]> git.donarmstrong.com Git - samtools.git/blobdiff - examples/Makefile
* samtools-0.1.8-12 (r692)
[samtools.git] / examples / Makefile
index 96a4e7ed96d14ebf38013ff60216d6cda25bfa49..2733a573ffbecc5a33599bb9e7425b7f9d3be994 100644 (file)
@@ -19,7 +19,7 @@ ex1a.bam:ex1.bam
 ex1b.bam:ex1.bam
                ../samtools view -h ex1.bam | awk 'BEGIN{FS=OFS="\t"}{if(/^@/)print;else{$$1=$$1"b";print}}' | ../samtools view -bS - > $@
 ex1f.rg:
-               (echo "@RG      ID:ex1  LB:ex1"; echo "@RG      ID:ex1a LB:ex1"; echo "@RG      ID:ex1b LB:ex1b") > $@
+               (echo "@RG      ID:ex1  LB:ex1  SM:ex1"; echo "@RG      ID:ex1a LB:ex1  SM:ex1"; echo "@RG      ID:ex1b LB:ex1b SM:ex1b") > $@
 ex1f.bam:ex1.bam ex1a.bam ex1b.bam ex1f.rg
                ../samtools merge -rh ex1f.rg $@ ex1.bam ex1a.bam ex1b.bam
 ex1f-rmduppe.bam:ex1f.bam