schema/extra_schema/intron_exon_schema_indexes.sql

   1 CREATE UNIQUE INDEX ON contigs(gi);
   2 CREATE INDEX ON contigs(feature_name);
   3 CREATE INDEX ON contigs(chr);
   4
   5 CREATE UNIQUE INDEX ON exons(gi,number);
   6 CREATE UNIQUE INDEX ON exons(accession,accession_ver,number);
   7 CREATE INDEX ON exons(accession);
   8
   9 CREATE UNIQUE INDEX ON cds(gi,number);
  10 CREATE UNIQUE INDEX ON cds(accession,accession_ver,number);
  11 CREATE INDEX ON cds(accession);
  12
  13 CREATE INDEX ON cds(accession);
  14 CREATE INDEX ON cds(gene);
  15 CREATE INDEX ON cds(start);
  16 CREATE INDEX ON cds(stop);
  17 CREATE INDEX ON cds(gi);
  18 CREATE INDEX ON cds(start,stop);
  19 CREATE INDEX ON cds(chr);
  20
  21 -- CREATE UNIQUE INDEX ON mrna(accession,ctg_gi,number);
  22 -- CREATE INDEX ON mrna(gi,number);
  23 -- CREATE INDEX ON mrna(accession,accession_ver,number);
  24 CREATE INDEX ON mrna(accession);
  25 CREATE INDEX ON mrna(gene);
  26 CREATE INDEX ON mrna(start);
  27 CREATE INDEX ON mrna(stop);
  28 CREATE INDEX ON mrna(gi);
  29 CREATE INDEX ON mrna(start,stop);
  30 CREATE INDEX ON mrna(chr);