raredisplay.h

   1 #ifndef RAREDISPLAY_H
   2 #define RAREDISPLAY_H
   3
   4 #include "sabundvector.hpp"
   5 #include "calculator.h"
   6 #include "fileoutput.h"
   7 #include "display.h"
   8
   9 /***********************************************************************/
  10
  11 class RareDisplay : public Display {
  12
  13 public:
  14         RareDisplay(Calculator* calc, FileOutput* file) : estimate(calc), output(file), nIters(1) {};
  15         ~RareDisplay()                                  {       delete estimate; delete output;         };
  16         void init(string);
  17         void reset();
  18         void update(SAbundVector*);
  19         void update(vector<SharedRAbundVector*> shared, int numSeqs, int numGroupComb);
  20         void close();
  21         bool isCalcMultiple() { return estimate->getMultiple(); }
  22
  23         void outputTempFiles(string);
  24         void inputTempFiles(string);
  25
  26 private:
  27         Calculator* estimate;
  28         FileOutput* output;
  29         string label;
  30         map<int, vector<double> > results; //maps seqCount to results for that number of sequences
  31         int nIters;
  32 };
  33
  34 #endif
  35