]> git.donarmstrong.com Git - samtools.git/blobdiff - misc/Makefile
move seqtk to a separate project
[samtools.git] / misc / Makefile
index c8b89e6ac5991177941ff17bbc32af0b43c1a907..0a4854af4c285b6cd6fc748bee9834ed36c1b5ee 100644 (file)
@@ -4,7 +4,7 @@ CFLAGS=         -g -Wall -O2 #-m64 #-arch ppc
 CXXFLAGS=      $(CFLAGS)
 DFLAGS=                -D_FILE_OFFSET_BITS=64
 OBJS=          
-PROG=          md5sum-lite md5fa maq2sam-short maq2sam-long ace2sam wgsim seqtk
+PROG=          md5sum-lite md5fa maq2sam-short maq2sam-long ace2sam wgsim
 INCLUDES=      -I..
 SUBDIRS=       .
 
@@ -30,9 +30,6 @@ lib:
 ace2sam:ace2sam.o
                $(CC) $(CFLAGS) -o $@ ace2sam.o -lz
 
-seqtk:seqtk.o
-               $(CC) $(CFLAGS) -o $@ seqtk.o -lm -lz
-
 wgsim:wgsim.o
                $(CC) $(CFLAGS) -o $@ wgsim.o -lm -lz
 
@@ -54,9 +51,6 @@ maq2sam-long:maq2sam.c
 md5fa.o:md5.h md5fa.c
                $(CC) $(CFLAGS) -c -I.. -o $@ md5fa.c
 
-seqtk.o:seqtk.c ../khash.h ../kseq.h
-               $(CC) $(CFLAGS) -c -I.. -o $@ seqtk.c
-
 wgsim.o:wgsim.c ../kseq.h
                $(CC) $(CFLAGS) -c -I.. -o $@ wgsim.c