logsd.h

   1 #ifndef LOGSD_H
   2 #define LOGSD_H
   3
   4 /*
   5  *  logsd.h
   6  *  Mothur
   7  *
   8  *  Created by Thomas Ryabin on 2/23/09.
   9  *  Copyright 2009 Schloss Lab UMASS Amherst. All rights reserved.
  10  *
  11  */
  12 #include "calculator.h"
  13
  14 /*This class implements the LogSD estimator on single group.
  15 It is a child of the calculator class.*/
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  17 /***********************************************************************/
  18
  19 class LogSD : public Calculator  {
  20
  21 public:
  22
  23         LogSD() : Calculator("logseries", 3, false) {};
  24         EstOutput getValues(SAbundVector*);
  25         EstOutput getValues(vector<SharedRAbundVector*>) {return data;};
  26         string getCitation() { return "http://www.mothur.org/wiki/LogSeries"; }
  27
  28 private:
  29         double logS(double);
  30         RAbundVector rdata;
  31 };
  32
  33 /***********************************************************************/
  34
  35 #endif
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  39
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