qFinderDMM.h

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   2 //  qFinderDMM.h
   3 //  pds_dmm
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   5 //  Created by Patrick Schloss on 11/8/12.
   6 //  Copyright (c) 2012 University of Michigan. All rights reserved.
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   9 #ifndef pds_dmm_qFinderDMM_h
  10 #define pds_dmm_qFinderDMM_h
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  12 #include "communitytype.h"
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  14 /**************************************************************************************************/
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  16 class qFinderDMM : public CommunityTypeFinder {
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  18 public:
  19     qFinderDMM(vector<vector<int> >, int);
  20     void printFitData(ofstream&);
  21     void printFitData(ostream&, double);
  22
  23 private:
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  25     void optimizeLambda();
  26     void calculatePiK();
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  28     double negativeLogEvidenceLambdaPi(vector<double>&);
  29     void negativeLogDerivEvidenceLambdaPi(vector<double>&, vector<double>&);
  30     double getNegativeLogEvidence(vector<double>&, int);
  31     double getNegativeLogLikelihood();
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  34     int lineMinimizeFletcher(vector<double>&, vector<double>&, double, double, double, double&, double&, vector<double>&, vector<double>&);
  35     int bfgs2_Solver(vector<double>&);//, double, double);
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  40 };
  41
  42 /**************************************************************************************************/
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  44 #endif