]> git.donarmstrong.com Git - samtools.git/blobdiff - bam_mcns.h
calculate posterior allele frequency
[samtools.git] / bam_mcns.h
index 6d98de1320b57ebb695f33e73cd21aedfc4734d0..89879fbc0f9cb76e924b8911fdc74442bc513c88 100644 (file)
@@ -14,6 +14,7 @@ extern "C" {
        void mc_destroy(mc_aux_t *ma);
        double mc_freq0(int ref, int *n, const bam_pileup1_t **plp, mc_aux_t *ma, int *_ref, int *alt);
        double mc_freq_iter(double f0, mc_aux_t *ma);
+       double mc_freq_post(mc_aux_t *ma);
        double mc_ref_prob(mc_aux_t *ma);
        int mc_call_gt(const mc_aux_t *ma, double f0, int k);