bstick.h

   1 #ifndef BSTICK_H
   2 #define BSTICK_H
   3 /*
   4  *  bstick.h
   5  *  Mothur
   6  *
   7  *  Created by Thomas Ryabin on 3/6/09.
   8  *  Copyright 2009 Schloss Lab UMASS Amherst. All rights reserved.
   9  *
  10  */
  11 #include "calculator.h"
  12
  13 /*This class implements the BStick estimator on single group.
  14 It is a child of the calculator class.*/
  15
  16 /***********************************************************************/
  17
  18 class BStick : public Calculator  {
  19
  20 public:
  21         BStick() : Calculator("bstick", 3, false) {};
  22         EstOutput getValues(SAbundVector*);
  23         EstOutput getValues(vector<SharedRAbundVector*>) {return data;};
  24         string getCitation() { return "http://www.mothur.org/wiki/Bstick"; }
  25 private:
  26         double invSum(int, double);
  27         RAbundVector getRAbundVector(SAbundVector*);
  28         RAbundVector rdata;
  29 };
  30
  31 /***********************************************************************/
  32
  33 #endif