helpcommand.cpp

   1 /*
   2  *  helpcommand.cpp
   3  *  Dotur
   4  *
   5  *  Created by Sarah Westcott on 1/2/09.
   6  *  Copyright 2009 Schloss Lab UMASS Amherst. All rights reserved.
   7  *
   8  */
   9
  10 #include "helpcommand.h"
  11
  12 //**********************************************************************************************************************
  13
  14 HelpCommand::HelpCommand(string option)  {
  15         validCommands = CommandFactory::getInstance();
  16 }
  17 //**********************************************************************************************************************
  18 int HelpCommand::execute(){
  19         try {
  20                 validCommands->printCommands(cout);
  21                 m->mothurOut("For more information about a specific command type 'commandName(help)' i.e. 'read.dist(help)'"); m->mothurOutEndLine();
  22
  23                 m->mothurOutEndLine(); m->mothurOut("For further assistance please refer to the Mothur manual on our wiki at http://www.mothur.org/wiki, or contact Pat Schloss at mothur.bugs@gmail.com.\n");
  24
  25                 return 0;
  26         }
  27         catch(exception& e) {
  28                 m->errorOut(e, "HelpCommand", "execute");
  29                 exit(1);
  30         }
  31 }
  32 //**********************************************************************************************************************/