knn.h

   1 #ifndef KNN_H
   2 #define KNN_H
   3
   4 /*
   5  *  knn.h
   6  *  Mothur
   7  *
   8  *  Created by westcott on 11/4/09.
   9  *  Copyright 2009 Schloss Lab. All rights reserved.
  10  *
  11  */
  12
  13 #include "mothur.h"
  14 #include "classify.h"
  15
  16 /**************************************************************************************************/
  17
  18 class Knn : public Classify {
  19
  20 public:
  21         Knn(string, string, string, int, float, float, float, float, int, int);
  22         ~Knn();
  23
  24         void setDistName(string s);
  25         string getTaxonomy(Sequence*);
  26
  27 private:
  28         int num;
  29         string findCommonTaxonomy(vector<string>);
  30         string search, outDistName;
  31
  32 };
  33
  34 /**************************************************************************************************/
  35
  36 #endif
  37
  38