$(KNETFILE_O) bam_sort.o sam_header.o bam_reheader.o kprobaln.o
AOBJS= bam_tview.o bam_maqcns.o bam_plcmd.o sam_view.o \
bam_rmdup.o bam_rmdupse.o bam_mate.o bam_stat.o bam_color.o \
- bamtk.o kaln.o bam2bcf.o bam2bcf_indel.o errmod.o sample.o
+ bamtk.o kaln.o bam2bcf.o bam2bcf_indel.o errmod.o sample.o \
+ cut_target.o phase.o
PROG= samtools
INCLUDES= -I.
SUBDIRS= . bcftools misc
bam2bcf.o:bam2bcf.h errmod.h bcftools/bcf.h
bam2bcf_indel.o:bam2bcf.h
errmod.o:errmod.h
+phase.o:bam.h khash.h ksort.h
faidx.o:faidx.h razf.h khash.h
faidx_main.o:faidx.h razf.h