dlibshuff.h

   1 #ifndef DLIBSHUFF
   2 #define DLIBSHUFF
   3
   4 /*
   5  *  dlibshuff.h
   6  *  Mothur
   7  *
   8  *  Created by Pat Schloss on 4/8/09.
   9  *  Copyright 2009 Patrick D. Schloss. All rights reserved.
  10  *
  11  */
  12
  13 #include "fullmatrix.h"
  14 #include "libshuff.h"
  15
  16 class DLibshuff : public Libshuff {
  17
  18 public:
  19         DLibshuff(FullMatrix*, int, float, float);
  20         vector<vector<double> > evaluateAll();
  21         float evaluatePair(int, int);
  22
  23 private:
  24         int numDXs;
  25         double dCalculate(int, int);
  26         vector<int> calcN(vector<double>);
  27 };
  28
  29 #endif