dist.h

   1 #ifndef DIST_H
   2 #define DIST_H
   3 /*
   4  *  dist.h
   5  *  Mothur
   6  *
   7  *  Created by Sarah Westcott on 5/7/09.
   8  *  Copyright 2009 Schloss Lab UMASS Amherst. All rights reserved.
   9  *
  10  */
  11
  12 #include "mothur.h"
  13 #include "sequence.hpp"
  14
  15 /**************************************************************************************************/
  16
  17 class Dist {
  18
  19 public:
  20         Dist(){ dist = 0; m = MothurOut::getInstance(); }
  21         Dist(const Dist& d) : dist(d.dist) { m = MothurOut::getInstance(); }
  22         virtual ~Dist() {}
  23         virtual void calcDist(Sequence, Sequence) = 0;
  24         double getDist()        {       return dist;    }
  25
  26 protected:
  27         double dist;
  28         MothurOut* m;
  29 };
  30
  31 /**************************************************************************************************/
  32
  33 #endif