]> git.donarmstrong.com Git - samtools.git/blobdiff - kaln.c
r579: after merging Peter's depad changes
[samtools.git] / kaln.c
diff --git a/kaln.c b/kaln.c
index 01efe2e69300ea520a0a4de3565fa7241528f581..9c0bbaa437ff5654d7a181b496bb9d58c9c30558 100644 (file)
--- a/kaln.c
+++ b/kaln.c
@@ -84,7 +84,7 @@ int aln_sm_qual[] = {
 ka_param_t ka_param_blast = {  5,  2,   5, 2, aln_sm_blast, 5, 50 };
 ka_param_t ka_param_aa2aa = { 10,  2,  10, 2, aln_sm_blosum62, 22, 50 };
 
-ka_param2_t ka_param2_qual  = { 35, 5, 35, 5, 35, 5, 0, 0, aln_sm_qual, 5, 50 };
+ka_param2_t ka_param2_qual  = { 37, 11, 37, 11, 37, 11, 0, 0, aln_sm_qual, 5, 50 };
 
 static uint32_t *ka_path2cigar32(const path_t *path, int path_len, int *n_cigar)
 {