]> git.donarmstrong.com Git - org-ref.git/blobdiff - org-ref.org
space change
[org-ref.git] / org-ref.org
index 22cf65eb33096d11d0a2dc769acb44e40d3797d2..3a829c7516a6a0ecc427d4ff677946f8e750d91a 100644 (file)
@@ -12,6 +12,20 @@ This document is an experiment at creating a literate program to provide similar
 4. Exportable links to LaTeX
 5. Utility functions for dealing with bibtex files and org-files
 
+Some additional features include
+1. Get minibuffer messages for the cite/ref/label link under point
+
+With helm integration (default) you can:
+
+1. C-c ] to insert a citation link
+  in helm-bibtex
+   - Enter to insert or append citation(s)
+   - C-u Enter to insert an alternative cite link
+   - C-u C-u Enter to replace the citation at point
+2. C-u C-c ] to insert a ref link with helm completion
+3. C-u C-u C-c ] to insert a label with completion
+4. M-x org-ref to get a helm completion buffer with link checks, utilities and export options
+
 ** Header
 #+BEGIN_SRC emacs-lisp :tangle org-ref.el
 ;;; org-ref.el --- setup bibliography, cite, ref and label org-mode links.
@@ -917,17 +931,17 @@ The label link provides a way to create labels in org-mode. We make it clickable
 #+BEGIN_SRC emacs-lisp  :tangle org-ref.el
 (defun org-ref-count-labels (label)
   "Counts number of matches for label in the document"
-  (+ (count-matches (format "label:%s\\b[^-:]" label) (point-min) (point-max) t)
+  (+ (count-matches (format "label:%s\\b[^-:]" label) (point-min) (point-max))
      ;; for tblname, it is not enough to get word boundary
      ;; tab-little and tab-little-2 match then.
-     (count-matches (format "^#\\+tblname:\\s-*%s\\b[^-:]" label) (point-min) (point-max) t)
-     (count-matches (format "\\label{%s}\\b" label) (point-min) (point-max) t)
+     (count-matches (format "^#\\+tblname:\\s-*%s\\b[^-:]" label) (point-min) (point-max))
+     (count-matches (format "\\label{%s}" label) (point-min) (point-max))
      ;; this is the org-format #+label:
-     (count-matches (format "^#\\+label:\\s-*%s\\b[^-:]" label) (point-min) (point-max) t)
+     (count-matches (format "^#\\+label:\\s-*%s\\b[^-:]" label) (point-min) (point-max))
      (let ((custom-id-count 0))
        (org-map-entries
        (lambda ()
-         (when (string= label  (org-entry-get (point) "CUSTOM_ID"))
+         (when (string= label (org-entry-get (point) "CUSTOM_ID"))
            (setq custom-id-count (+ 1 custom-id-count)))))
        custom-id-count)))
 
@@ -935,7 +949,14 @@ The label link provides a way to create labels in org-mode. We make it clickable
  "label"
  (lambda (label)
    "on clicking count the number of label tags used in the buffer. A number greater than one means multiple labels!"
-   (message (format "%s occurences" (org-ref-count-labels label))))
+   (let ((count (org-ref-count-labels label)))
+   (message (format "%s occurence%s"
+                   count
+                   (if (or (= count 0)
+                             (> count 1))
+                       "s"
+                     ""))
+                   (org-ref-count-labels label))))
  (lambda (keyword desc format)
    (cond
     ((eq format 'html) (format "(<label>%s</label>)" path))
@@ -1043,7 +1064,7 @@ It would be nice to use completion to enter a ref link, where a list of labels i
 
 #+BEGIN_SRC emacs-lisp :tangle org-ref.el
 (defun org-ref-get-org-labels ()
- "find #+LABEL: labels"
+ "Return a list of #+LABEL: labels."
   (save-excursion
     (goto-char (point-min))
     (let ((matches '()))
@@ -1054,7 +1075,7 @@ matches)))
 
 #+BEGIN_SRC emacs-lisp :tangle org-ref.el
 (defun org-ref-get-custom-ids ()
- "return a list of custom_id properties in the buffer"
+ "Return a list of custom_id properties in the buffer."
  (let ((results '()) custom_id)
    (org-map-entries
     (lambda ()
@@ -1079,6 +1100,7 @@ Finally, we get the table names.
 
 #+BEGIN_SRC emacs-lisp :tangle org-ref.el
 (defun org-ref-get-tblnames ()
+  "Return list of table names in the buffer."
   (org-element-map (org-element-parse-buffer 'element) 'table
     (lambda (table)
       (org-element-property :name table))))
@@ -1088,41 +1110,100 @@ Now, we can put all the labels together which will give us a list of candidates.
 
 #+BEGIN_SRC emacs-lisp  :tangle org-ref.el
 (defun org-ref-get-labels ()
-  "returns a list of labels in the buffer that you can make a ref link to. this is used to auto-complete ref links."
+  "Returns a list of labels in the buffer that you can make a ref link to.
+This is used to auto-complete ref links and in helm menus."
   (save-excursion
     (save-restriction
       (widen)
       (goto-char (point-min))
       (let ((matches '()))
-       (while (re-search-forward "label:\\([a-zA-z0-9:-]*\\)" (point-max) t)
+        ;; these are the label:stuff  kinds
+       (while (re-search-forward "[^#+]label:\\([a-zA-z0-9:-]*\\)" (point-max) t)
          (add-to-list 'matches (match-string-no-properties 1) t))
-       (append matches (org-ref-get-org-labels) (org-ref-get-latex-labels) (org-ref-get-tblnames) (org-ref-get-custom-ids))))))
+       (append matches
+               (org-ref-get-org-labels)
+               (org-ref-get-latex-labels)
+               (org-ref-get-tblnames)
+               (org-ref-get-custom-ids))))))
 #+END_SRC
 
-Let us make a helm function to insert a label link. This will help you enter unique labels.
+Let us make a helm function to insert a label link. This will help you enter unique labels by showing matching labels until they are all gone and you are left with a unique one. If you are on a link, it means you want to replace it.
 #+BEGIN_SRC emacs-lisp :tangle org-ref.el
 (defun org-ref-helm-insert-label-link ()
-  "Insert a label link. helm just shows you what labels already exist."
+  "Insert a label link. helm just shows you what labels already exist.
+If you are on a label link, replace it."
   (interactive)
   (let* ((labels (org-ref-get-labels))
         (cb (current-buffer)))
     (helm :sources `(((name . "Existing labels")
                      (candidates . ,labels)
+                     ;; default action is to open to the label
                      (action . (lambda (label)
                                  ;; unfortunately I do not have markers here
-                                 (org-open-link-from-string (format "ref:%s" label)))))
+                                 (org-open-link-from-string (format "ref:%s" label))))
+                     ;; if you select a label, replace current one
+                     (action . (lambda (label)
+                                 (switch-to-buffer ,cb)
+                                 (cond
+                                  ;;  no prefix or on a link
+                                  ((equal helm-current-prefix-arg nil)
+                                   (let* ((object (org-element-context))
+                                          (last-char (save-excursion
+                                                       (goto-char (org-element-property :end object))
+                                                       (backward-char)
+                                                       (if (looking-at " ")
+                                                           " "
+                                                         ""))))
+                                     (when (-contains? '("label")
+                                                       (org-element-property :type object))
+                                         ;; we are on a link, so replace it.
+                                       (setf
+                                          (buffer-substring
+                                           (org-element-property :begin object)
+                                           (org-element-property :end object))
+                                          (concat
+                                           (replace-regexp-in-string
+                                            (org-element-property :path object)
+                                            label
+                                            (org-element-property :raw-link object))
+                                           last-char)))))
+                                  ;; no prefix options defined
+                                  ))))
+                    ;; no matching selection creates a new label
                     ((name . "Create new label")
                      (dummy)
+                     ;; default action creates a new label, or replaces old one
                      (action .  (lambda (label)
                                   (switch-to-buffer ,cb)
-                                  (insert
-                                   (concat
-                                    "label:"
-                                    (or label
-                                        helm-pattern))))))))))
-#+END_SRC
-
-Now we create the completion function. This works from the org-machinery, e.g. if you type C-c C-l to insert a link, and use completion by pressing tab.
+                                  (let* ((object (org-element-context))
+                                         (last-char (save-excursion
+                                                      (goto-char (org-element-property :end object))
+                                                      (backward-char)
+                                                      (if (looking-at " ")
+                                                          " "
+                                                        ""))))
+                                    (if (-contains? '("label")
+                                                    (org-element-property :type object))
+                                        ;; we are on a link, so replace it.
+                                        (setf
+                                         (buffer-substring
+                                          (org-element-property :begin object)
+                                          (org-element-property :end object))
+                                         (concat
+                                          (replace-regexp-in-string
+                                           (org-element-property :path object)
+                                           helm-pattern
+                                           (org-element-property :raw-link object))
+                                          last-char))
+                                      ;; new link
+                                      (insert
+                                       (concat
+                                        "label:"
+                                        (or label
+                                            helm-pattern))))))))))))
+#+END_SRC
+
+Now we create a completion function. This works from the org-machinery, e.g. if you type C-c C-l to insert a link, and use completion by pressing tab.
 
 #+BEGIN_SRC emacs-lisp  :tangle org-ref.el
 (defun org-ref-complete-link (&optional arg)
@@ -1145,17 +1226,25 @@ Another alternative ref insertion is to use helm.
 #+BEGIN_SRC emacs-lisp :tangle org-ref.el
 (defun org-ref-helm-insert-ref-link ()
   "Helm menu to insert ref links to labels in the document.
+If you are on link, replace with newly selected label.
 Use C-u to insert a different kind of ref link.
-C-u C-u to replace the current ref with selection"
+Use C-u C-u to insert a [[#custom-id]] link
+"
   (interactive)
   (let* ((labels (org-ref-get-labels))
-        (contexts (mapcar 'org-ref-get-label-context labels))
+        (bs (buffer-string))
+        (contexts (with-temp-buffer
+                    (insert bs)
+                    (mapcar 'org-ref-get-label-context labels)))
         (cb (current-buffer)))
 
-    (helm :sources `(((name . "Available labels to ref")
+    (helm :input (thing-at-point 'word)
+         :sources `(((name . "Available labels to ref")
                      (candidates . ,(loop for label in labels
                                           for context in contexts
-;; we do some kludgy adding spaces and bars to make it "easier" to see in helm.
+                                          ;; we do some kludgy adding spaces
+                                          ;; and bars to make it "easier" to
+                                          ;; see in helm.
                                           collect (cons (concat
                                                          label "\n"
                                                          (mapconcat
@@ -1164,15 +1253,38 @@ C-u C-u to replace the current ref with selection"
                                                           (split-string context "\n")
                                                           "\n"
                                                           ) "\n\n") label)))
+                     ;; default action to replace or insert ref link.
                      (action . (lambda (label)
                                  (switch-to-buffer ,cb)
 
                                  (cond
-                                  ;;  no prefix
+                                  ;;  no prefix or on a link
                                   ((equal helm-current-prefix-arg nil)
-                                    (insert
-                                     (concat
-                                      "ref:" label)))
+                                   (let* ((object (org-element-context))
+                                          (last-char (save-excursion
+                                                       (goto-char (org-element-property :end object))
+                                                       (backward-char)
+                                                       (if (looking-at " ")
+                                                           " "
+                                                         ""))))
+                                     (if (-contains? '("ref" "eqref" "pageref" "nameref")
+                                                     (org-element-property :type object))
+                                         ;; we are on a link, so replace it.
+                                         (setf
+                                          (buffer-substring
+                                           (org-element-property :begin object)
+                                           (org-element-property :end object))
+                                          (concat
+                                           (replace-regexp-in-string
+                                            (org-element-property :path object)
+                                            label
+                                            (org-element-property :raw-link object))
+                                           last-char))
+                                       ;; insert a new link
+                                       (insert
+                                        (concat
+                                         "ref:" label))
+                                       )))
                                   ;; one prefix, alternate ref link
                                   ((equal helm-current-prefix-arg '(4))
                                    (insert
@@ -1181,29 +1293,12 @@ C-u C-u to replace the current ref with selection"
                                                       (candidates . ("ref" "eqref" "pageref" "nameref"))
                                                       (action . (lambda (x) x))))
                                      ":" label)))
-                                  ;; two prefixes, replace current label
+                                  ;; two prefixes, insert section custom-id link
                                   ((equal helm-current-prefix-arg '(16))
-                                   ;; get link
-                                   (let* ((object (org-element-context))
-                                          (last-char (save-excursion
-                                                       (goto-char (org-element-property :end object))
-                                                       (backward-char)
-                                                       (if (looking-at " ")
-                                                           " "
-                                                         ""))))
-                                     (setf
-                                      (buffer-substring
-                                       (org-element-property :begin object)
-                                       (org-element-property :end object))
-                                      (concat
-                                       (replace-regexp-in-string
-                                        (org-element-property :path object)
-                                        label
-                                        (org-element-property :raw-link object))
-                                       last-char))))))))))))
-
-
-
+                                   (insert
+                                    (format "[[#%s]]" label)))
+                                  ))
+                             ))))))
 #+END_SRC
 
 #+RESULTS:
@@ -3011,14 +3106,6 @@ To get a lighter weight message about the label, ref and cite links, we define a
                        (progn
                          (forward-line 4)
                          (point)))))
-
-      ;; maybe we have a CUSTOM-ID
-      (org-map-entries
-       (lambda () (when (string=
-                        label
-                        (org-entry-get (point) "CUSTOM_ID"))
-                   (throw 'result (org-get-heading)))))
-      (beep)
       (throw 'result "!!! NO CONTEXT FOUND !!!"))))
 
 
@@ -3036,19 +3123,24 @@ To get a lighter weight message about the label, ref and cite links, we define a
 
         ;; message some context about the label we are referring to
         ((string= type "ref")
-         (message (org-ref-get-label-context
-                   (org-element-property :path object))))
+         (message "%scount: %s"
+                  (org-ref-get-label-context
+                   (org-element-property :path object))
+                  (org-ref-count-labels
+                       (org-element-property :path object))))
 
         ((string= type "eqref")
-         (message (org-ref-get-label-context
-                   (org-element-property :path object))))
+         (message "%scount: %s"
+                  (org-ref-get-label-context
+                   (org-element-property :path object))
+                  (org-ref-count-labels
+                       (org-element-property :path object))))
 
         ;; message the count
         ((string= type "label")
          (let ((count (org-ref-count-labels
                        (org-element-property :path object))))
            ;; get plurality on occurrence correct
-            (when (> count 1) (beep))
            (message (concat
                      (number-to-string count)
                      " occurence"
@@ -3056,6 +3148,12 @@ To get a lighter weight message about the label, ref and cite links, we define a
                                (> count 1))
                        "s")))))
 
+        ((string= type "custom-id")
+         (save-excursion
+           (org-open-link-from-string
+            (format "[[#%s]]" (org-element-property :path object)))
+           (message "%s" (org-get-heading))))
+
          ;; check if the bibliography files exist.
         ((string= type "bibliography")
          (let* ((bibfile)
@@ -3064,24 +3162,26 @@ To get a lighter weight message about the label, ref and cite links, we define a
                 (link-string (org-element-property :path object))
                 (link-string-beginning)
                 (link-string-end))
-
            (save-excursion
              (goto-char (org-element-property :begin object))
              (search-forward link-string nil nil 1)
              (setq link-string-beginning (match-beginning 0))
              (setq link-string-end (match-end 0)))
 
+            ;; make sure we are in link and not before the :
+           (when (> link-string-beginning (point))
+             (goto-char link-string-beginning))
+
            ;; now if we have comma separated bibliographies
            ;; we find the one clicked on. we want to
            ;; search forward to next comma from point
            (save-excursion
-              (goto-char link-string-beginning)
              (if (search-forward "," link-string-end 1 1)
                  (setq key-end (- (match-end 0) 1)) ; we found a match
                (setq key-end (point)))) ; no comma found so take the point
+
            ;; and backward to previous comma from point
            (save-excursion
-              (goto-char link-string-beginning)
              (if (search-backward "," link-string-beginning 1 1)
                  (setq key-beginning (+ (match-beginning 0) 1)) ; we found a match
                (setq key-beginning (point)))) ; no match found
@@ -3091,7 +3191,6 @@ To get a lighter weight message about the label, ref and cite links, we define a
                   (buffer-substring key-beginning key-end)))
            (if (file-exists-p bibfile)
                (message "%s exists." bibfile)
-              (beep)
              (message "!!! %s NOT FOUND !!!" bibfile))))
         )))))
 #+END_SRC
@@ -3147,7 +3246,13 @@ In the helm-bibtex buffer, C-u will give you a helm menu to select a new link ty
 
 C-u C-u will change the key at point to the selected keys.
 "
-  (let* ((object (org-element-context)))
+  (let* ((object (org-element-context))
+        (last-char (save-excursion
+                     (goto-char (org-element-property :end object))
+                     (backward-char)
+                     (if (looking-at " ")
+                         " "
+                       ""))))
     (cond
      ;; case where we are in a link
      ((and (equal (org-element-type object) 'link)
@@ -3169,10 +3274,12 @@ C-u C-u will change the key at point to the selected keys.
               (replace-regexp-in-string
                (car (org-ref-get-bibtex-key-and-file)) ; key
                (mapconcat 'identity keys ",")          ; new keys
-               (org-element-property :raw-link object)
-               )
+               (org-element-property :raw-link object))
               ;; replace space at end to avoid collapsing into next word.
-              " ")))
+              last-char))
+       ;; and we want to go to the end of the new link
+       (goto-char
+        (org-element-property :end (org-element-context))))
        (t
        (message "Not found"))))
 
@@ -3204,11 +3311,19 @@ C-u C-u will change the key at point to the selected keys.
 (setq helm-bibtex-format-citation-functions
       '((org-mode . helm-bibtex-format-org-ref)))
 
-(defun org-ref-helm-insert-cite-link ()
-  "org-ref function to use helm on the bibliography defined in the org-file."
-  (interactive)
-  (let ((helm-bibtex-bibliography (org-ref-find-bibliography)))
-    (helm-bibtex)))
+(defun org-ref-helm-insert-cite-link (arg)
+  "org-ref function to use helm-bibtex to insert a citation link.
+With one prefix arg, insert a ref link.
+With two prefix args, insert a label link."
+  (interactive "P")
+  (cond
+   ((equal arg nil)
+     (let ((helm-bibtex-bibliography (org-ref-find-bibliography)))
+       (helm-bibtex)))
+   ((equal arg '(4))
+    (org-ref-helm-insert-ref-link))
+   ((equal arg '(16))
+    (org-ref-helm-insert-label-link))))
 
 (require 'helm-bibtex)
 
@@ -3242,7 +3357,6 @@ This code provides a helm interface to things you can do when you click on a cit
            (insert-file-contents bibfile)
            (bibtex-search-entry key)
            (org-ref-bib-citation)))
-      (beep)
       "!!! No entry found !!!" )))
 
 (defun org-ref-cite-candidates ()