#NEXUS [ Data from: Jennings, W.B. and Edwards, S.V. Speciational history of Australian grass finches (Poephila) inferred from 30 gene trees. Evolution 59:2033-2047, 2005. This data set consists of 30 loci with one allele for each of three ingroup species and one outgroup species. ] Begin data; Dimensions ntax=4 nchar=16119; Format datatype=DNA gap=- missing=? matchchar=. interleave; Matrix Q097 TTCTTTTTGTCCTTTCACTAGAAAATCTTGGCTTATCTTCAAATACAAAAAAAAAAAGAAAAATTAACAGCATTTGAGTTTCAATACCGAGTATTTAAATAAATTTCAGTGTCACAAAAATACTGAAAAAATTAAAAAAAATTATATCTCTCAATACTGTGACTGAGGGTGTGACCATAATGAATAAAATTTGAACTTGGTCATAAGAACTAATGACTTTTAAGCTGATTTGCCCTTGAGAAAAAGACTGAAACTTAGGATAGCTTTGCCCAAGTGAAAACTCTAACCACAGAATATGCCAAGTTGGAAGGGGCCCATAAGGATCATCAAGCTTAACGCCTGTCTCCACACAGGACCAAGATTCTTTTCTTCAACTCTGTCAGGCTTGCTGCTGGAACCCTTCCCTGGGGAGCCTGTTCCAGTGCCCAACCACCCTCTAGGGGAAGAAACTTTTTCTTATATCCAACCTAAAC W097 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Q097 CATTTCTGCATCTTCTGCTTCTTGCTGAGTTGAGTTATAAAATATTAGAAAAGCCATATTGCACAGCTTTTAGCCACTAATATATATGTGCAATCTTAAATATCAACAGCTTCAGCCATTTTTTGTTAATGTTAGGTCTGGATGTGATTTCTTAACTAAAGACAGCTTCCTTAGCTTACCTCATATCATGGCATCTGGTATCTCTAATTGGAATCATTTTCATAATAACCATGAGCAATATACATTACCATCTAAATATGAAGGCTGACTGCAATACAGACTTGTCTACAGCTTTTTAAGTATCCAGGATCCTGTCCAAAGCCCCTTAGACTCGAGGGAAAGACTCCTGCTGATGTATCTTATTTAAATTAGGTGCAATGTACTAAAAAACTCTCCTAGATTCCATATAGGAAACCAGAAATCTATTCCATAATAGTAATAACAATAATCAGTGTAACTCTGTCAAACCCCTCCAAAGGTGGTGTCCCATTGTGTCACTAAATCAGGCCTAATTTAGTCA W097 CATTTCTGCATCTTCTGCTTCTTGCTGAGTTGAGTTATAAAATATTAGAAAAGCCATATTGCACAGCTTTTAGCCACTAATATATATGTGCAATCTTAAATATCAACAGCTTCAGCCATTTTTTGTTAATGTTAGGTCTGGATGTGATTTCTTAACTAAAGACAGCTTCCTTAGCTTACCTCATATCATGGCATCTGGTATCTCTAATTGGAATCATTTTCATAATAACCATGAGCAATATACATTACCATCTAAATATGAAGGCTGACTGCAATACAGACTTGTCTACAGCTTTTTAAGTATCCAGGATCCTGTCCAAAGCCCCTTAGACTCGAGGGAAAGACTCCTGCTGATATATCTTATTTAAATTAGGTGCAATGTATTAAAAAACTCTCCTAGATTCCATATAGGAAACCAGAAATCTATTCAATAATAGTAATAACAATAATCAGTGTAACTCTGTCAAACCCCTCCAAAGGTGGTGTCCCATTGTGTCACTAAATCAGGCCTAATTTAGTCA B097 CATTTCTGCATCTTCTGCTTCTTGCTGAGTTGAGTTATAAAATATTAGAAAAGCCATATTGCACAGCTTTTAGCCACTAATATATATGTGCAATCTTAAATATCAACAGCTTCAGCCATTTTTTGTTAATGTTAGGTCTGGATGTGATTTCTTAACTAAAGACAGCTTCCTTAGCTTACCTCATATCATGGCATCTGGTATCTCTAATTGGAATCATTTTCATAATAACCATGAGCAATATACATTACCATCTAAATATGAAGGCTGACTGCAATACAGACTTGTCTACAGCTTTTTAAGTATCCAGGATCCTGTCCAAAGCCCCTTAGACTCGAGGGAAAGACTCCTGCTGATATATCTTATTTAAATTAGGTGCAACGTACTAAAAAACTCTCCTAGATTCCATATAGGAAACCAGAAATCTATTCAATAATAGTAATAACAATAATCAGTGTAACTCTGTCAAACCCCTCCAAAGGTGGTGTCCCATTGTGTCACTAAATCAGGCCTAATTTAGTCA O097 CATTTCTGCATCTTCTGCTTCTTGCTGAGTTGAGTTATAAAATATTAGAAAAGCCATATTGCACAGCTTTTAGCCACTAATATATATGCGCAATCTTAAATATCAACAGCTTCAGCCATTTTTTGTTAATGTTAGGTCTGGATGTGATTTCTTAACTAAAGACAGCTTCCTTAGCTTACCTCATATCATGGCATCTGGTATCTCTAATTGGAATCATTTTCATAATAACCATGAGCAATATACATTACCATCTAAATATGAAGGCTGACTGCAATACAGACTTGTCTACAGCTTTTTAAGTATCCAGGATCCTGTCCAAAGCCCCTTAGACTCGAGGGAAAGACTCTTGCTGATATATCTTATTTAAATTAGGTGCAACGTATCAAAAAACTCTCCTAGATTCCATATAGGAAACCAGAAATCTATTCAATAATAGTAATAACAATAATCAGTGTAACTCTGTCTAACCCCTCCAAAGGTGGTGTCCCATTGTGTCACTAAATCAGGTCTAATTTAGTCA Q097 TGAATTCTTCTCAGTCTCCATTCGTTTGATAGCTTCCAAAATAAGGGTGGTATATGCCTTAGGTACTATATTTACCACAAGAAGGTCATTCCACAAAGCTGCTGGATCTCTCCATTGATCCAACTCTCGCCATTTGATACTCCTCCTGTTGTCTGTGAGACCAAAGAAACCACTAACATGAACTGGAAGTCCAGTTTTGCTTTCTTCACCTGGAGGCAAAGGCAGAAAACAGAAAGCTCTTCCTGAAAAGTCTGCTACAGCTCCATTTTCCTCCTCGTTAGCTGCTAAAGACATTGCTATTCCAATAGTAGGAACAAATTTCAAGTCATCAGCTAAACAATCCAGTTCTGTGCACATTCCTCGACCACCCACACAATTACACACTAACCAAGATGTTTTCTGTGCGTCCTTAACACTCTCATCTTCTACAACTATATTTACATGGTATGTCACACATGTTATGCTATTGCTTGGAACTCTCTTACAGTACTGATTTATTGCAGTTCCCAGGATTTTGATAGAATTGGGTCTTTCGTGTTTCAAGGCCTTGTTCTCGCTGGCAGTTACTCTAAACACCAGCCTCTCTGTTCCATCAGCTTCCCGAACGTGCAATGAAACATCCTGAACACTCTTCAGGAAAAGCAATAC W097 TGAATTCTTCTCAGTCTCCATTCGTTTGATAGCTTCCAAAATAAGGGTGGTATATGCCTTAGGTACTATATTTACCACAAGAAGGTCATTCCACAAAGCTGCTGGATCTCTCCATTGATCCAACTCTCGCCATTTGATACTCCTCCTGTTGTCTGTGAGACCAAAGAAACCACTAACATGAACTGGAAGTCCAGTTTTGCTTTCTTCACCTGGAGGCAAAGGCAGAAAACAGAAAGCTCTTCCTGAAAAGTCTGCTACAGCTCCATTTTCCTCCTCGTTAGCTGCTAAAGACATTGCTATTCCAATAGTAGGAACAAATTTCAAGTCATCAGCTAAACAATCCAGTTCTGTGCACATTCCTCGACCACCCACACAATTACACACTAACCAAGATGTTTTCTGTGCGTCCTTAACACTCTCATCTTCTACAACTATATTTACATGGTATGTCACACATGTTATGCTATTGCTTGGAACTCTCTTACAGTACTGATTTATTGCAGTTCCCAGGATTTTGATAGAATTGGGTCTTTCGTGTTTCAAGGCCTTGTTCTCGCTGGCAGTTACTCTAAACACCAGCCTCTCTGTTCCATCAGCTTCCCGAACGTGCAATGAAACATCCTGAACACTCTTCAGGAAAAGCAATAC B097 TGAATTCTTCTCAGTCTCCATTCGTTTGATAGCTTCCAAAATAAGGGTGGTATATGCCTTAGGTACTATATTTACCACAAGAAGGTCATTCCACAAAGCTGCTGGATCTCTCCATTGATCCAACTCTCGCCATTTGATACTCCTCCTGTTGTCTGTGAGACCAAAGAAACCACTAACATGAACTGGAAGTCCAGTTTTGCTTTCTTCACCTGGAGGCAAAGGCAGAAAACAGAAAGCTCTTCCTGAAAAGTCTGCTACAGCTCCATTTTCCTCCTCGTTAGCTGCTAAAGACATTGCTATTCCAATAGTAGGAACAAATTTCAAGTCATCAGCTAAACAATCCAGTTCTGTGCACATTCCTCGACCACCCACACAATTACACACTAACCAAGATGTTTTCTGTGCATCCTTAACACTCTCATCTTCTACAACTATATTTACATGGTATGTCACACATGTTATGCTATTGCTTGGAACTCTCTTACAGTACTGATTTATTGCAGTTCCCAGGATTTTGATAGAATTGGGTCTTTCGTGTTTCAAGGCCTTGTTCTCGCTGGCAGTTACTCTAAACACCAGCCTCTCTGTTCCATCAGCTTCCCGAACGTGCAATGAAACATCCTGAACACTCTTCAGGAAAAGCAATAC O097 ???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Q097 GGTGGCAAGAAAATCTACAAAGCTGTTATTTATTTATTTGTTTGTTTGTTTCCAGCCACCATCCTTGTAATTTTTCCTGTGCCTTAAGAAAAAAATCAGTATTCTTGCTCTGATCTTCTGAGAAGGTTTTCCTCCATTGTTTGATACTCGGTTTTGATTTTGCTCCAGTGACTTCTTGCTTTTGTTTAAAGTTCCAAGTTCTTAAAATCCAGAAAATCGCTTCTTGTTTTCTTCCAGATGTTGATCCAATAGTCAGGTATCTGCAGCTTCTCTTGACCCATCAGGTTGTTATTCTGTGACCCAAATCCCCAAGTCCCTCCCACTCACTGATGGTTTCCAAAATTTTCTGTAACGCTTCTTAAACATTTAAGAAATTATTTATGGAAATATGTTGCAAAAACTTAGTGTGTCTTCATGGTTTTAATGACGAACTCTGCAAATACAGCTTTGCTATGTGAAAAGGCTACTGCTTACAACAACATAGTCCTTGGGTCAGTAATTTCCAATCCCTGAGCAGGTTCGGTGATGAGAAATGCATAAATGTGGGTTTCTGATCCTGTGAGAAGCTGAGTGTTTTGATTCAGCCCATTCTCAAGCTGA W097 GGTGGCAAGAAAATCTACAAAGCTGTTATTTATTTATTTGTTTGTTTGTTTCTAGCCACCATCCTTGTAATTTTTCCTGTGCCTTAAGAAAAAAATCAGTATTCTTGCTCTGATCTTCTGAGAAGGTTTTCCTCCATTGCTTGATACTCGGTTTTGATTTTGCTCCAGTGACTTCTTGCTTTTGCTTAAAGTTCCAAGTTCTTAAAATCCAGAAAATCGCTTCTTGTTTTCTTCCAGATGTTGATCCAATAGTCAGGTATCTGCAGCTTCTCTTGACCCATCAGGTTGTTATTCTGTGACCCAAATCCCCAAGTCCCTCCCACTCACTGATGGTTTCCAAAATTTTCTGTAATGCTTCTTAAACATTTAAGAAATTATTTATGGAAATATGTTGCAAAAACTTAGTGTGTCTTCATGGTTTTAATGACGAACTCTGCAAATACAGCTTTGCTATGTGAAAAGGCTATTGCTTACAACAACATAGTCCTTGGGTCAGTAATTTCCAATCCCTGAGCAGGTTCGGTGATGAGAAATGCATAAATGTGGGTTTCTGATCCTGTGAGAAGCTGAGTGTTTTGATTCAGCCCATTCTCAAGCTGA B097 GGTGGCAAGAAAATCTACAAAGCTGTTATTTATTTGTTTGTTTGTTTGTTTCTAGCCACCATCCTTGTAATTTTTCCTGTGCCTTAAGAAAAAAATCAGTATTCTTGCTCTGATCTTCTGAGAAGGTTTTCCTCCATTGCTTGATACTCGGTTTTGATTTTGCTCCAGTGACTTCTTGCTTTTGCTTAAAGTTCCAAGTTCTTAAAATCCAGAAAATCGCTTCTTGTTTTCTTCCAGATGTTGATCCAATAGTCAGGTATCTGCAGCTTCTCTTGACCCATCAGGTTGTTATTCTGTGACCCAAATCCCCAAGTCCCTCCCACTCACTGATGGTTTCCAAAATTTTCTGTAATGCTTCTTAAACATTTAAGAAATTATTTATGGAAATATGTTGCAAAAACTTAGTGTGTCTTCATGGTTTTAATGACGAACTCTGCAAATACAGCTTTGCTATGTGAAAAGGCTATTGCTTACAACAACATAGTCCTTGGGTCAGTAATTTCCAATCCCTGAGCAGGTTCGGTGATGAGAAATGCATAAATGTGGGTTTCTGATCCTGTGAGAAGCTGAGTGTTTTGATTCAGCCCATTCTCAAGCTGA O097 GGTGGCAAGAAAATCTACAAAGCTGTTATTTATTTATTTGTTTGTTTGTTTCCAGCCACCATCCTTGTAATTTTTCCTGTGCCTTAAGAAAAAAATCAGTATTCTTGCTCTGATCTTCTGAGAAGATTTTCTTCCATTGCTTGATACTCGCTTTTGATTTTGCTCCAGTGACTTCTTGCTTTTGTTTAAAGTTCCAAGTTCTTAAAATCCAGAAAATCTCTTCTTGTTTTCTTCCAGGTGTTGATCCAATAGTCAGGTATCTGCAGCTTCTCTTGACCCATCAGATTGTTATTCTGTGACCCAAATCCCCAAGTCCCTCCCACTCACTGATGGTTTCCAAAATTTTCTGTAACGCTTCTTAAACATTTAAGAAATTATTTATGGAAATATATTGCAAAAACTTAATGTGTCTTCATGGTTTTAATGAGGAACTCTGCAAATACAGCTTTGCTGTGTGAAAAGGTTATTGCTTCCAACAACATAGTCCTTGGGTCAGTAATTTCCAATCCCTGAGCAGGTTCGGTGATGAGAAATGCATAAATGTGGGTTCCTGATCCTGTGAGAAGCTGAGTGTTTTGATTCAGCCCATTCTCAAGCTGA Q097 GCTGTAGAGTGCACAGCTCACCCTGGCATTCAGTGCATAGTGAAGGCAATTGCAAAAAACCAGCAGCTGCTCACTCCCAAACACAAGGCGCTGTCTATGTCCTTGCTTCCCGAGCAACTCAACGCAGCCCTTCTTTTCTGCAGCTGCCATCGAGTTCTCTGCATCTCGCAAGCTCAGGGCACGAACAAGAATTCTCCAGGACGTCTGCATTAGGACCAAGTCAAAACCCAGGAAAGTCGTCCTGTAACACCTGCCAGAAGCATGCCAGTGGTGAATTGAAAGGGCAGGCAGCTGCAGCCACCGTCGTCTAGCAGTGCCAAGGCTGCGCACACAAGCCG W097 GCTGTAGAGTGCACAGCTCATCCTGGCATTCAGTGCACAGTGAAGGCAATTGCAAAAAACCAGCAGCTGCTCACTCCCAAACACAAGGCGCTGTCTATGTCCTTGCTTCCCGAGCAACTCAGCGCAGCCCTTCATTTCTGCAGCTGCCATCGAGTTCTCTGCATCTCAGAAGCTCAGGGCACGAACAAGAATTCTCCAGGACATCTGCATTAGGACCAAGTCAAAACCCAGGAAAGTCGTCCTGGAACACCTGCCAGAAGAATGCCAGTAGTGAATTGAAAGGGCAGGCAGTTGCAGCCACCGTCCTCTAGCAGTGCCAAGGCATCGCACACAAGCCG B097 GCTGTAGAGTGCACAGCTCATCCTGGCATTCAGTGCACAGTGAAGACAATTGCAAAAAACCAGCAGCTGCTCACTCCCAAACACAAGGCGCTGTCTATGTCCTTGCTTCCCGAGCAACTCAGCGCAGCCCTTCATTTCTGCAGCTGCCATCGAGTTCTCTGCATCTCAGAAGCTCAGGGCACGAACAAGAATTCTCCAGGACGTCTGCATCAGGACCAAGTCAAAACCCAGGAAAGTCGTCCTGGAACACCCGCCAGAAGCATGCCAGTGGTGAATTGAAAGAGCAGGCAGCTGCAGCCACCCTCCTCTAGCAGTGCCAAGGCATCGCACACAAGCCG O097 GTAGAGGAGTGCACAGCTCCACCTGACATTCAGTGCACAGCGAAGTCAACTGCAAAAAACCAGCAGCTGCTCACTCCCAAACACTAAGCGCTGTTAATGTCCTTGCTTCCTGAGCGACTCAGCACAGCCCTTCTTTTCTGTAGCTGCCATCGATATCTCTGCAACTCGTAAACTCAGGGTACGAACAAGAATTCTCCAGATCGTCTGCATCAGGACCAAGTCGAAACCCAGGAAAGTCGTCCTGGAGCACCTGCCAGAAGCATGCCAGAGGTGAACTGAAAGGGCTGGCAGCTGCAGCCACCGTCCTCTAACAGTACCGAGGCAGCGCACACAAGCCG Q097 ATCAAGTGTTCTGACTTTTTGAGATATTGAGCAAGATAAATTAAAAGCAAGGTGATTATGCAAAATATTGCTAGTATTTCCTCTAGTAAGAGTAATGCTTCTTGCAGCAAATGAGGGAATCTGTGAATGTGTCTTGGGATTTTCAAATACCAATTCTAAAGAATGGAGTCTAACTGAAAGGATTTCTCCTGCTTCCTTGTTTTGGCTATTGCTTGA W097 ATCAAGTGTTCTGACTTTTTGAGATATTGAGCAAGATAAATTAAAAGCAAGGTGATTATGCAAAATATTGCTAGTATTTCCACTAGTAAGAGTAATGCTTCTTGCAGCAAATGAGGGAATCTGTGAATGCGTCTTGGGATTTTCAAATACCAATTCTAAAGAATGGAGTCTAACTGAAAGGATTTCTCCTGCTTCCTTGTTTTGGCTATTGCTTGA B097 ATCAAGTGTTCTGACTTTTTGAGATATTGAGCAAGATAAATTAAAAGCAAGGTGATTATGCAAAATATTGCTAGTATTTCCACTAGTAAGAGTAATGCTTCTTGCAGCAAATGAGGGAATCTGTGAATGCGTCTTGGGATTTTCAAATACCAATTCTAAAGAATGGAGTCTAACTGAAAGGATTTCTCCTGCTTCCTTGTTTTGGCTATTGCTTGA O097 ATCAAGTGTTCTGACTTTTTGAGATATTGAGCAAGATAAATTAAAAGCAAGGTGATTATGCAAAATATTGCTAGTATTTCCACTAGTAAGAGTAATGCTTCTTGCAGCAAATGAGGGAATCTGTGAATGTGTCTTGGGATTTTCAAATACCAATTCTAAAGAATGGAGTCTAACTGAAAGGATTTCTCCTGCTTCCTTGTTTTGATTATTGCTTGA ; 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