#NEXUS [ Data from: Leache, A. D., and D. G. Mulcahy. 2007. Phylogeny, divergence times and species limits of spiny lizards (Sceloporus magister species group) in western North American deserts and Baja California. Mol. Ecol. 16:5216-5233 ] BEGIN DATA; DIMENSIONS NTAX=123 NCHAR=1606; FORMAT DATATYPE=DNA MISSING=? 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[1593] CAinCRF530 TCCTCATTCCAGTGAAA-ATGCCCTAG-CATAGCACAAATGGAGCAGGTATCAGGCACAATTACTAGCCCAAGACACCAAGCTTTGCCACACCCACACGGGTAATCAGCAGTGATAAACATTAAGCAATAAGCGAA-TACACCCAACCTG--TTTTAAAGCTTGACTTAGTTATGATTAAA-TAGGGCTGGTAAACCTCGTGCCAGCCACCGCGGTTATACGAGGAGCCCAAAGCAGCAGAAACTCGGCGTAAATAGTGGTTAGAAT-C-ATGCCAA-ACACTAAAAATTAAACCATATCCTAACCGTAAAACAAAGGATAAATGAAACCAAA-CACTTTTAAAAAC--AGGCAATTTGACCCACGAAAACTAAGAAACAAACTAGGATTAGATACCCTACTATGCTTAGTCGTTAATAAGATATTACACTACTAGAATATCCGCCAGAAAACTACGAGCGAAAAGCTTAAAACTCAAAGGACTTGGCGGTGCTCCATACCGACTTAGAGGAGCCTGTCCTATAATCGATACTCCACGATAAACCTCACCAGTCTTTGCCCAA-TCAGCCTATATACCGCCGTCACCAACCTACCTCATGAGAGAAAAATAGTAGGTGCAAAAGCC-TAACAGCTAGAACGTCAGGTCAAGGTGTAGCTAATAGACTGGAAGAGATGGGCTACATTTTTTAATATAAAACA-TAACGGCATGGTACCATGAAATTTCTACCCAAAGGAGGATTTAATAGTAAAATTAATAAGAAAATTAATTTTAAACACGATTCTCCTAAAACTAGGAGGTTATGGCATTATACGAATTACCATATTATTAGCCCCAATAACCCCAAAACTCTATTACCCTTTTATAATTCTAGCACTATGAGGCATCGTAATAACAAGCTCAATCTGCATACGACAAACAGATCTAAAATCACTAATTGCTTACTCATCAGTTAGCCACATGGGCCTGGTAATCTCAGCCTGCCTTATCCAAACACCCTGAAGCTTCACAGGAGCTGTAACTCTGATAATCGCCCACGGACTCACCTCATCCATACTATTCTGCCTAGCAAACACAAATTATGAACGAACCCACACCCGAACAATAATTCTCACACGTGGTTTTCAACTCATTCTTCCACTAATATCAACCTGATGACTGTTAGCAAATCTAACCAATATAGCACTGCCCCCATCCATCAACCTTATAGGAGAACTGATAATCATTATTTCACTATTCAACTGATCCACCCTTACAATCCTACTAACAGGTCTAGGAACACTAATCACAGCAATATATTCATTAAACATATTCCTAACCACACAACGAAACAAACTGACAATAAACATCAGCATTGCTGACCCAACCCATTCACGAGAACACCTTCTAATAACCATACATATAACACCCCTAATCCTCATTATTATAAAACCAGCCCTAATCTCAGGCCTGATCAACTGTTAGTATAGTTTAACAAAAACATTAGGCAGTGGCCCTAAAAACAGAAGTTTAATTCTTCTTACAGACCAAGAGGTGTTTTGAACACCAAGAACTGCTAATTCCTGTTACTGAAGTTAAAATCCTCAGACCTCTTACTTTTAAAGG [1591] CAinoDGM74 TCCTCATTCCAGTGAAAAATGCCCTAG-AACAGCACAAATGGAGCAGGTATCAGGCACAATTACTAGCCCAAGACACCAAGCTTTGCCACACCCACACGGGCAATCAGCAGTGATAAACATTAAGCAATAAGCGAA-CACACCTAATCTG--TTTTAAAGCTTGACTTAGTTATGATTAAA-TAGGGCTGGTAAACCTCGTGCCAGCCACCGCGGTTATACGAGGAGCCCAAAGCAGCAGAAACTCGGCGTAAATAGTGGTTAGAAT-C-ATGCCAA-ACACTAAAAATTAAACCATATCCTAACCGTAAAACAAAGGATAAATGAAACCAAA-CATTTTTAAAAAC--AGGCAATTTGACCCACGAAAACTAAGAAACAAACTAGGATTAGATACCCTACTATGCTTAGTCGTTAATAAGATATTACACTACTAGAATATCCGCCAGAAAACTACGAGCGAAAAGCTTAAAACTCAAAGGACTTGGCGGTGCTCCATACCGACTTAGAGGAGCCTGTCCTATAATCGATACTCCACGATAAACCTCACCAGTCTTTGCCCAA-TCAGCCTATATACCGCCGTCACCAACCTACCTCATGAGAGAAAAATAGTAGGTGCAAAAGCC-TAACAGCTAGAACGTCAGGTCAAGGTGTAGCTAATAGACTGGAAGAGATGGGCTACATTTTTTAATATAAAACA-TAACGGCACGGTACCATGAAATTTCTACCCAAAGGAGGATTTAATAGTAAAATTAATAAGAAAATTAATTTTAAACACG?TTCTCCTAAAACTAGGAGGTTATGGCATTATACGAATTACCATGTTACTAACCCCAATAACCCCAAAACTCTATTACCCCTTTATAATTCTAGCACTATGAGGCATCGTAATAACAAGCTCAATCTGCATACGACAAACAGATCTAAAATCACTAATTGCTTACTCATCAGTTAGCCACATGGGCCTGGTAATCTCAGCCTGCCTTATCCAAACACCCTGAAGCTTCACAGGAGCTGTAATTCTGATAATCGCCCACGGACTCACCTCATCCATACTATTCTGCCTAGCAAACACAAATTATGAACGAACCCACACCCGAACAATAATTCTCACACGTGGTTTCCAACTCATTCTTCCACTAATATCGACCTGATGACTATTAGCAAATCTAACCAATATAGCACTACCCCCATCCATCAACCTTATAGGAGAATTAATAATCATTATTTCACTATTCAACTGATCCACCCTTACAATTCTACTAACAGGTCTAGGAACACTAATCACAGCAATATATTCATTAAACATATTCCTAACCACACAACGAAACAAACTGGCAATAAACATCAGCATTACCGACCCAACCCACTCACGAGAACACCTTCTAATAACCATACATATAACGCCCCTAATCCTCATTATTATAAAACCAGCCCTAATCTCAGGCCTGATCAACTGTTAGTATAGTTTAACAAAAACATTAGGCAGTGGCCCTAAAAACAGAAGTTCAATTCTTCTTACAGACCAAGAGGTGTTTTGAACACCGAGAACTGCTAATTCCTGTTACTGAAGTTAAAATCCTCAGACCTCTTACTTTTAAAGG [1592] CAinCRF529 TCCTCATTCCAGTGAAA-ATGCCCTAG-CATAGCACAAATGGAGCAGGTATCAGGCACAATTACTAGCCCAAGACACCAAGCTTTGCCACACCCACACGGGTAATCAGCAGTGATAAACATTAAGCAATAAGCGAA-TACACCCAACCTG--TTTTAAAGCTTGACTTAGTTATGATTAAA-TAGGGCTGGTAAACCTCGTGCCAGCCACCGCGGTTATACGAGGAGCCCAAAGCAGCAGAAACTCGGCGTAAATAGTGGTTAGAAT-C-ATGCCAA-ACACTAAAAATTAAACCATATCCTAACCGTAAAACAAAGGATAAATGAAACCAAA-CACTTTTAAAAAC--AGGCAATTTGACCCACGAAAACTAAGAAACAAACTAGGATTAGATACCCTACTATGCTTAGTCGTTAATAAGATATTACACTACTAGAATATCCGCCAGAAAACTACGAGCGAAAAGCTTAAAACTCAAAGGACTTGGCGGTGCTCCATACCGACTTAGAGGAGCCTGTCCTATAATCGATACTCCACGATAAACCTCACCAGTCTTTGCCCAA-TCAGCCTATATACCGCCGTCACCAACCTACCTCATGAGAGAAAAATAGTAGGTGCAAAAGCC-TAACAGCTAGAACGTCAGGTCAAGGTGTAGCTAATAGACTGGAAGAGATGGGCTACATTTTTTAATATAAAACA-TAACGGCATGGTACCATGAAATTTCTACCCAAAGGAGGATTTAATAGTAAAATTAATAAGAAAATTAATTTTAAACACGATTCTCCTAAAACTAGGAGGTTATGGCATTATACGAATTACCATATTATTAGCCCCAATAACCCCAAAACTCTATTACCCTTTTATAATTCTAGCACTATGAGGCATCGTAATAACAAGCTCAATCTGCATACGACAAACAGATCTAAAATCACTAATTGCTTACTCATCAGTTAGCCACATGGGCCTGGTAATCTCAGCCTGCCTTATCCAAACACCCTGAAGCTTCACAGGAGCTGTAACTCTGATAATCGCCCACGGACTCACCTCATCCATACTATTCTGCCTAGCAAACACAAATTATGAACGAACCCACACCCGAACAATAATTCTCACACGTGGTTTTCAACTCATTCTTCCACTAATATCAACCTGATGACTGTTAGCAAATCTAACCAATATAGCACTGCCCCCATCCATCAACCTTATAGGAGAACTGATAATCATTATTTCACTATTCAACTGATCCACCCTTACAATTCTACTAACAGGTCTAGGAACACTAATCACAGCAATATATTCATTAAACATATTCCTAACCACACAACGAAACAAACTGACAATAAACATCAGCATTGCTGACCCAACCCATTCACGAGAACACCTTCTAATAACCATACATATAACACCCCTAATCCTCATTATTATAAAACCAGCCCTAATCTCAGGCCTGATCAACTGTTAGTATAGTTTAACAAAAACATTAGGCAGTGGCCCTAAAAACAGAAGTTTAATTCTTCTTACAGACCAAGAGGTGTTTTGAACACCAAGAACTGCTAATTCCTGTTACTGAAGTTAAAATCCTCAGACCTCTTA?????????? [1591] CAkeDS2SP7 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[1592] CAmoJQR132 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[1591] CArvJOS138 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[1593] CAsdSWT701 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[1594] NMluGM947 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[1592] clarkii 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[1586] edwardti80 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[1584] smaragdnus 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