* samtools-0.1.3-3 (r240)

[samtools.git] / bam_aux.c

diff --git a/bam_aux.c b/bam_aux.c
index f9be398f0e820d9b48b2002073039af1ebeb95d5..d6f18ea281712a7d89007d7d87291cbf13718c1b 100644 (file)
--- a/bam_aux.c
+++ b/bam_aux.c
@@ -3,6 +3,21 @@
 #include "khash.h"
 KHASH_MAP_INIT_STR(s, int)
 
+void bam_aux_append(bam1_t *b, const char tag[2], char type, int len, uint8_t *data)
+{
+       int ori_len = b->data_len;
+       b->data_len += 3 + len;
+       b->l_aux += 3 + len;
+       if (b->m_data < b->data_len) {
+               b->m_data = b->data_len;
+               kroundup32(b->m_data);
+               b->data = (uint8_t*)realloc(b->data, b->m_data);
+       }
+       b->data[ori_len] = tag[0]; b->data[ori_len + 1] = tag[1];
+       b->data[ori_len + 2] = type;
+       memcpy(b->data + ori_len + 3, data, len);
+}
+
 uint8_t *bam_aux_get(bam1_t *b, const char tag[2])
 {
        uint8_t *s;