]> git.donarmstrong.com Git - samtools.git/blobdiff - bam.h
* samtools-0.1.5-5 (r395)
[samtools.git] / bam.h
diff --git a/bam.h b/bam.h
index 124817e71f50db325abe220be8420eeb1442ed84..64867f10733f6889c1a0e0fa7a61e8e2802c2407 100644 (file)
--- a/bam.h
+++ b/bam.h
@@ -509,6 +509,8 @@ extern "C" {
         */
        int bam_plbuf_push(const bam1_t *b, bam_plbuf_t *buf);
 
+       int bam_pileup_file(bamFile fp, int mask, bam_pileup_f func, void *func_data);
+
        struct __bam_lplbuf_t;
        typedef struct __bam_lplbuf_t bam_lplbuf_t;
 
@@ -523,9 +525,6 @@ extern "C" {
        /*! @abstract  bam_plbuf_push() equivalent with level calculated. */
        int bam_lplbuf_push(const bam1_t *b, bam_lplbuf_t *buf);
 
-       /*! @abstract  bam_plbuf_file() equivalent with level calculated. */
-       int bam_lpileup_file(bamFile fp, int mask, bam_pileup_f func, void *func_data);
-
        struct __bam_index_t;
        typedef struct __bam_index_t bam_index_t;