kmeans.cpp

   1 //
   2 //  kmeans.cpp
   3 //  Mothur
   4 //
   5 //  Created by SarahsWork on 12/4/13.
   6 //  Copyright (c) 2013 Schloss Lab. All rights reserved.
   7 //
   8
   9 #include "kmeans.h"
  10
  11 /**************************************************************************************************/
  12
  13 KMeans::KMeans(vector<vector<int> > cm, int p) : CommunityTypeFinder() {
  14     try {
  15         countMatrix = cm;
  16         numSamples = (int)countMatrix.size();
  17         numOTUs = (int)countMatrix[0].size();
  18         numPartitions = p;
  19
  20         findkMeans();
  21     }
  22         catch(exception& e) {
  23                 m->errorOut(e, "KMeans", "KMeans");
  24                 exit(1);
  25         }
  26 }
  27 /**************************************************************************************************/
  28
  29
  30
  31