Message-ID."
2022   (interactive "MPath or Message-ID: ")
2023   (shell-command
2024    (format "faf xterm -e \"%s %s\""
2025        (substitute-in-file-name "$HOME/bin/mutt_open") message)))
2026
2027 ;; add support for "mutt:ID" links
2028 (org-add-link-type "mutt" 'open-mail-in-mutt)
2029
2030 (defun my-org-mode-setup ()
2031   ; (load-library "reftex")
2032   (and (buffer-file-name)
2033        (file-exists-p (buffer-file-name))
2034        (progn
2035          ; (reftex-parse-all)
2036          (reftex-set-cite-format
2037           '((?b . "[[bib:%l][%l-bib]]")
2038             (?n . "[[notes:%l][%l-notes]]")
2039             (?c . "\\cite{%l}")
2040             (?h . "*** %t\n:PROPERTIES:\n:Custom_ID: %l\n:END:\n[[papers:%l][%l xoj]] [[papers-pdf:%l][pdf]]")))
2041          ))
2042   (define-key org-mode-map (kbd "C-c )") 'reftex-citation)
2043   (define-key org-mode-map (kbd "C-c [") 'reftex-citation)
2044   (define-key org-mode-map (kbd "C-c (") 'org-mode-reftex-search)
2045   (define-key org-mode-map (kbd "C-c 0") 'reftex-view-crossref)
2046   )
2047 (add-hook 'org-mode-hook 'my-org-mode-setup)
2048
2049 (defun org-mode-reftex-search ()
2050   (interactive)
2051   (org-open-link-from-string (format "[[notes:%s]]" (first (reftex-citation t)))))
2052
2053 (defun open-research-paper (bibtexkey)
2054   "Open a paper by bibtex key"
2055   (interactive "bibtex key: ")
2056   (shell-command
2057    (format "%s %s"
2058        (substitute-in-file-name "$HOME/bin/bibtex_to_paper") bibtexkey)))
2059 (org-add-link-type "papers" 'open-research-paper)
2060 (defun open-research-paper-pdf (bibtexkey)
2061   "Open a paper pdf by bibtex key"
2062   (interactive "bibtex key: ")
2063   (shell-command
2064    (format "%s -p evince_annot %s"
2065        (substitute-in-file-name "$HOME/bin/bibtex_to_paper") bibtexkey)))
2066 (org-add-link-type "papers-pdf" 'open-research-paper-pdf)
2067
2068 (add-to-list 'org-link-abbrev-alist
2069              '("notes" .
2070                "~/projects/research/paper_notes.org::#%s"))
2071
2072 ; I pretty much always want hiearchical checkboxes
2073 (setq org-hierachical-checkbox-statistics nil)
2074
2075 ;; Add \begin{equation}\end{equation} templates to the org mode easy templates
2076 (add-to-list 'org-structure-template-alist
2077              '("E" "\\begin{equation}\n?\n\\end{equation}"))
2078
2079  ;; stolen from
2080 ;; http://www-public.it-sudparis.eu/~berger_o/weblog/2012/03/23/how-to-manage-and-export-bibliographic-notesrefs-in-org-mode/
2081 (defun my-rtcite-export-handler (path desc format)
2082   (message "my-rtcite-export-handler is called : path = %s, desc = %s, format = %s" path desc format)
2083   (let* ((search (when (string-match "::#?\\(.+\\)\\'" path)
2084                    (match-string 1 path)))
2085          (path (substring path 0 (match-beginning 0))))
2086     (cond ((eq format 'latex)
2087            (if (or (not desc)
2088                    (equal 0 (search "rtcite:" desc)))
2089                (format "\\cite{%s}" search)
2090              (format "\\cite[%s]{%s}" desc search))))))
2091
2092 (org-add-link-type "rtcite"
2093                    'org-bibtex-open
2094                    'my-rtcite-export-handler)
2095
2096
2097 #+END_SRC
2098 ** Org Mobile Configuration
2099 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2100   (setq-default org-mobile-directory "/linnode.donarmstrong.com:/sites/dav.donarmstrong.com/root/org/")
2101   (when (string= system-name "linnode")
2102     (setq-default org-mobile-directory "/sites/dav.donarmstrong.com/root/org/"))
2103   (setq-default org-directory "/home/don/org-mode/")
2104   (setq-default org-mobile-inbox-for-pull "/home/don/org-mode/from-mobile.org")
2105
2106 #+END_SRC
2107 ** Org iCal Support
2108 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2109   ;; org mode ical export
2110   (setq org-icalendar-timezone "America/Los_Angeles")
2111   (setq org-icalendar-use-scheduled '(todo-start event-if-todo))
2112   ;; we already add the id manually
2113   (setq org-icalendar-store-UID t)
2114
2115 #+END_SRC
2116 ** General Org Babel Configuration
2117 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2118 ;; org babel support
2119 (org-babel-do-load-languages
2120  'org-babel-load-languages
2121  '((emacs-lisp . t )
2122    (R . t)
2123    (latex . t)
2124    (ditaa . t)
2125    (dot . t)
2126    ))
2127 ;; set the right path to ditaa.jar
2128 (setq org-ditaa-jar-path "/usr/share/ditaa/ditaa.jar")
2129 ;; use graphviz-dot for dot things
2130 (add-to-list 'org-src-lang-modes '("dot" . graphviz-dot))
2131 ;; do not indent begin_src blocks
2132 (setq org-edit-src-content-indentation 0)
2133 ;; org-babel-by-backend
2134 (defmacro org-babel-by-backend (&rest body)
2135    `(case (if (boundp 'backend)
2136               (org-export-backend-name backend)
2137             nil) ,@body))
2138
2139 (defun my/fix-inline-images ()
2140   (when org-inline-image-overlays
2141     (org-redisplay-inline-images)))
2142
2143 (add-hook 'org-babel-after-execute-hook
2144            'my/fix-inline-images)
2145
2146 #+END_SRC
2147 ** LaTeX configuration
2148 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2149 (use-package org-contrib
2150   :no-require t
2151   :after org
2152   :config
2153   (require 'ox-extra)
2154   (ox-extras-activate '(latex-header-blocks ignore-headlines))
2155   (require 'ox-latex)
2156 (add-to-list 'org-latex-classes
2157          '("memarticle"
2158        "\\documentclass[11pt,oneside,article]{memoir}\n"
2159        ("\\section{%s}" . "\\section*{%s}")
2160        ("\\subsection{%s}" . "\\subsection*{%s}")
2161        ("\\subsubsection{%s}" . "\\subsubsection*{%s}")
2162        ("\\paragraph{%s}" . "\\paragraph*{%s}")
2163        ("\\subparagraph{%s}" . "\\subparagraph*{%s}")))
2164
2165 (setq org-beamer-outline-frame-options "")
2166 (add-to-list 'org-latex-classes
2167          '("beamer"
2168        "\\documentclass[ignorenonframetext]{beamer}
2169 [NO-DEFAULT-PACKAGES]
2170 [PACKAGES]
2171 [EXTRA]"
2172        ("\\section{%s}" . "\\section*{%s}")
2173        ("\\subsection{%s}" . "\\subsection*{%s}")
2174        ("\\subsubsection{%s}" . "\\subsubsection*{%s}")
2175        ("\\paragraph{%s}" . "\\paragraph*{%s}")
2176        ("\\subparagraph{%s}" . "\\subparagraph*{%s}")))
2177
2178 (add-to-list 'org-latex-classes
2179          '("membook"
2180        "\\documentclass[11pt,oneside]{memoir}\n"
2181        ("\\chapter{%s}" . "\\chapter*{%s}")
2182        ("\\section{%s}" . "\\section*{%s}")
2183        ("\\subsection{%s}" . "\\subsection*{%s}")
2184        ("\\subsubsection{%s}" . "\\subsubsection*{%s}")))
2185
2186 (add-to-list 'org-latex-classes
2187          '("letter"
2188        "\\documentclass[11pt]{letter}
2189 [NO-DEFAULT-PACKAGES]
2190 [PACKAGES]
2191 [EXTRA]"
2192    ("\\section{%s}" . "\\section*{%s}")
2193        ("\\subsection{%s}" . "\\subsection*{%s}")
2194        ("\\subsubsection{%s}" . "\\subsubsection*{%s}")
2195        ("\\paragraph{%s}" . "\\paragraph*{%s}")
2196        ("\\subparagraph{%s}" . "\\subparagraph*{%s}")))
2197
2198 (add-to-list 'org-latex-classes
2199          '("dlacv"
2200        "\\documentclass{dlacv}
2201 [NO-DEFAULT-PACKAGES]
2202 [NO-PACKAGES]
2203 [NO-EXTRA]"
2204        ("\\section{%s}" . "\\section*{%s}")
2205        ("\\subsection{%s}" . "\\subsection*{%s}")
2206        ("\\subsubsection{%s}" . "\\subsubsection*{%s}")
2207        ("\\paragraph{%s}" . "\\paragraph*{%s}")
2208        ("\\subparagraph{%s}" . "\\subparagraph*{%s}")))
2209
2210
2211 (add-to-list 'org-latex-classes
2212          '("dlaresume"
2213        "\\documentclass{dlaresume}
2214 [NO-DEFAULT-PACKAGES]
2215 [NO-PACKAGES]
2216 [NO-EXTRA]"
2217        ("\\section{%s}" . "\\section*{%s}")
2218        ("\\subsection{%s}" . "\\subsection*{%s}")
2219        ("\\subsubsection{%s}" . "\\subsubsection*{%s}")
2220        ("\\paragraph{%s}" . "\\paragraph*{%s}")
2221        ("\\subparagraph{%s}" . "\\subparagraph*{%s}")))
2222
2223
2224 ;; Originally taken from Bruno Tavernier: http://thread.gmane.org/gmane.emacs.orgmode/31150/focus=31432
2225 ;; but adapted to use latexmk 4.22 or higher.
2226 (setq org-latex-pdf-process '("latexmk -f -pdflatex=xelatex -bibtex -use-make -pdf %f"))
2227
2228 ;; Default packages included in /every/ tex file, latex, pdflatex or xelatex
2229 (setq org-latex-default-packages-alist
2230   '(("" "amsmath" t)
2231     ("" "unicode-math" t)
2232     ))
2233 (setq org-latex-packages-alist
2234   '(("" "graphicx" t)
2235     ("" "fontspec" t)
2236     ("" "xunicode" t)
2237     ("" "hyperref" t)
2238     ("" "url" t)
2239     ("" "rotating" t)
2240     ("" "longtable" nil)
2241     ("" "float" )))
2242
2243 ;; make equations larger
2244 (setq org-format-latex-options (plist-put org-format-latex-options :scale 2.0))
2245
2246 (defun org-create-formula--latex-header ()
2247   "Return LaTeX header appropriate for previewing a LaTeX snippet."
2248   (let ((info (org-combine-plists (org-export--get-global-options
2249            (org-export-get-backend 'latex))
2250           (org-export--get-inbuffer-options
2251            (org-export-get-backend 'latex)))))
2252     (org-latex-guess-babel-language
2253      (org-latex-guess-inputenc
2254   (org-splice-latex-header
2255    org-format-latex-header
2256    org-latex-default-packages-alist
2257    nil t
2258    (plist-get info :latex-header)))
2259      info)))
2260
2261
2262 ; support ignoring headers in org mode export to latex
2263 ; from http://article.gmane.org/gmane.emacs.orgmode/67692
2264 (defadvice org-latex-headline (around my-latex-skip-headlines
2265                   (headline contents info) activate)
2266   (if (member "ignoreheading" (org-element-property :tags headline))
2267   (setq ad-return-value contents)
2268     ad-do-it))
2269
2270 ;; keep latex logfiles
2271
2272 (setq org-latex-remove-logfiles nil)
2273 )
2274
2275 ;; Resume clocking task when emacs is restarted
2276 (org-clock-persistence-insinuate)
2277 ;;
2278 ;; Show lot of clocking history so it's easy to pick items off the C-F11 list
2279 (setq org-clock-history-length 23)
2280 ;; Resume clocking task on clock-in if the clock is open
2281 (setq org-clock-in-resume t)
2282 ;; Change tasks to NEXT when clocking in; this avoids clocking in when
2283 ;; there are things like PHONE calls
2284 (setq org-clock-in-switch-to-state 'bh/clock-in-to-next)
2285 ;; Separate drawers for clocking and logs
2286 (setq org-drawers (quote ("PROPERTIES" "LOGBOOK")))
2287 ;; Save clock data and state changes and notes in the LOGBOOK drawer
2288 (setq org-clock-into-drawer t)
2289 (setq org-log-into-drawer t)
2290 ;; Sometimes I change tasks I'm clocking quickly - this removes clocked tasks with 0:00 duration
2291 (setq org-clock-out-remove-zero-time-clocks t)
2292 ;; Clock out when moving task to a done state
2293 (setq org-clock-out-when-done t)
2294 ;; Save the running clock and all clock history when exiting Emacs, load it on startup
2295 (setq org-clock-persist t)
2296 ;; Do not prompt to resume an active clock
2297 (setq org-clock-persist-query-resume nil)
2298 ;; Enable auto clock resolution for finding open clocks
2299 (setq org-clock-auto-clock-resolution (quote when-no-clock-is-running))
2300 ;; Include current clocking task in clock reports
2301 (setq org-clock-report-include-clocking-task t)
2302
2303 ;; the cache seems to be broken
2304 (setq org-element-use-cache nil)
2305
2306 (defvar bh/keep-clock-running nil)
2307
2308 (defun bh/is-task-p ()
2309   "Any task with a todo keyword and no subtask"
2310   (save-restriction
2311     (widen)
2312     (let ((has-subtask)
2313           (subtree-end (save-excursion (org-end-of-subtree t)))
2314           (is-a-task (member (nth 2 (org-heading-components)) org-todo-keywords-1)))
2315       (save-excursion
2316         (forward-line 1)
2317         (while (and (not has-subtask)
2318                     (< (point) subtree-end)
2319                     (re-search-forward "^\*+ " subtree-end t))
2320           (when (member (org-get-todo-state) org-todo-keywords-1)
2321             (setq has-subtask t))))
2322       (and is-a-task (not has-subtask)))))
2323 (defun bh/is-project-p ()
2324   "Any task with a todo keyword subtask"
2325   (save-restriction
2326     (widen)
2327     (let ((has-subtask)
2328           (subtree-end (save-excursion (org-end-of-subtree t)))
2329           (is-a-task (member (nth 2 (org-heading-components)) org-todo-keywords-1)))
2330       (save-excursion
2331         (forward-line 1)
2332         (while (and (not has-subtask)
2333                     (< (point) subtree-end)
2334                     (re-search-forward "^\*+ " subtree-end t))
2335           (when (member (org-get-todo-state) org-todo-keywords-1)
2336             (setq has-subtask t))))
2337       (and is-a-task has-subtask))))
2338
2339 (defun bh/is-subproject-p ()
2340   "Any task which is a subtask of another project"
2341   (let ((is-subproject)
2342         (is-a-task (member (nth 2 (org-heading-components)) org-todo-keywords-1)))
2343     (save-excursion
2344       (while (and (not is-subproject) (org-up-heading-safe))
2345         (when (member (nth 2 (org-heading-components)) org-todo-keywords-1)
2346           (setq is-subproject t))))
2347     (and is-a-task is-subproject)))
2348
2349
2350 (defun bh/clock-in-to-next (kw)
2351   "Switch a task from TODO to NEXT when clocking in.
2352 Skips capture tasks, projects, and subprojects.
2353 Switch projects and subprojects from NEXT back to TODO"
2354   (when (not (and (boundp 'org-capture-mode) org-capture-mode))
2355     (cond
2356      ((and (member (org-get-todo-state) (list "TODO"))
2357        (bh/is-task-p))
2358   "NEXT")
2359      ((and (member (org-get-todo-state) (list "NEXT"))
2360        (bh/is-project-p))
2361   "TODO"))))
2362
2363 (defun bh/punch-in (arg)
2364   "Start continuous clocking and set the default task to the
2365 selected task.  If no task is selected set the Organization task
2366 as the default task."
2367   (interactive "p")
2368   (setq bh/keep-clock-running t)
2369   (if (equal major-mode 'org-agenda-mode)
2370   ;;
2371   ;; We're in the agenda
2372   ;;
2373   (let* ((marker (org-get-at-bol 'org-hd-marker))
2374          (tags (org-with-point-at marker (org-get-tags))))
2375     (if (and (eq arg 4) tags)
2376         (org-agenda-clock-in '(16))
2377       (bh/clock-in-organization-task-as-default)))
2378     ;;
2379     ;; We are not in the agenda
2380     ;;
2381     (save-restriction
2382   (widen)
2383   ; Find the tags on the current task
2384   (if (and (equal major-mode 'org-mode) (not (org-before-first-heading-p)) (eq arg 4))
2385       (org-clock-in '(16))
2386     (bh/clock-in-organization-task-as-default)))))
2387
2388 (defun bh/punch-out ()
2389   (interactive)
2390   (setq bh/keep-clock-running nil)
2391   (when (org-clock-is-active)
2392     (org-clock-out))
2393   (org-agenda-remove-restriction-lock))
2394
2395 (defun bh/clock-in-default-task ()
2396   (save-excursion
2397     (org-with-point-at org-clock-default-task
2398   (org-clock-in))))
2399
2400 (defun bh/clock-in-parent-task ()
2401   "Move point to the parent (project) task if any and clock in"
2402   (let ((parent-task))
2403     (save-excursion
2404   (save-restriction
2405     (widen)
2406     (while (and (not parent-task) (org-up-heading-safe))
2407       (when (member (nth 2 (org-heading-components)) org-todo-keywords-1)
2408         (setq parent-task (point))))
2409     (if parent-task
2410         (org-with-point-at parent-task
2411       (org-clock-in))
2412       (when bh/keep-clock-running
2413         (bh/clock-in-default-task)))))))
2414
2415 (defvar bh/organization-task-id "e22cb8bf-07c7-408b-8f60-ff3aadac95e4")
2416
2417 (defun bh/clock-in-organization-task-as-default ()
2418   (interactive)
2419   (org-with-point-at (org-id-find bh/organization-task-id 'marker)
2420     (org-clock-in '(16))))
2421
2422 (defun bh/clock-out-maybe ()
2423   (when (and bh/keep-clock-running
2424          (not org-clock-clocking-in)
2425          (marker-buffer org-clock-default-task)
2426          (not org-clock-resolving-clocks-due-to-idleness))
2427     (bh/clock-in-parent-task)))
2428
2429 ; (add-hook 'org-clock-out-hook 'bh/clock-out-maybe 'append)
2430
2431 (require 'org-id)
2432 (defun bh/clock-in-task-by-id (id)
2433   "Clock in a task by id"
2434   (org-with-point-at (org-id-find id 'marker)
2435     (org-clock-in nil)))
2436
2437 (defun bh/clock-in-last-task (arg)
2438   "Clock in the interrupted task if there is one
2439 Skip the default task and get the next one.
2440 A prefix arg forces clock in of the default task."
2441   (interactive "p")
2442   (let ((clock-in-to-task
2443      (cond
2444       ((eq arg 4) org-clock-default-task)
2445       ((and (org-clock-is-active)
2446         (equal org-clock-default-task (cadr org-clock-history)))
2447        (caddr org-clock-history))
2448       ((org-clock-is-active) (cadr org-clock-history))
2449       ((equal org-clock-default-task (car org-clock-history)) (cadr org-clock-history))
2450       (t (car org-clock-history)))))
2451     (widen)
2452     (org-with-point-at clock-in-to-task
2453   (org-clock-in nil))))
2454
2455
2456 (defun org-export-to-ods ()
2457   (interactive)
2458   (let ((csv-file "data.csv"))
2459     (org-table-export csv-file "orgtbl-to-csv")
2460     (org-odt-convert csv-file "ods" 'open)))
2461
2462 ; allow for zero-width-space to be a break in regexp too
2463 ; (setcar org-emphasis-regexp-components " [:space:] \t('\"{")
2464 ; (setcar (nthcdr 1 org-emphasis-regexp-components) " [:space:]- \t.,:!?;'\")}\\")
2465 ; (org-set-emph-re 'org-emphasis-regexp-components org-emphasis-regexp-components)
2466
2467 ;; support inserting screen shots
2468 (defun my/org-insert-screenshot ()
2469   "Take a screenshot into a time stamped unique-named file in the
2470 same directory as the org-buffer and insert a link to this file."
2471   (interactive)
2472   (defvar my/org-insert-screenshot/filename)
2473   (setq my/org-insert-screenshot/filename
2474     (read-file-name
2475      "Screenshot to insert: "
2476      nil
2477      (concat (buffer-file-name) "_" (format-time-string "%Y%m%d_%H%M%S") ".png")
2478      )
2479     )
2480   (call-process "import" nil nil nil my/org-insert-screenshot/filename)
2481   (insert (concat "[[" my/org-insert-screenshot/filename "]]"))
2482   (org-display-inline-images))
2483
2484 (defun my/fix-inline-images ()
2485   (when org-inline-image-overlays
2486     (org-redisplay-inline-images)))
2487
2488 (add-hook 'org-babel-after-execute-hook 'my/fix-inline-images)
2489
2490 ;; use xelatex to preview with imagemagick
2491 (add-to-list 'org-preview-latex-process-alist
2492          '(xelateximagemagick
2493       :programs ("xelatex" "convert")
2494       :description "pdf > png"
2495       :message "you need to install xelatex and imagemagick"
2496       :use-xcolor t
2497       :image-input-type "pdf"
2498       :image-output-type "png"
2499       :image-size-adjust (1.0 . 1.0)
2500       :latex-compiler ("xelatex -interaction nonstopmode -output-directory %o %f")
2501       :image-converter ("convert -density %D -trim -antialias %f -quality 100 %O"))
2502          )
2503 ;; use xelatex by default
2504 (setq org-preview-latex-default-process 'xelateximagemagick)
2505
2506 ; from http://orgmode.org/Changes.html
2507 (defun my/org-repair-property-drawers ()
2508   "Fix properties drawers in current buffer.
2509  Ignore non Org buffers."
2510   (interactive)
2511   (when (eq major-mode 'org-mode)
2512     (org-with-wide-buffer
2513      (goto-char (point-min))
2514      (let ((case-fold-search t)
2515        (inline-re (and (featurep 'org-inlinetask)
2516                (concat (org-inlinetask-outline-regexp)
2517                    "END[ \t]*$"))))
2518    (org-map-entries
2519     (lambda ()
2520       (unless (and inline-re (org-looking-at-p inline-re))
2521         (save-excursion
2522       (let ((end (save-excursion (outline-next-heading) (point))))
2523         (forward-line)
2524         (when (org-looking-at-p org-planning-line-re) (forward-line))
2525         (when (and (< (point) end)
2526                (not (org-looking-at-p org-property-drawer-re))
2527                (save-excursion
2528                  (and (re-search-forward org-property-drawer-re end t)
2529                   (eq (org-element-type
2530                    (save-match-data (org-element-at-point)))
2531                   'drawer))))
2532           (insert (delete-and-extract-region
2533                (match-beginning 0)
2534                (min (1+ (match-end 0)) end)))
2535           (unless (bolp) (insert "\n"))))))))))))
2536
2537 #+END_SRC
2538 ** Org-Gcal
2539 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2540 (use-package calfw
2541   :ensure f
2542   )
2543 (use-package calfw-org
2544   :ensure f
2545   )
2546 (use-package org-gcal
2547   :if (file-readable-p "~/.hide/org_gcal.el")
2548   :ensure f
2549   :config '((if (file-readable-p "~/.hide/org_gcal.el")
2550                 (load-file "~/.hide/org_gcal.el"))
2551             )
2552   )
2553 #+END_SRC
2554 ** appt integration
2555 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2556 (use-package appt
2557   :straight nil
2558   :config
2559   ;; Show notification 10 minutes before event
2560   (setq appt-message-warning-time 10)
2561   ;; Disable multiple reminders
2562   (setq appt-display-interval appt-message-warning-time)
2563   (setq appt-display-mode-line nil)
2564
2565   ;; add automatic reminders for appointments
2566   (defun my/org-agenda-to-appt ()
2567     (interactive)
2568     (setq appt-time-msg-list nil)
2569     (org-agenda-to-appt))
2570   ;; add reminders when starting emacs
2571   (my/org-agenda-to-appt)
2572   ;; when rebuilding the agenda
2573   (defadvice  org-agenda-redo (after org-agenda-redo-add-appts)
2574     "Pressing `r' on the agenda will also add appointments."
2575     (my/org-agenda-to-appt)
2576     )
2577   ;; when saving all org buffers
2578   (defadvice org-save-all-org-buffers (after org-save-all-org-buffers-add-appts)
2579     "Re-add appts after saving all org buffers"
2580     (my/org-agenda-to-appt))
2581   ;; Display appointments as a window manager notification
2582   (setq appt-disp-window-function 'my/appt-display)
2583   (setq appt-delete-window-function (lambda () t))
2584
2585   (setq my/appt-notification-app (concat (getenv "HOME") "/bin/appt_notification"))
2586
2587   (defun my/appt-display (min-to-app new-time msg)
2588     (if (atom min-to-app)
2589     (start-process "my/appt-notification-app" nil my/appt-notification-app min-to-app msg)
2590   (dolist (i (number-sequence 0 (1- (length min-to-app))))
2591     (start-process "my/appt-notification-app" nil my/appt-notification-app
2592              (nth i min-to-app) (nth i msg))))
2593     )
2594   )
2595
2596
2597 #+END_SRC
2598 ** End use-package
2599 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2600   )
2601 #+END_SRC
2602 * Keybindings
2603 ** Home/End Begining/End of line
2604 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2605   (global-set-key [home] 'move-beginning-of-line)
2606   (global-set-key [end] 'move-end-of-line)
2607 #+END_SRC
2608 ** Goto line
2609 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2610   ; (global-unset-key "\M-g")
2611   ; (global-set-key (kbd "M-g l") 'goto-line)
2612 #+END_SRC
2613 * Debian
2614 ** debian-changelog
2615 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2616 (use-package debian-changelog-mode
2617   :mode "debian/changelog"
2618   :ensure debian-el
2619   :config
2620   (setq debian-changelog-mailing-address "don@debian.org")
2621   (setq debian-changelog-full-name "Don Armstrong"))
2622 #+END_SRC
2623 * Misc (uncharacterized)
2624 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2625   (setq calendar-latitude 38.6)
2626   (setq calendar-longitude -121.5)
2627   (setq case-fold-search t)
2628   (setq confirm-kill-emacs (quote y-or-n-p))
2629
2630 #+END_SRC
2631 ** Turn on fontlock
2632 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2633   (global-font-lock-mode 1)
2634 #+END_SRC
2635 ** PS Printing
2636 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2637   (setq ps-footer-font-size (quote (8 . 10)))
2638   (setq ps-header-font-size (quote (8 . 10)))
2639   (setq ps-header-title-font-size (quote (10 . 10)))
2640   (setq ps-line-number-color "blue")
2641   (setq ps-print-footer t)
2642   (setq ps-print-footer-frame nil)
2643   (setq ps-print-only-one-header t)
2644 #+END_SRC
2645 ** Only single spacing on sentences
2646 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2647   (setq sentence-end "[.?!][]\"')]*\\($\\|   \\| \\)[
2648   ]*")
2649   (setq sentence-end-double-space nil)
2650   ; enable matching parenthesis
2651 #+END_SRC
2652 ** Display paren mode
2653 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2654   (show-paren-mode 1)
2655   (setq show-paren-delay 0.2)
2656
2657 #+END_SRC
2658 ** My Username
2659 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2660   (setq user-mail-address "don@donarmstrong.com")
2661
2662 #+END_SRC
2663 ** Use primary selection on unix machines
2664 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2665 ;; switch back to the old primary selection method
2666 (if (or (string-equal system-type "darwin")
2667         (string-equal system-type "windows")
2668         )
2669     (progn
2670       (setq select-enable-clipboard t)
2671       (setq select-enable-primary nil)
2672       )
2673   (progn
2674     (setq select-enable-clipboard nil)
2675     (setq select-enable-primary t)
2676     ))
2677 ; (setq mouse-drag-copy-region t)
2678
2679 (setq-default c-indent-level 4)
2680 (setq-default c-brace-imaginary-offset 0)
2681 (setq-default c-brace-offset -4)
2682 (setq-default c-argdecl-indent 4)
2683 (setq-default c-label-offset -4)
2684 (setq-default c-continued-statement-offset 4)
2685 ; tabs are annoying
2686 (setq-default indent-tabs-mode nil)
2687 (setq-default tab-width 4)
2688
2689 (defun insert-date ()
2690   "Insert date at point."
2691   (interactive)
2692   (insert (format-time-string "%A, %B %e, %Y %k:%M:%S %Z")))
2693 (global-set-key "\C-[d" 'insert-date)
2694
2695 (defun unfill-paragraph (arg)
2696   "Pull this whole paragraph up onto one line."
2697   (interactive "*p")
2698   (let ((fill-column 10000))
2699     (fill-paragraph arg))
2700   )
2701
2702 (column-number-mode t)
2703
2704 #+END_SRC
2705 ** Desktop-save-mode
2706 If the envvar EMACS_SERVER_NAME is set, consider this a separate
2707 emacs, and use a different desktop file to restore history
2708 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2709 (use-package desktop
2710   :demand
2711   :config
2712   (setq desktop-base-file-name
2713         (convert-standard-filename
2714          (concat ".emacs"
2715                  (or (getenv "EMACS_SERVER_NAME")
2716                      "")
2717                  ".desktop")
2718          ))
2719   (setq desktop-base-lock-name
2720         (convert-standard-filename
2721          (concat desktop-base-file-name
2722                  ".lock")))
2723   (setq desktop-auto-save-timeout 60)
2724   (setq desktop-restore-eager 5)
2725   (setq desktop-lazy-verbose nil)
2726   (desktop-save-mode 1)
2727   ; (desktop-read)
2728 )
2729 #+END_SRC
2730 ** Misc (Uncharacterized)
2731 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2732
2733 (put 'upcase-region 'disabled nil)
2734 (put 'downcase-region 'disabled nil)
2735 (put 'narrow-to-region 'disabled nil)
2736
2737 ; fix up tmux xterm keys
2738 ; stolen from http://unix.stackexchange.com/questions/24414/shift-arrow-not-working-in-emacs-within-tmux
2739 (defun fix-up-tmux-keys ()
2740     "Fix up tmux xterm keys"
2741     (if (getenv "TMUX")
2742         (progn
2743           (let ((x 2) (tkey ""))
2744             (while (<= x 8)
2745               ;; shift
2746               (if (= x 2)
2747                   (setq tkey "S-"))
2748               ;; alt
2749               (if (= x 3)
2750                   (setq tkey "M-"))
2751               ;; alt + shift
2752               (if (= x 4)
2753                   (setq tkey "M-S-"))
2754               ;; ctrl
2755               (if (= x 5)
2756                   (setq tkey "C-"))
2757               ;; ctrl + shift
2758               (if (= x 6)
2759                   (setq tkey "C-S-"))
2760               ;; ctrl + alt
2761               (if (= x 7)
2762                   (setq tkey "C-M-"))
2763               ;; ctrl + alt + shift
2764               (if (= x 8)
2765                   (setq tkey "C-M-S-"))
2766
2767               ;; arrows
2768               (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d A" x)) (kbd (format "%s<up>" tkey)))
2769               (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d B" x)) (kbd (format "%s<down>" tkey)))
2770               (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d C" x)) (kbd (format "%s<right>" tkey)))
2771               (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d D" x)) (kbd (format "%s<left>" tkey)))
2772               ;; home
2773               (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d H" x)) (kbd (format "%s<home>" tkey)))
2774               ;; end
2775               (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d F" x)) (kbd (format "%s<end>" tkey)))
2776               ;; page up
2777               (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 5 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<prior>" tkey)))
2778               ;; page down
2779               (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 6 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<next>" tkey)))
2780               ;; insert
2781               (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 2 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<delete>" tkey)))
2782               ;; delete
2783               (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 3 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<delete>" tkey)))
2784               ;; f1
2785               (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d P" x)) (kbd (format "%s<f1>" tkey)))
2786               ;; f2
2787               (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d Q" x)) (kbd (format "%s<f2>" tkey)))
2788               ;; f3
2789               (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d R" x)) (kbd (format "%s<f3>" tkey)))
2790               ;; f4
2791               (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d S" x)) (kbd (format "%s<f4>" tkey)))
2792               ;; f5
2793               (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 15 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f5>" tkey)))
2794               ;; f6
2795               (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 17 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f6>" tkey)))
2796               ;; f7
2797               (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 18 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f7>" tkey)))
2798               ;; f8
2799               (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 19 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f8>" tkey)))
2800               ;; f9
2801               (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 20 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f9>" tkey)))
2802               ;; f10
2803               (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 21 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f10>" tkey)))
2804               ;; f11
2805               (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 23 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f11>" tkey)))
2806               ;; f12
2807               (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 24 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f12>" tkey)))
2808               ;; f13
2809               (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 25 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f13>" tkey)))
2810               ;; f14
2811               (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 26 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f14>" tkey)))
2812               ;; f15
2813               (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 28 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f15>" tkey)))
2814               ;; f16
2815               (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 29 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f16>" tkey)))
2816               ;; f17
2817               (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 31 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f17>" tkey)))
2818               ;; f18
2819               (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 32 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f18>" tkey)))
2820               ;; f19
2821               (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 33 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f19>" tkey)))
2822               ;; f20
2823               (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 34 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f20>" tkey)))
2824
2825               (setq x (+ x 1))
2826               ))
2827           )
2828       )
2829     )
2830 ; (add-hook 'tty-setup-hook 'fix-up-tmux-keys)
2831
2832 (defadvice ask-user-about-supersession-threat (around ask-user-about-supersession-threat-if-necessary)
2833   "Call ask-user-about-supersession-threat only if the buffer is actually obsolete."
2834   (if (or (buffer-modified-p)
2835           (verify-visited-file-modtime)
2836           (< (* 8 1024 1024) (buffer-size))
2837           (/= 0 (call-process-region 1 (+ 1 (buffer-size)) "diff" nil nil nil "-q" (buffer-file-name) "-")))
2838       ad-do-it
2839     (clear-visited-file-modtime)
2840     (not-modified)))
2841 (ad-activate 'ask-user-about-supersession-threat)
2842 #+END_SRC
2843
2844 * Start Server
2845 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2846   (use-package server
2847     :config
2848     (setq server-name
2849           (or (getenv "EMACS_SERVER_NAME")
2850               "server"))
2851     (unless (server-running-p)
2852       ; (global-set-key "\C-xp" 'server-edit)
2853       (server-start)))
2854 #+END_SRC
2855
2856 * END
2857 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2858 (provide 'don-configuration)
2859 #+END_SRC