emacs_el/configuration/don-configuration.org

   1 #+PROPERTY: header-args:emacs-lisp :tangle don-configuration.el
   2 * Load debugger
   3
   4 # if for some reason, things get pear-shaped, we want to be able to
   5 # enter the debugger by sending -USR2 to emacs
   6
   7 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
   8 (setq debug-on-event 'siguser2)
   9 #+END_SRC
  10 * Initial startup stuff
  11 ** Disable startup screen
  12 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
  13   (setq inhibit-startup-screen t)
  14 #+END_SRC
  15 ** Disable cluter
  16 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
  17   ; (if (fboundp 'menu-bar-mode) (menu-bar-mode -1))
  18   (if (fboundp 'tool-bar-mode) (tool-bar-mode -1))
  19   (if (fboundp 'scroll-bar-mode) (scroll-bar-mode -1))
  20 #+END_SRC
  21 ** Fullscreen
  22 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
  23   (setq frame-resize-pixelwise t)
  24   (add-to-list 'default-frame-alist '(fullscreen . maximixed))
  25 #+END_SRC
  26 * Package management
  27 ** package repositories and package manager
  28 Borrowed from https://github.com/nilcons/emacs-use-package-fast/ to
  29 load  [[https://github.com/jwiegley/use-package/][use-package]] even faster
  30 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
  31   (setq package-enable-at-startup nil)
  32   (setq package--init-file-ensured t)
  33   (setq package-archives '(("gnu" . "https://elpa.gnu.org/packages/")
  34                            ("melpa" . "https://melpa.org/packages/")
  35                            ("org" . "http://orgmode.org/elpa/") ))
  36   (eval-and-compile
  37     (setq use-package-verbose (not (bound-and-true-p byte-compile-current-file))))
  38   (mapc #'(lambda (add) (add-to-list 'load-path add))
  39     (eval-when-compile
  40       (package-initialize)
  41       (unless (package-installed-p 'use-package)
  42         (package-refresh-contents)
  43         (package-install 'use-package))
  44       (let ((package-user-dir-real (file-truename package-user-dir)))
  45         ;; The reverse is necessary, because outside we mapc
  46         ;; add-to-list element-by-element, which reverses.
  47         (nreverse (apply #'nconc
  48                  ;; Only keep package.el provided loadpaths.
  49                  (mapcar #'(lambda (path)
  50                      (if (string-prefix-p package-user-dir-real path)
  51                          (list path)
  52                        nil))
  53                      load-path))))))
  54
  55   (require 'use-package)
  56   (require 'diminish)
  57   (require 'bind-key)
  58 #+END_SRC
  59 ** Paradox
  60 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
  61   (use-package paradox
  62     :ensure paradox
  63     :commands (paradox-upgrade-packages paradox-list-packages)
  64     :config (setq paradox-execute-asynchronously t)
  65     )
  66 #+END_SRC
  67 * Add library paths
  68
  69 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
  70   (add-to-list 'load-path '"~/lib/emacs_el/")
  71   (add-to-list 'load-path '"~/lib/emacs_el/magit-annex")
  72 #+END_SRC
  73 * Disable custom-vars
  74 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
  75   ;; Set the custom file to /dev/null and don't bother to load it
  76   (setq custom-file "/dev/null")
  77 #+END_SRC
  78 * Misc functions
  79 ** with-library
  80 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
  81 ;; From http://www.emacswiki.org/emacs/LoadingLispFiles
  82 ;; execute conditional code when loading libraries
  83 (defmacro with-library (symbol &rest body)
  84   `(when (require ,symbol nil t)
  85      ,@body))
  86 (put 'with-library 'lisp-indent-function 1)
  87 #+END_SRC
  88
  89 * Variables
  90 ** Safe Local Variables
  91 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
  92   (setq safe-local-variable-values
  93         (quote ((auto-save-default)
  94                 (make-backup-files)
  95                 (cperl-indent-level . 4)
  96                 (indent-level . 4)
  97                 (indent-tabs-mode . f)
  98                 )))
  99 #+END_SRC
 100 * Memory
 101 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 102   (setq global-mark-ring-max 128
 103         mark-ring-max 128
 104         kill-ring-max 128)
 105
 106   (defun don/minibuffer-setup-hook ()
 107     (setq gc-cons-threshold most-positive-fixnum))
 108
 109   (defun don/minibuffer-exit-hook ()
 110     (setq gc-cons-threshold 1048576))
 111
 112   (add-hook 'minibuffer-setup-hook #'don/minibuffer-setup-hook)
 113   (add-hook 'minibuffer-exit-hook #'don/minibuffer-exit-hook)
 114 #+END_SRC
 115 * Modules
 116 ** Hippie Expand
 117 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 118   (use-package hippie-expand
 119     :bind* (("M-<SPC>" . hippie-expand))
 120     )
 121 #+END_SRC
 122 ** Flyspell 🐝
 123 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 124   (use-package flyspell
 125     :ensure t
 126     :diminish flyspell-mode 🐝
 127     :config
 128     (add-hook 'text-mode-hook 'turn-on-flyspell)
 129     (add-hook 'c-mode-common-hook 'flyspell-prog-mode)
 130     (add-hook 'cperl-mode-hook 'flyspell-prog-mode)
 131     (add-hook 'tcl-mode-hook 'flyspell-prog-mode)
 132     :init
 133     (setq ispell-program-name "ispell")
 134     )
 135
 136 #+END_SRC
 137 ** Flymake
 138 #+begin_src emacs-lisp :tangle yes
 139   (use-package flymake
 140     :diminish "Φ")
 141 #+end_src
 142
 143 ** Winnermode
 144 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 145   (winner-mode 1)
 146 #+END_SRC
 147 ** Eyebrowse
 148
 149 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 150   (use-package eyebrowse
 151     :ensure t
 152     :diminish eyebrowse-mode
 153     :init (setq eyebrowse-keymap-prefix (kbd "C-c e"))
 154     :config (progn
 155               (setq eyebrowse-wrap-around t)
 156               (eyebrowse-mode t)
 157
 158               (defun my/eyebrowse-new-window-config ()
 159                 (interactive)
 160                 (let ((done nil))
 161                   (dotimes (i 10)
 162                     ;; start at 1 run till 0
 163                     (let ((j (mod (+ i 1) 10)))
 164                       (when (and (not done)
 165                                  (not (eyebrowse--window-config-present-p j)))
 166                         (eyebrowse-switch-to-window-config j)
 167                         (call-interactively 'eyebrowse-rename-window-config2 j)
 168                         (setq done t)
 169                         ))
 170                     )))
 171
 172               ;; I don't use latex-preview-pane
 173               ;; (require 'latex-preview-pane)
 174               ;; (defun my/close-latex-preview-pane-before-eyebrowse-switch ()
 175               ;;   ;; latex-preview-pane uses window-parameters which are
 176               ;;   ;; not preserved by eyebrowse, so we close the preview
 177               ;;   ;; pane before switching, it will be regenerated when we
 178               ;;   ;; edit the TeX file.
 179               ;;   (when (lpp/window-containing-preview)
 180               ;;     (delete-window (lpp/window-containing-preview))))
 181
 182               ;; (add-to-list 'eyebrowse-pre-window-switch-hook
 183               ;;              #'my/close-latex-preview-pane-before-eyebrowse-switch)
 184
 185               ;; (my/set-menu-key "["  #'my/eyebrowse-new-window-config)
 186               ;; (my/set-menu-key ";"  #'eyebrowse-prev-window-config)
 187               ;; (my/set-menu-key "'"  #'eyebrowse-next-window-config)
 188               ;; (my/set-menu-key "]"  #'eyebrowse-close-window-config)
 189               ;; (my/set-menu-key "\\" #'eyebrowse-rename-window-config)
 190               )
 191     )
 192 #+END_SRC
 193
 194 ** Window handling
 195
 196 *** Splitting
 197 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 198   (defun my/vsplit-last-buffer ()
 199     "Split the window vertically and display the previous buffer."
 200     (interactive)
 201     (split-window-vertically)
 202     (other-window 1 nil)
 203     (switch-to-next-buffer))
 204
 205   (defun my/hsplit-last-buffer ()
 206     "Split the window horizontally and display the previous buffer."
 207     (interactive)
 208     (split-window-horizontally)
 209     (other-window 1 nil)
 210     (switch-to-next-buffer))
 211
 212   (bind-key "C-x 2" 'my/vsplit-last-buffer)
 213   (bind-key "C-x 3" 'my/hsplit-last-buffer)
 214
 215   (setq split-width-threshold  100)
 216   (setq split-height-threshold 60)
 217
 218   (defun my/split-window-prefer-vertically (window)
 219     "If there's only one window (excluding any possibly active
 220            minibuffer), then split the current window horizontally."
 221     (if (and (one-window-p t)
 222              (not (active-minibuffer-window))
 223              ( < (frame-width) (frame-height))
 224              )
 225         (let ((split-width-threshold nil))
 226           (split-window-sensibly window))
 227       (split-window-sensibly window)))
 228
 229   (setq split-window-preferred-function #'my/split-window-prefer-vertically)
 230   (setq window-combination-resize t)
 231 #+END_SRC
 232
 233 *** Compilation window
 234
 235 If there is no compilation window, open one at the bottom, spanning
 236 the complete width of the frame. Otherwise, reuse existing window. In
 237 the former case, if there was no error the window closes
 238 automatically.
 239
 240 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 241   (add-to-list 'display-buffer-alist
 242                `(,(rx bos "*compilation*" eos)
 243                  (display-buffer-reuse-window
 244                   display-buffer-in-side-window)
 245                  (reusable-frames . visible)
 246                  (side            . bottom)
 247                  (window-height   . 0.4)))
 248 #+END_SRC
 249
 250 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 251   (defun my/compilation-exit-autoclose (status code msg)
 252     ;; If M-x compile exists with a 0
 253     (when (and (eq status 'exit) (zerop code))
 254       ;; and delete the *compilation* window
 255       (let ((compilation-window (get-buffer-window (get-buffer "*compilation*"))))
 256         (when (and (not (window-at-side-p compilation-window 'top))
 257                    (window-at-side-p compilation-window 'left)
 258                    (window-at-side-p compilation-window 'right))
 259           (delete-window compilation-window))))
 260     ;; Always return the anticipated result of compilation-exit-message-function
 261     (cons msg code))
 262
 263   ;; Specify my function (maybe I should have done a lambda function)
 264   (setq compilation-exit-message-function #'my/compilation-exit-autoclose)
 265 #+END_SRC
 266
 267 If you change the variable ~compilation-scroll-output~ to a ~non-nil~
 268 value, the compilation buffer scrolls automatically to follow the
 269 output. If the value is ~first-error~, scrolling stops when the first
 270 error appears, leaving point at that error. For any other non-nil
 271 value, scrolling continues until there is no more output.
 272
 273 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 274   (setq compilation-scroll-output 'first-error)
 275 #+END_SRC
 276
 277 ** Mode line cleaning
 278 *** Diminish
 279 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 280   (use-package diminish
 281     :ensure t)
 282 #+END_SRC
 283
 284 *** Delight
 285 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 286   (use-package delight
 287     :ensure t)
 288 #+END_SRC
 289
 290 ** Jumping
 291 *** Avy
 292 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 293   (use-package avy
 294     :ensure t
 295     :bind (("C-c C-<SPC>" . avy-goto-word-or-subword-1)
 296            ("C-c j j" . avy-goto-word-or-subword-1)
 297            ("M-g g" . avy-goto-line))
 298     :config (progn (setq avy-background t))
 299     )
 300 #+END_SRC
 301 *** Ace-link (jumping to links)
 302 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 303   (use-package ace-link
 304     :ensure t
 305     ; bind o in most modes
 306     :config (ace-link-setup-default))
 307 #+END_SRC
 308 *** Jumping through edit points (goto-chg)
 309 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 310   (use-package goto-chg
 311     :ensure t
 312     :bind (("C-c j ," . goto-last-change)
 313            ("C-c j ." . goto-last-change-reverse))
 314     )
 315 #+END_SRC
 316 *** Jumping to bookmarks (visible bookmarks, bm)
 317 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 318   (use-package bm
 319     :ensure t
 320     :bind (("C-c j b ." . bm-next)
 321            ("C-c j b ," . bm-previous)
 322            ("C-c j b SPC" . bm-toggle)))
 323 #+END_SRC
 324
 325 ** Snippets
 326 *** Yasnippet
 327 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 328   (use-package yasnippet
 329     :ensure t
 330     :diminish yas-minor-mode
 331     :config (progn
 332               (yas-global-mode)
 333               (setq yas-verbosity 1)
 334               (define-key yas-minor-mode-map (kbd "<tab>") nil)
 335               (define-key yas-minor-mode-map (kbd "TAB") nil)
 336               (define-key yas-minor-mode-map (kbd "<backtab>") 'yas-expand)
 337               (setq yas-snippet-dirs '("~/lib/emacs_el/snippets/"
 338                                        "~/lib/emacs_el/yasnippet-snippets/snippets/"))
 339               (add-to-list 'hippie-expand-try-functions-list
 340                                'yas-hippie-try-expand)
 341               )
 342     )
 343 #+END_SRC
 344 *** Auto-YASnippet
 345 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 346   (use-package auto-yasnippet
 347     :bind (("H-w" . aya-create)
 348            ("H-y" . aya-expand)
 349            )
 350     )
 351 #+END_SRC
 352 ** Tinyprocmail
 353
 354 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 355   ;; load tinyprocmail
 356   (use-package tinyprocmail
 357     :load-path "~/lib/emacs_el/tiny-tools/lisp/tiny"
 358     :mode (".procmailrc" . turn-on-tinyprocmail-mode)
 359     )
 360 #+END_SRC
 361
 362 ** Magit
 363 #+BEGIN_SRC emacs-lisp :tangle don-configuration.el
 364   (use-package magit
 365     :ensure t
 366     :bind (("C-x g" . magit-status)
 367            ("C-x C-g" . magit-status))
 368     :config
 369     ;; refine diffs always (hilight words)
 370     (setq magit-diff-refine-hunk nil)
 371     )
 372   (use-package magit-annex
 373     :ensure t
 374     :load-path "~/lib/emacs_el/magit-annex/"
 375     )
 376   (use-package magit-vcsh
 377     :ensure f ; currently not in melpa, so don't try to install
 378     :load-path "~/lib/emacs_el/magit-vcsh/"
 379     )
 380 #+END_SRC
 381
 382 ** Perl
 383 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 384   (use-package cperl-mode
 385     :config
 386     (progn
 387       ;; Use c-mode for perl .xs files
 388       (add-to-list 'auto-mode-alist '("\\.xs\\'" . c-mode))
 389       (add-to-list 'auto-mode-alist '("\\.\\([pP][Llm]\\|al\\)\\'" . cperl-mode))
 390       (add-to-list 'interpreter-mode-alist '("perl" . cperl-mode))
 391       (add-to-list 'interpreter-mode-alist '("perl5" . cperl-mode))
 392       (add-to-list 'interpreter-mode-alist '("miniperl" . cperl-mode))
 393       (setq cperl-hairy t
 394             cperl-indent-level 4
 395             cperl-auto-newline nil
 396             cperl-auto-newline-after-colon nil
 397             cperl-continued-statement-offset 4
 398             cperl-brace-offset -1
 399             cperl-continued-brace-offset 0
 400             cperl-label-offset -4
 401             cperl-highlight-variables-indiscriminately t
 402             cperl-electric-lbrace-space nil
 403             cperl-indent-parens-as-block nil
 404             cperl-close-paren-offset -1
 405             cperl-tab-always-indent t)
 406       ;;(add-hook 'cperl-mode-hook (lambda () (cperl-set-style "PerlStyle")))
 407   ))
 408 #+END_SRC
 409
 410 ** Markdown mode
 411 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 412   (use-package markdown-mode
 413     :ensure t
 414     :mode (("\\.md\\'" . markdown-mode)
 415            ("\\.mdwn\\'" . markdown-mode)
 416            ("README\\.md\\'" . gfm-mode)
 417            )
 418     :config
 419     (setq markdown-enable-math t)
 420     (setq markdown-follow-wiki-link-on-enter nil)
 421     (bind-key "M-." #'markdown-jump markdown-mode-map)
 422     (add-hook 'markdown-mode-hook #'flyspell-mode)
 423     (add-hook 'markdown-mode-hook #'outline-minor-mode)
 424     (bind-key "C-<tab>" #'outline-cycle markdown-mode-map)
 425   )
 426
 427 #+END_SRC
 428 ** SQL mode
 429 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 430   ; load sql-indent when sql is loaded
 431 (use-package sql
 432   :mode (("\\.sql\\'" . sql-mode))
 433   :config
 434   (require sql-indent))
 435 #+END_SRC
 436 ** Ediff
 437 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 438   (use-package ediff
 439     :commands ediff ediff3
 440     :ensure f
 441     :config
 442     ;; ediff configuration
 443     ;; don't use the multi-window configuration
 444     (setq ediff-window-setup-function 'ediff-setup-windows-plain)
 445   )
 446 #+END_SRC
 447 ** VCL --editing varnish configuration files
 448 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 449   (use-package vcl-mode
 450     :ensure t
 451     :mode "\\.vcl\\'"
 452     )
 453
 454 #+END_SRC
 455 ** Helm
 456 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 457   (defun malb/helm-omni (&rest arg)
 458     ;; just in case someone decides to pass an argument, helm-omni won't fail.
 459     (interactive)
 460     (unless helm-source-buffers-list
 461       (setq helm-source-buffers-list
 462             (helm-make-source "Buffers" 'helm-source-buffers)))
 463     (helm-other-buffer
 464      (append
 465
 466      (if (projectile-project-p)
 467           '(helm-source-projectile-buffers-list
 468             helm-source-buffers-list)
 469         '(helm-source-buffers-list)) ;; list of all open buffers
 470
 471       `(((name . "Virtual Workspace")
 472          (candidates . ,(--map (cons (eyebrowse-format-slot it) (car it))
 473                                (eyebrowse--get 'window-configs)))
 474          (action . (lambda (candidate)
 475                      (eyebrowse-switch-to-window-config candidate)))))
 476
 477       (if (projectile-project-p)
 478           '(helm-source-projectile-recentf-list
 479             helm-source-recentf)
 480         '(helm-source-recentf)) ;; all recent files
 481
 482       ;; always make some common files easily accessible
 483       ;;'(((name . "Common Files")
 484        ;;  (candidates . malb/common-file-targets)
 485         ;; (action . (("Open" . (lambda (x) (find-file (eval x))))))))
 486
 487       '(helm-source-files-in-current-dir
 488         helm-source-locate
 489         helm-source-bookmarks
 490         helm-source-buffer-not-found ;; ask to create a buffer otherwise
 491         ))
 492      "*Helm all the things*"))
 493   (use-package helm
 494     :ensure helm
 495     :diminish helm-mode
 496     :bind (("M-x" . helm-M-x)
 497            ("C-x C-f" . helm-find-files)
 498            ("C-x b" . helm-buffers-list) ; malb/helm-omni)
 499            ("C-x C-b" . helm-buffers-list) ; malb/helm-omni)
 500            ("C-c <SPC>" . helm-all-mark-rings))
 501     :config
 502     (require 'helm-config)
 503     (require 'helm-for-files)
 504     (require 'helm-bookmark)
 505
 506     (helm-mode 1)
 507     (define-key global-map [remap find-file] 'helm-find-files)
 508     (define-key global-map [remap occur] 'helm-occur)
 509     (define-key global-map [remap list-buffers] 'helm-buffers-list)
 510     (define-key global-map [remap dabbrev-expand] 'helm-dabbrev)
 511     (unless (boundp 'completion-in-region-function)
 512       (define-key lisp-interaction-mode-map [remap completion-at-point] 'helm-lisp-completion-at-point)
 513       (define-key emacs-lisp-mode-map       [remap completion-at-point] 'helm-lisp-completion-at-point))
 514     (add-hook 'kill-emacs-hook #'(lambda () (and (file-exists-p "$TMP") (delete-file "$TMP"))))
 515   )
 516 #+END_SRC
 517 *** Helm Flx
 518
 519  [[https://github.com/PythonNut/helm-flx][helm-flx]] implements intelligent helm fuzzy sorting, provided by [[https://github.com/lewang/flx][flx]].
 520
 521  #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 522  (use-package helm-flx
 523    :ensure t
 524    :config (progn
 525              ;; these are helm configs, but they kind of fit here nicely
 526              (setq helm-M-x-fuzzy-match                  t
 527                    helm-bookmark-show-location           t
 528                    helm-buffers-fuzzy-matching           t
 529                    helm-completion-in-region-fuzzy-match t
 530                    helm-file-cache-fuzzy-match           t
 531                    helm-imenu-fuzzy-match                t
 532                    helm-mode-fuzzy-match                 t
 533                    helm-locate-fuzzy-match               nil
 534                    helm-quick-update                     t
 535                    helm-recentf-fuzzy-match              nil
 536                    helm-semantic-fuzzy-match             t)
 537              (helm-flx-mode +1)))
 538  #+END_SRC
 539 *** Helm Swoop
 540 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 541
 542   ;;; stolen from https://github.com/malb/emacs.d/blob/master/malb.org
 543   (defun malb/helm-swoop-pre-fill ()
 544     (thing-at-point 'symbol))
 545     (defvar malb/helm-swoop-ignore-major-mode "List of major modes to ignore for helm-swoop")
 546     (setq malb/helm-swoop-ignore-major-mode '(dired-mode
 547           paradox-menu-mode doc-view-mode pdf-view-mode
 548           mu4e-headers-mode org-mode markdown-mode latex-mode
 549           ein:notebook-multilang-mode))
 550
 551     (defun malb/swoop-or-search ()
 552       (interactive)
 553       (if (or (> (buffer-size) 1048576) ;; helm-swoop can be slow on big buffers
 554               (memq major-mode malb/helm-swoop-ignore-major-mode))
 555           (isearch-forward)
 556         (helm-swoop)))
 557
 558     (use-package helm-swoop
 559       :ensure t
 560       :commands helm-swoop
 561       :bind (("C-c o" . helm-multi-swoop-org)
 562              ("C-s" . malb/swoop-or-search)
 563              ("C-M-s" . helm-multi-swoop-all))
 564       :config (progn
 565
 566                 (setq helm-swoop-pre-input-function  #'malb/helm-swoop-pre-fill
 567                       helm-swoop-split-with-multiple-windows nil
 568                       helm-swoop-split-direction #'split-window-horizontally
 569                       helm-swoop-split-window-function 'helm-default-display-buffer
 570                       helm-swoop-speed-or-color t)
 571
 572                 ;; https://emacs.stackexchange.com/questions/28790/helm-swoop-how-to-make-it-behave-more-like-isearch
 573                 (defun malb/helm-swoop-C-s ()
 574                   (interactive)
 575                   (if (boundp 'helm-swoop-pattern)
 576                       (if (equal helm-swoop-pattern "")
 577                           (previous-history-element 1)
 578                         (helm-next-line))
 579                     (helm-next-line)))
 580
 581                 (bind-key "C-S-s" #'helm-swoop-from-isearch isearch-mode-map)
 582                 (bind-key "C-S-s" #'helm-multi-swoop-all-from-helm-swoop helm-swoop-map)
 583                 (bind-key "C-r"   #'helm-previous-line helm-swoop-map)
 584                 (bind-key "C-s"   #'malb/helm-swoop-C-s helm-swoop-map)
 585                 (bind-key "C-r"   #'helm-previous-line helm-multi-swoop-map)
 586                 (bind-key "C-s"   #'malb/helm-swoop-C-s helm-multi-swoop-map))
 587       )
 588
 589 #+END_SRC
 590 *** Helm Ag
 591 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 592 (use-package helm-ag
 593   :ensure t
 594   :config (setq helm-ag-base-command "ag --nocolor --nogroup"
 595                 helm-ag-command-option "--all-text"
 596                 helm-ag-insert-at-point 'symbol
 597                 helm-ag-fuzzy-match t
 598                 helm-ag-use-temp-buffer t
 599                 helm-ag-use-grep-ignore-list t
 600                 helm-ag-use-agignore t))
 601 #+END_SRC
 602 *** Helm Descbinds
 603 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 604   (use-package helm-descbinds
 605     :ensure t
 606     :bind ("C-h b" . helm-descbinds)
 607     :init (fset 'describe-bindings 'helm-descbinds))
 608 #+END_SRC
 609
 610 *** Helm YaSnippet
 611 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 612   (use-package helm-c-yasnippet
 613     :ensure t
 614     :bind ("C-c h y" .  helm-yas-complete)
 615     :config (progn
 616               (setq helm-yas-space-match-any-greedy t)))
 617 #+END_SRC
 618 *** Helm Org Rifle
 619 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 620   (use-package helm-org-rifle
 621     :ensure t
 622     :config (progn
 623               (defun malb/helm-org-rifle-agenda-files (arg)
 624                 (interactive "p")
 625                 (let ((current-prefix-arg nil))
 626                   (cond
 627                    ((equal arg 4) (call-interactively #'helm-org-rifle-agenda-files nil))
 628                    ((equal arg 16) (helm-org-rifle-occur-agenda-files))
 629                    (t (helm-org-agenda-files-headings)))))))
 630 #+END_SRC
 631 *** Helm Google
 632 This can be used to link things pretty quickly if necessary
 633 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 634   (use-package helm-google
 635     :ensure t
 636     :bind ("C-c h g" . helm-google)
 637     :config
 638     (progn (add-to-list 'helm-google-actions
 639                         '("Copy URL" . (lambda (candidate)
 640                                          (let ((url
 641                                                 (replace-regexp-in-string
 642                                                  "https://.*q=\\(.*\\)\&sa=.*"
 643                                                  "\\1" candidate)))
 644                                            (kill-new url))))
 645                         t
 646                         )
 647
 648            (add-to-list 'helm-google-actions
 649                         '("Org Store Link" . (lambda (candidate)
 650                                                (let ((title (car (split-string candidate "[\n]+")))
 651                                                      (url
 652                                                       (replace-regexp-in-string
 653                                                        "https://.*q=\\(.*\\)\&sa=.*"
 654                                                        "\\1" candidate)))
 655                                                  (push (list url title) org-stored-links))))
 656                         t)
 657            ))
 658 #+END_SRC
 659
 660 ** Projectile -- Project management
 661 #+begin_src emacs-lisp
 662   (use-package projectile
 663     :ensure t
 664     :bind (("<f5>" . projectile-compile-project)
 665            ("<f6>" . next-error))
 666     :config (progn
 667               (use-package magit :ensure t)
 668               (require 'helm-projectile)
 669               (helm-projectile-on)
 670
 671               (setq projectile-make-test-cmd "make check"
 672                     projectile-switch-project-action 'helm-projectile
 673                     projectile-mode-line  '(:eval (format "»{%s}" (projectile-project-name))))
 674
 675               (projectile-global-mode)))
 676 #+end_src
 677
 678 *** helm integration
 679 #+begin_src emacs-lisp
 680   (use-package helm-projectile
 681     :ensure t
 682     :config (progn
 683               (defvar malb/helm-source-file-not-found
 684                 (helm-build-dummy-source
 685                     "Create file"
 686                   :action 'find-file))
 687
 688               (add-to-list
 689                'helm-projectile-sources-list
 690                malb/helm-source-file-not-found t)
 691
 692               (helm-delete-action-from-source
 693                "Grep in projects `C-s'"
 694                helm-source-projectile-projects)
 695
 696               (helm-add-action-to-source
 697                "Grep in projects `C-s'"
 698                'helm-do-ag helm-source-projectile-projects 4)))
 699 #+end_src
 700 ** Zap to char
 701 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 702   (use-package avy-zap
 703     :ensure t
 704     :bind ("M-z" . avy-zap-up-to-char-dwim))
 705 #+END_SRC
 706 ** Hydra
 707 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 708   (use-package hydra
 709     :bind (("C-c 2" . my/hydra-orgmodes/body)
 710            ("C-c @" . my/hydra-orgmodes/body)
 711            ("C-c #" . my/hydra-outline/body)
 712            ("C-c 3" . my/hydra-outline/body)
 713            )
 714     :config
 715     (defhydra my/hydra-orgmodes (:color blue :hint nil)
 716     "
 717   _n_: notes _c_: chaim _w_: wildman _o_: ool
 718   _u_: uddin _s_: steve _r_: refile  _f_: fh
 719   _p_: read papers      _R_: paper notes
 720   _h_: hpcbio
 721   _q_: quit
 722   _z_: quit
 723   "
 724     ("n" (find-file "~/projects/org-notes/notes.org"))
 725     ("c" (find-file "~/projects/org-notes/chaim.org"))
 726     ("w" (find-file "~/projects/org-notes/wildman.org"))
 727     ("u" (find-file "~/projects/org-notes/uddin.org"))
 728     ("o" (find-file "~/projects/org-notes/ool.org"))
 729     ("f" (find-file "~/projects/org-notes/fh.org"))
 730     ("s" (find-file "~/projects/org-notes/sndservers.org"))
 731     ("r" (find-file "~/projects/org-notes/refile.org"))
 732     ("p" (find-file "~/projects/research/papers_to_read.org"))
 733     ("R" (find-file "~/projects/research/paper_notes.org"))
 734     ("h" (find-file "~/projects/org-notes/hpcbio.org"))
 735     ("q" nil "quit")
 736     ("z" nil "quit")
 737     )
 738
 739     ;; from https://github.com/abo-abo/hydra/wiki/Emacs
 740     (defhydra my/hydra-outline (:color pink :hint nil)
 741     "
 742   ^Hide^             ^Show^           ^Move
 743   ^^^^^^------------------------------------------------------
 744   _q_: sublevels     _a_: all         _u_: up
 745   _t_: body          _e_: entry       _n_: next visible
 746   _o_: other         _i_: children    _p_: previous visible
 747   _c_: entry         _k_: branches    _f_: forward same level
 748   _l_: leaves        _s_: subtree     _b_: backward same level
 749   _d_: subtree
 750
 751   "
 752     ;; Hide
 753     ("q" outline-hide-sublevels)    ; Hide everything but the top-level headings
 754     ("t" outline-hide-body)         ; Hide everything but headings (all body lines)
 755     ("o" outline-hide-other)        ; Hide other branches
 756     ("c" outline-hide-entry)        ; Hide this entry's body
 757     ("l" outline-hide-leaves)       ; Hide body lines in this entry and sub-entries
 758     ("d" outline-hide-subtree)      ; Hide everything in this entry and sub-entries
 759     ;; Show
 760     ("a" outline-show-all)          ; Show (expand) everything
 761     ("e" outline-show-entry)        ; Show this heading's body
 762     ("i" outline-show-children)     ; Show this heading's immediate child sub-headings
 763     ("k" outline-show-branches)     ; Show all sub-headings under this heading
 764     ("s" outline-show-subtree)      ; Show (expand) everything in this heading & below
 765     ;; Move
 766     ("u" outline-up-heading)                ; Up
 767     ("n" outline-next-visible-heading)      ; Next
 768     ("p" outline-previous-visible-heading)  ; Previous
 769     ("f" outline-forward-same-level)        ; Forward - same level
 770     ("b" outline-backward-same-level)       ; Backward - same level
 771     ("z" nil "leave"))
 772   )
 773 #+END_SRC
 774
 775 ** Tramp
 776 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 777   (use-package tramp
 778     :config
 779     (add-to-list 'tramp-methods '("vcsh"
 780                                   (tramp-login-program "vcsh")
 781                                   (tramp-login-args
 782                                    (("enter")
 783                                     ("%h")))
 784                                   (tramp-remote-shell "/bin/sh")
 785                                   (tramp-remote-shell-args
 786                                    ("-c")))))
 787 #+END_SRC
 788 ** Reftex
 789 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 790   (use-package reftex
 791     :ensure t
 792     :config
 793     (setq-default reftex-default-bibliography
 794                     '("~/projects/research/references.bib")))
 795 #+END_SRC
 796 ** BibTex
 797 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 798   (use-package bibtex
 799     :config (setq bibtex-user-optional-fields
 800                   (quote (("annote" "Personal annotation (ignored)")
 801                           ("abstract" "")
 802                   ("pmid" "")
 803                   ("doi" ""))))
 804     )
 805
 806 #+END_SRC
 807 ** LaTeX
 808 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 809   (use-package tex
 810     :defer t
 811     :ensure auctex
 812     :config
 813     ; (add-to-list 'TeX-style-path '"/home/don/lib/emacs_el/auctex/style")
 814     ;; REFTEX (much enhanced management of cross-ref, labels, etc)
 815     ;; http://www.strw.leidenuniv.nl/~dominik/Tools/reftex/
 816     ; (autoload 'reftex-mode     "reftex" "RefTeX Minor Mode" t)
 817     ; (autoload 'turn-on-reftex  "reftex" "RefTeX Minor Mode" nil)
 818     ; (autoload 'reftex-citation "reftex-cite" "Make citation" nil)
 819     ; (autoload 'reftex-index-phrase-mode "reftex-index" "Phrase mode" t)
 820     (add-hook 'LaTeX-mode-hook 'turn-on-reftex)   ; with AUCTeX LaTeX mode
 821     (add-hook 'latex-mode-hook 'turn-on-reftex)   ; with Emacs latex mode
 822     (add-hook 'LaTeX-mode-hook 'outline-minor-mode)   ; with AUCTeX LaTeX mode
 823     (add-hook 'latex-mode-hook 'outline-minor-mode)   ; with Emacs latex mode
 824
 825     (setq-default reftex-plug-into-AUCTeX t)
 826     ;; support fake section headers
 827     (setq TeX-outline-extra
 828           '(("%chapter" 1)
 829             ("%section" 2)
 830             ("%subsection" 3)
 831             ("%subsubsection" 4)
 832             ("%paragraph" 5)))
 833     ;; add font locking to the headers
 834     (font-lock-add-keywords
 835      'latex-mode
 836      '(("^%\\(chapter\\|\\(sub\\|subsub\\)?section\\|paragraph\\)"
 837         0 'font-lock-keyword-face t)
 838        ("^%chapter{\\(.*\\)}"       1 'font-latex-sectioning-1-face t)
 839        ("^%section{\\(.*\\)}"       1 'font-latex-sectioning-2-face t)
 840        ("^%subsection{\\(.*\\)}"    1 'font-latex-sectioning-3-face t)
 841        ("^%subsubsection{\\(.*\\)}" 1 'font-latex-sectioning-4-face t)
 842        ("^%paragraph{\\(.*\\)}"     1 'font-latex-sectioning-5-face t)))
 843
 844     ;; use smart quotes by default instead of `` and ''
 845     ;; taken from http://kieranhealy.org/esk/kjhealy.html
 846     (setq TeX-open-quote "“")
 847     (setq TeX-close-quote "”")
 848
 849     ;; (TeX-add-style-hook
 850     ;;  "latex"
 851     ;;  (lambda ()
 852     ;;    (TeX-add-symbols
 853     ;;     '("DLA" 1))))
 854     ;; (custom-set-variables
 855     ;;  '(font-latex-user-keyword-classes
 856     ;;    '(("fixme"
 857     ;;       ("DLA" "RZ")
 858     ;;       font-lock-function-name-face 2 (command 1 t))))
 859     ;; )
 860     (setq-default TeX-parse-self t)
 861     (setq-default TeX-auto-save t)
 862     (setq-default TeX-master nil)
 863     (eval-after-load
 864         "latex"
 865       '(TeX-add-style-hook
 866         "cleveref"
 867         (lambda ()
 868           (if (boundp 'reftex-ref-style-alist)
 869               (add-to-list
 870                'reftex-ref-style-alist
 871                '("Cleveref" "cleveref"
 872                  (("\\cref" ?c) ("\\Cref" ?C) ("\\cpageref" ?d) ("\\Cpageref" ?D)))))
 873           (reftex-ref-style-activate "Cleveref")
 874           (TeX-add-symbols
 875            '("cref" TeX-arg-ref)
 876            '("Cref" TeX-arg-ref)
 877            '("cpageref" TeX-arg-ref)
 878            '("Cpageref" TeX-arg-ref)))))
 879     (eval-after-load
 880         "latex"
 881       '(add-to-list 'LaTeX-fill-excluded-macros
 882                     '("Sexpr")))
 883
 884     (use-package font-latex
 885       :config
 886       (setq font-latex-match-reference-keywords
 887             '(
 888               ("fref" "{")
 889               ("Fref" "{")
 890               ("citep" "{")
 891               ("citet" "{")
 892               ("acs" "{")
 893               ("acsp" "{")
 894               ("ac" "{")
 895               ("acp" "{")
 896               ("acl" "{")
 897               ("aclp" "{")
 898               ("acsu" "{")
 899               ("aclu" "{")
 900               ("acused" "{")
 901               ("DLA" "{")
 902               ("RZ" "{")
 903               ("OM" "{")
 904               ("DL" "{")
 905               ("fixme" "{"))
 906             )
 907       )
 908     (setq font-latex-fontify-script nil)
 909     (setq font-latex-fontify-sectioning (quote color))
 910     (setq font-latex-script-display (quote (nil)))
 911   )
 912
 913 #+END_SRC
 914 ** ESS
 915 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 916   (use-package ess
 917     :ensure t
 918     :commands R
 919     :mode ("\\.R\\'" . ess-r-mode)
 920     :bind (:map ess-mode-map
 921                 ("C-c C-R" . dla/ess-region-remote-eval))
 922     :config
 923     (defun ess-change-directory (path)
 924       "Set the current working directory to PATH for both *R* and Emacs."
 925       (interactive "Directory to change to: ")
 926
 927       (when (file-exists-p path)
 928         (ess-command (concat "setwd(\"" path "\")\n"))
 929         ;; use file-name-as-directory to ensure it has trailing /
 930         (setq default-directory (file-name-as-directory path))))
 931     (add-hook 'ess-mode-hook 'flyspell-prog-mode)
 932     ;; outlining support for ess modes
 933     (add-hook
 934      'ess-mode-hook
 935      '(lambda ()
 936         (outline-minor-mode)
 937         (setq outline-regexp "\\(^#\\{4,5\\} \\)\\|\\(^[a-zA-Z0-9_\.]+ ?<- ?function\\)")
 938         (defun outline-level ()
 939           (cond ((looking-at "^##### ") 1)
 940                 ((looking-at "^#### ") 2)
 941                 ((looking-at "^[a-zA-Z0-9_\.]+ ?<- ?function(.*{") 3)
 942                 (t 1000)))
 943         ))
 944     (defun dla/ess-region-remote-eval (start end)
 945       "Evaluate region in a remote ESS instance"
 946       (interactive "r")
 947       (shell-command-on-region start end "eval_r" (get-buffer-create "***essregionremoteeval***"))
 948       kill-buffer "***essregionremoteeval***")
 949     ;; Don't restore history or save workspace image
 950     '(inferior-R-args "--no-restore-history --no-save")
 951     )
 952 #+END_SRC
 953
 954 ** Rainbowmode
 955 From http://julien.danjou.info/projects/emacs-packages#rainbow-mode, this colorizes color strings
 956
 957 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 958   (use-package rainbow-mode
 959     ;; add ess to the x major mode
 960     :config (add-to-list 'rainbow-x-colors-major-mode-list 'ESS[S])
 961     (add-to-list 'rainbow-x-colors-major-mode-list 'ESS[R])
 962   )
 963 #+END_SRC
 964
 965 ** Polymode
 966 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 967   (use-package polymode
 968     :config
 969     (use-package poly-R)
 970     (use-package poly-noweb)
 971     (use-package poly-markdown)
 972     :mode ("\\.Snw" . poly-noweb+r-mode)
 973     :mode ("\\.Rnw" . poly-noweb+r-mode)
 974     :mode ("\\.Rmd" . poly-markdown+r-mode)
 975     )
 976 #+END_SRC
 977
 978 ** Outlining
 979 *** Outline magic
 980 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 981   (use-package outline-magic)
 982 #+END_SRC
 983 ** Writeroom Mode
 984 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
 985   (use-package writeroom-mode
 986     :config
 987     (defun my/writing-mode ()
 988       "Start my writing mode; enable visual-line-mode and auto-fill-mode"
 989       (interactive)
 990       (if writeroom-mode
 991           (progn
 992             (writeroom-mode -1)
 993             (visual-line-mode -1)
 994             (auto-fill-mode -1)
 995             (visual-fill-column-mode -1)
 996             )
 997         (visual-line-mode 1)
 998         (auto-fill-mode 1)
 999         (visual-fill-column-mode 1)
1000         (writeroom-mode 1))
1001       )
1002     )
1003 #+END_SRC
1004 ** GhostText/Atomic Chrome
1005 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1006   (use-package atomic-chrome
1007     :config
1008     (ignore-errors (atomic-chrome-start-server))
1009     (setq atomic-chrome-buffer-open-style 'full)
1010     )
1011 #+END_SRC
1012 ** Multiple Cursors
1013    :PROPERTIES:
1014    :ID:       6fcf218b-a762-4c37-9339-a8202ddeb544
1015    :END:
1016 [[https://github.com/magnars/multiple-cursors.el][Multiple Cursors]]
1017 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1018   (use-package multiple-cursors
1019     :bind* (("C-;" . mc/mark-all-dwim)
1020             ("C-<" . mc/mark-previous-like-this)
1021             ("C->" . mc/mark-next-like-this)
1022             ("C-S-c C-S-c" . mc/edit-lines))
1023     )
1024 #+END_SRC
1025 ** Web Mode
1026 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1027   (use-package web-mode
1028     :config
1029     (add-to-list 'auto-mode-alist '("\\.tmpl\\'" . web-mode))
1030     (setq web-mode-enable-engine-detection t)
1031     (setq web-mode-engines-alist
1032           '(("template-toolkit" . "\\.tmpl\\'")))
1033     )
1034 #+END_SRC
1035 ** Spamassassin Mode
1036 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1037   (use-package spamassassin-mode
1038     :commands spamassassin-mode
1039     :ensure f
1040     )
1041 #+END_SRC
1042 ** Password Store
1043 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1044   (use-package password-store
1045     :ensure f
1046     :commands password-store-edit password-store-create
1047     )
1048 #+END_SRC
1049 ** CSS mode
1050 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1051   (use-package css
1052     :mode "\\.css'"
1053     :config
1054     ;; fix up css mode to not be silly
1055     ;; from http://www.stokebloke.com/wordpress/2008/03/21/css-mode-indent-buffer-fix/
1056     (setq cssm-indent-level 4)
1057     (setq cssm-newline-before-closing-bracket t)
1058     (setq cssm-indent-function #'cssm-c-style-indenter)
1059     (setq cssm-mirror-mode nil))
1060 #+END_SRC
1061 ** Abbrev Mode
1062 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1063   (use-package abbrev
1064     :diminish abbrev-mode
1065     :config
1066     ;; load abbreviations from
1067     (setq abbrev-file-name
1068           "~/.emacs_abbrev_def")
1069
1070     ;; read the abbrev file if it exists
1071     (if (file-exists-p abbrev-file-name)
1072         (quietly-read-abbrev-file))
1073
1074     ;; for now, use abbrev mode everywhere
1075     (setq default-abbrev-mode t))
1076 #+END_SRC
1077
1078 * Email
1079 ** Mutt
1080 *** Message-mode
1081 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1082   (use-package message
1083     :ensure f
1084     :diminish (message "✉")
1085     :mode ("muttng-[a-z0-9]+-[0-9]+-" . message-mode)
1086     :mode ("mutt-[a-z0-9]+-[0-9]+-" . message-mode)
1087     :hook 'my/message-mode-settings
1088     :hook 'turn-on-flyspell
1089     :bind (:map message-mode-map
1090         ("C-c C-a" . my/post-attach-file))
1091     :delight (message-mode "✉")
1092     :config
1093     (defun my/message-mode-settings ()
1094       (font-lock-add-keywords nil
1095                   '(("^[ \t]*>[ \t]*>[ \t]*>.*$"
1096                  (0 'message-multiply-quoted-text-face))
1097                 ("^[ \t]*>[ \t]*>.*$"
1098                  (0 'message-double-quoted-text-face))))
1099       )
1100
1101     (defun my/post-attach-file ()
1102       "Prompt for an attachment."
1103       (interactive)
1104       (let ((file (read-file-name "Attach file: " nil nil t nil)))
1105         (my/header-attach-file file "")))
1106
1107     (defun my/header-attach-file (file description)
1108       "Attach a FILE to the current message (works with Mutt).
1109     Argument DESCRIPTION MIME description."
1110       (interactive "fAttach file: \nsDescription: ")
1111       (when (> (length file) 0)
1112     (save-excursion
1113       (save-match-data
1114         (save-restriction
1115           (widen)
1116           (goto-char (point-min))
1117           (search-forward-regexp "^$")
1118           (insert (concat "Attach: " (replace-regexp-in-string "\\([[:space:]\\]\\)" "\\\\\\1" (file-truename file)) " "
1119                   description "\n"))
1120           (message (concat "Attached '" file "'."))
1121           (setq post-has-attachment t))))))
1122
1123     (setq mail-yank-prefix "> ")
1124   )
1125 #+END_SRC
1126 *** Muttrc mode
1127 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1128   (use-package muttrc-mode
1129     :mode "muttngrc"
1130     :mode "muttrc"
1131   )
1132
1133 #+END_SRC
1134 * Base emacs
1135 ** Reverting buffers
1136 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1137   (use-package autorevert
1138     :diminish auto-revert-mode
1139     :config
1140     (setq global-auto-revert-non-file-buffers t
1141           global-auto-revert-ignore-modes '(pdf-view-mode)
1142           auto-revert-verbose nil)
1143     (global-auto-revert-mode 1))
1144 #+END_SRC
1145 * Org Mode
1146 ** Use-package and load things
1147 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1148
1149   (use-package org
1150     :delight (org-mode "ø")
1151     :config
1152
1153 #+END_SRC
1154 ** Agenda Configuration
1155 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1156   :mode ("\\.\\(org\\|org_archive\\|txt\\)\\'" . org-mode)
1157   :bind (("C-c l"  . org-store-link)
1158          ("C-c a"  . org-agenda)
1159          ("C-c b"  . org-iswitchb))
1160   :config
1161   (setq-default org-log-done 'time)
1162   (setq-default org-agenda-ndays 5)
1163
1164   ;; agenda configuration
1165   ;; Do not dim blocked tasks
1166   (setq org-agenda-dim-blocked-tasks nil)
1167   (setq org-agenda-inhibit-startup t)
1168   (setq org-agenda-use-tag-inheritance nil)
1169
1170   ;; Compact the block agenda view
1171   (setq org-agenda-compact-blocks t)
1172
1173   ;; Custom agenda command definitions
1174   (setq org-agenda-custom-commands
1175         (quote (("N" "Notes" tags "NOTE"
1176                  ((org-agenda-overriding-header "Notes")
1177                   (org-tags-match-list-sublevels t)))
1178                 ("h" "Habits" tags-todo "STYLE=\"habit\""
1179                  ((org-agenda-overriding-header "Habits")
1180                   (org-agenda-sorting-strategy
1181                    '(todo-state-down effort-up category-keep))))
1182                 (" " "Agenda"
1183                  ((agenda "" nil)
1184                   (tags "REFILE"
1185                         ((org-agenda-overriding-header "Tasks to Refile")
1186                          (org-tags-match-list-sublevels nil)))
1187                   (tags-todo "-CANCELLED/!"
1188                              ((org-agenda-overriding-header "Stuck Projects")
1189                               (org-agenda-skip-function 'bh/skip-non-stuck-projects)
1190                               (org-agenda-sorting-strategy
1191                                '(category-keep))))
1192                   (tags-todo "-HOLD-CANCELLED/!"
1193                              ((org-agenda-overriding-header "Projects")
1194                               (org-agenda-skip-function 'bh/skip-non-projects)
1195                               (org-tags-match-list-sublevels 'indented)
1196                               (org-agenda-sorting-strategy
1197                                '(category-keep))))
1198                   (tags-todo "-CANCELLED/!NEXT"
1199                              ((org-agenda-overriding-header (concat "Project Next Tasks"
1200                                                                     (if bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks
1201                                                                         ""
1202                                                                       " (including WAITING and SCHEDULED tasks)")))
1203                               (org-agenda-skip-function 'bh/skip-projects-and-habits-and-single-tasks)
1204                               (org-tags-match-list-sublevels t)
1205                               (org-agenda-todo-ignore-scheduled bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
1206                               (org-agenda-todo-ignore-deadlines bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
1207                               (org-agenda-todo-ignore-with-date bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
1208                               (org-agenda-sorting-strategy
1209                                '(todo-state-down effort-up category-keep))))
1210                   (tags-todo "-REFILE-CANCELLED-WAITING-HOLD/!"
1211                              ((org-agenda-overriding-header (concat "Project Subtasks"
1212                                                                     (if bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks
1213                                                                         ""
1214                                                                       " (including WAITING and SCHEDULED tasks)")))
1215                               (org-agenda-skip-function 'bh/skip-non-project-tasks)
1216                               (org-agenda-todo-ignore-scheduled bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
1217                               (org-agenda-todo-ignore-deadlines bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
1218                               (org-agenda-todo-ignore-with-date bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
1219                               (org-agenda-sorting-strategy
1220                                '(category-keep))))
1221                   (tags-todo "-REFILE-CANCELLED-WAITING-HOLD/!"
1222                              ((org-agenda-overriding-header (concat "Standalone Tasks"
1223                                                                     (if bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks
1224                                                                         ""
1225                                                                       " (including WAITING and SCHEDULED tasks)")))
1226                               (org-agenda-skip-function 'bh/skip-project-tasks)
1227                               (org-agenda-todo-ignore-scheduled bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
1228                               (org-agenda-todo-ignore-deadlines bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
1229                               (org-agenda-todo-ignore-with-date bh/hide-scheduled-and-waiting-next-tasks)
1230                               (org-agenda-sorting-strategy
1231                                '(category-keep))))
1232                   (tags-todo "-CANCELLED+WAITING|HOLD/!"
1233                              ((org-agenda-overriding-header "Waiting and Postponed Tasks")
1234                               (org-agenda-skip-function 'bh/skip-stuck-projects)
1235                               (org-tags-match-list-sublevels nil)
1236                               (org-agenda-todo-ignore-scheduled t)
1237                               (org-agenda-todo-ignore-deadlines t)))
1238                   (tags "-REFILE/"
1239                         ((org-agenda-overriding-header "Tasks to Archive")
1240                          (org-agenda-skip-function 'bh/skip-non-archivable-tasks)
1241                          (org-tags-match-list-sublevels nil))))
1242                  nil))))
1243
1244   ; org mode agenda files
1245   (setq org-agenda-files
1246         (quote ("~/projects/org-notes/debbugs.org"
1247             "~/projects/org-notes/notes.org"
1248             "~/projects/org-notes/holidays.org"
1249             "~/projects/org-notes/refile.org"
1250             "~/projects/org-notes/diary.org"
1251             "~/projects/org-notes/ool.org"
1252             "~/projects/org-notes/sndservers.org"
1253             "~/projects/org-notes/chaim.org"
1254             "~/projects/org-notes/wildman.org"
1255             "~/projects/org-notes/uddin.org"
1256             "~/projects/org-notes/reviews.org"
1257             "~/org-mode/from-mobile.org"
1258             "~/projects/org-notes/fh.org")))
1259
1260   (set-register ?n (cons 'file "~/projects/org-notes/notes.org"))
1261   (set-register ?r (cons 'file "~/projects/org-notes/refile.org"))
1262   (set-register ?o (cons 'file "~/projects/org-notes/ool.org"))
1263   (set-register ?s (cons 'file "~/projects/org-notes/sndservers.org"))
1264   (set-register ?c (cons 'file "~/projects/org-notes/chaim.org"))
1265   (set-register ?w (cons 'file "~/projects/org-notes/wildman.org"))
1266   (set-register ?u (cons 'file "~/projects/org-notes/uddin.org"))
1267   (set-register ?R (cons 'file "~/projects/reviews/reviews.org"))
1268   (set-register ?d (cons 'file "~/projects/org-notes/diary.org"))
1269   ; from https://emacs.stackexchange.com/questions/909/how-can-i-have-an-agenda-timeline-view-of-multiple-files
1270   (defun org-agenda-timeline-all (&optional arg)
1271     (interactive "P")
1272     (with-temp-buffer
1273       (dolist (org-agenda-file org-agenda-files)
1274         (insert-file-contents org-agenda-file nil)
1275         (goto-char (point-max))
1276         (newline))
1277       (write-file "/tmp/timeline.org")
1278       (org-agenda arg "L")))
1279   (define-key org-mode-map (kbd "C-c t") 'org-agenda-timeline-all)
1280
1281 #+END_SRC
1282 ** General config
1283 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1284   (setq org-global-properties '(("Effort_ALL 0 0:10 0:30 1:00 2:00 3:00 4:00 5:00 6:00 7:00")))
1285   (setq org-columns-default-format "%40ITEM(Task) %6Effort{:} %CLOCKSUM %PRIORITY %TODO %13SCHEDULED %13DEADLINE %TAGS")
1286
1287   (setq org-default-notes-file "~/projects/org-notes/notes.org")
1288   (setq org-id-link-to-org-use-id 'use-existing)
1289 #+END_SRC
1290 ** Capture Templates
1291 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1292   (setq org-capture-templates  ;; mail-specific note template, identified by "m"
1293         '(("m" "Mail" entry (file "~/projects/org-notes/refile.org")
1294            "* %?\n\n  Source: %u, [[%:link][%:description]]\n  %:initial")
1295           ("t" "todo" entry (file "~/projects/org-notes/refile.org")
1296            "* TODO %?\n  :PROPERTIES:\n  :END:\n  :LOGBOOK:\n  :END:\n%U\n%a\n" :clock-in t :clock-resume t)
1297           ("r" "respond" entry (file "~/projects/org-notes/refile.org")
1298            "* NEXT Respond to %:from on %:subject\nSCHEDULED: %t\n%U\n%a\n" :clock-in t :clock-resume t :immediate-finish t)
1299           ("n" "note" entry (file "~/projects/org-notes/refile.org")
1300            "* %? :NOTE:\n%U\n%a\n" :clock-in t :clock-resume t)
1301           ("s" "schedule" entry (file "~/projects/org-notes/refile.org")
1302            "* %? :cal:\n%^{scheduled:}t\n%U\n%a\n" :clock-in t :clock-resume t)
1303           ("j" "Journal" entry (file+datetree "~/projects/org-notes/diary.org")
1304            "* %?\n%U\n" :clock-in t :clock-resume t)
1305           ("w" "org-protocol" entry (file "~/projects/org-notes/refile.org")
1306            "* TODO Review %c\n%U\n" :immediate-finish t)
1307           ("M" "Meeting" entry (file "~/projects/org-notes/refile.org")
1308            "* MEETING with %? :MEETING:\n%U" :clock-in t :clock-resume t)
1309           ("S" "Seminar" entry (file "~/projects/org-notes/refile.org")
1310            "* SEMINAR notes %? :SEMINAR:\n%U" :clock-in t :clock-resume t)
1311           ("P" "Paper to read" entry (file+headline "~/projects/research/papers_to_read.org" "Refile")
1312            "* TODO Get/Read %? \n%U" :clock-in t :clock-resume t)
1313           ("p" "Phone call" entry (file "~/projects/org-notes/refile.org")
1314            "* PHONE %? :PHONE:\n%U" :clock-in t :clock-resume t)
1315           ("J" "job" entry (file "~/projects/org-notes/refile.org")
1316            "* TODO Apply for %a%? :job:\nSCHEDULED: %(format-time-string \"<%Y-%m-%d 17:00-17:30>\")\n%U\n%a\n" :clock-in t :clock-resume t)
1317           ("h" "Habit" entry (file "~/projects/org-notes/refile.org")
1318            "* NEXT %?\n%U\n%a\nSCHEDULED: %(format-time-string \"<%Y-%m-%d .+1d/3d>\")\n:PROPERTIES:\n:STYLE: habit\n:REPEAT_TO_STATE: NEXT\n:END:\n%a\n")
1319           )
1320         )
1321
1322   ;; Remove empty LOGBOOK drawers on clock out
1323   (defun bh/remove-empty-drawer-on-clock-out ()
1324     (interactive)
1325     (save-excursion
1326       (beginning-of-line 0)
1327       (org-remove-empty-drawer-at (point))))
1328
1329   (defun my/org-add-id ()
1330     (interactive)
1331     (save-excursion
1332       (if (org-current-level)
1333           ()
1334         (forward-char 1)
1335         )
1336       (org-id-get-create)
1337       )
1338   )
1339
1340 #+END_SRC
1341 ** Org mode key bindings
1342 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1343   ; org mode configuration from http://doc.norang.ca/org-mode.html
1344   ;; Custom Key Bindings
1345   (global-set-key (kbd "<f12>") 'org-agenda)
1346   ; (global-set-key (kbd "<f5>") 'bh/org-todo)
1347   (global-set-key (kbd "<S-f5>") 'bh/widen)
1348   (global-set-key (kbd "<f7>") 'bh/set-truncate-lines)
1349   (global-set-key (kbd "<f8>") 'org-cycle-agenda-files)
1350   (global-set-key (kbd "<f9> <f9>") 'bh/show-org-agenda)
1351   (global-set-key (kbd "<f9> b") 'bbdb)
1352   (global-set-key (kbd "<f9> c") 'calendar)
1353   (global-set-key (kbd "<f9> f") 'boxquote-insert-file)
1354   (global-set-key (kbd "<f9> h") 'bh/hide-other)
1355   (global-set-key (kbd "<f9> n") 'bh/toggle-next-task-display)
1356   (global-set-key (kbd "<f9> w") 'widen)
1357
1358   ; change the outline mode prefix from C-c @ to C-c C-2
1359   (setq outline-minor-mode-prefix "C-c C-2")
1360   ;(add-hook 'outline-minor-mode-hook
1361   ;          (lambda () (local-set-key (kbd "C-c C-2")
1362   ;                                    outline-mode-prefix-map)))
1363
1364   (global-set-key (kbd "<f9> I") 'bh/punch-in)
1365   (global-set-key (kbd "<f9> O") 'bh/punch-out)
1366
1367   (global-set-key (kbd "<f9> o") 'bh/make-org-scratch)
1368
1369   (global-set-key (kbd "<f9> r") 'boxquote-region)
1370   (global-set-key (kbd "<f9> s") 'bh/switch-to-scratch)
1371
1372   (global-set-key (kbd "<f9> t") 'bh/insert-inactive-timestamp)
1373   (global-set-key (kbd "<f9> T") 'bh/toggle-insert-inactive-timestamp)
1374
1375   (global-set-key (kbd "<f9> v") 'visible-mode)
1376   (global-set-key (kbd "<f9> l") 'org-toggle-link-display)
1377   (global-set-key (kbd "<f9> SPC") 'bh/clock-in-last-task)
1378   (global-set-key (kbd "C-<f9>") 'previous-buffer)
1379   (global-set-key (kbd "M-<f9>") 'org-toggle-inline-images)
1380   (global-set-key (kbd "C-x n r") 'narrow-to-region)
1381   (global-set-key (kbd "C-<f10>") 'next-buffer)
1382   (global-set-key (kbd "<f11>") 'org-clock-goto)
1383   (global-set-key (kbd "C-<f11>") 'org-clock-in)
1384   (global-set-key (kbd "C-s-<f12>") 'bh/save-then-publish)
1385   (global-set-key (kbd "C-c c") 'org-capture)
1386
1387 #+END_SRC
1388 ** Utility Functions
1389 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1390   (defun bh/hide-other ()
1391     (interactive)
1392     (save-excursion
1393       (org-back-to-heading 'invisible-ok)
1394       (hide-other)
1395       (org-cycle)
1396       (org-cycle)
1397       (org-cycle)))
1398
1399   (defun bh/set-truncate-lines ()
1400     "Toggle value of truncate-lines and refresh window display."
1401     (interactive)
1402     (setq truncate-lines (not truncate-lines))
1403     ;; now refresh window display (an idiom from simple.el):
1404     (save-excursion
1405       (set-window-start (selected-window)
1406                         (window-start (selected-window)))))
1407
1408   (defun bh/make-org-scratch ()
1409     (interactive)
1410     (find-file "/tmp/publish/scratch.org")
1411     (gnus-make-directory "/tmp/publish"))
1412
1413   (defun bh/switch-to-scratch ()
1414     (interactive)
1415     (switch-to-buffer "*scratch*"))
1416
1417   (setq org-use-fast-todo-selection t)
1418   (setq org-treat-S-cursor-todo-selection-as-state-change nil)
1419
1420   ; create function to create headlines in file. This comes from
1421   ; http://stackoverflow.com/questions/13340616/assign-ids-to-every-entry-in-org-mode
1422   (defun my/org-add-ids-to-headlines-in-file ()
1423     "Add ID properties to all headlines in the current file which
1424   do not already have one."
1425     (interactive)
1426     (org-map-entries 'org-id-get-create))
1427   ; if we wanted to do this to every buffer, do the following:
1428   ; (add-hook 'org-mode-hook
1429   ;           (lambda ()
1430   ;             (add-hook 'before-save-hook 'my/org-add-ids-to-headlines-in-file nil 'local)))
1431 #+END_SRC
1432 ** Keywords (TODO)
1433 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1434   (setq org-todo-keywords
1435         (quote ((sequence "TODO(t)" "NEXT(n)" "|" "DONE(d)")
1436                 (sequence "WAITING(w@/!)" "HOLD(h@/!)" "|" "CANCELLED(c@/!)" "PHONE" "MEETING"))))
1437
1438   (setq org-todo-keyword-faces
1439         (quote (("TODO" :foreground "red" :weight bold)
1440                 ("NEXT" :foreground "blue" :weight bold)
1441                 ("DONE" :foreground "forest green" :weight bold)
1442                 ("WAITING" :foreground "orange" :weight bold)
1443                 ("HOLD" :foreground "magenta" :weight bold)
1444                 ("CANCELLED" :foreground "forest green" :weight bold)
1445                 ("MEETING" :foreground "forest green" :weight bold)
1446                 ("PHONE" :foreground "forest green" :weight bold))))
1447
1448   (setq org-todo-state-tags-triggers
1449         (quote (("CANCELLED" ("CANCELLED" . t))
1450                 ("WAITING" ("WAITING" . t))
1451                 ("HOLD" ("WAITING") ("HOLD" . t))
1452                 (done ("WAITING") ("HOLD"))
1453                 ("TODO" ("WAITING") ("CANCELLED") ("HOLD"))
1454                 ("NEXT" ("WAITING") ("CANCELLED") ("HOLD"))
1455                 ("DONE" ("WAITING") ("CANCELLED") ("HOLD")))))
1456
1457
1458
1459   ; (add-hook 'org-clock-out-hook 'bh/remove-empty-drawer-on-clock-out 'append)
1460   ; add ids on creation of nodes
1461   (add-hook 'org-capture-prepare-finalize-hook 'my/org-add-id)
1462
1463
1464   ; resolve clocks after 10 minutes of idle; use xprintidle
1465   ; (setq org-clock-idle-time 10)
1466   ; (setq org-clock-x11idle-program-name "xprintidle")
1467
1468   ; this is from http://doc.norang.ca/org-mode.html#Capture
1469   ; use C-M-r for org mode capture
1470   (global-set-key (kbd "C-M-r") 'org-capture)
1471
1472   ; Targets include this file and any file contributing to the agenda - up to 9 levels deep
1473   (setq org-refile-targets (quote ((nil :maxlevel . 9)
1474                                    (org-agenda-files :maxlevel . 9))))
1475
1476   ; Use full outline paths for refile targets - we file directly with IDO
1477   (setq org-refile-use-outline-path t)
1478
1479   ; Targets complete directly with IDO
1480   (setq org-outline-path-complete-in-steps nil)
1481
1482   ; Allow refile to create parent tasks with confirmation
1483   (setq org-refile-allow-creating-parent-nodes (quote confirm))
1484
1485   ; ; Use IDO for both buffer and file completion and ido-everywhere to t
1486   ; (setq org-completion-use-ido t)
1487   ; (setq ido-everywhere t)
1488   ; (setq ido-max-directory-size 100000)
1489   ; (ido-mode (quote both))
1490   ; ; Use the current window when visiting files and buffers with ido
1491   ; (setq ido-default-file-method 'selected-window)
1492   ; (setq ido-default-buffer-method 'selected-window)
1493   ; ; Use the current window for indirect buffer display
1494   ; (setq org-indirect-buffer-display 'current-window)
1495
1496
1497   ;;;; Refile settings
1498   ; Exclude DONE state tasks from refile targets
1499   (defun bh/verify-refile-target ()
1500     "Exclude todo keywords with a done state from refile targets"
1501     (not (member (nth 2 (org-heading-components)) org-done-keywords)))
1502
1503   (setq org-refile-target-verify-function 'bh/verify-refile-target)
1504
1505   ;; ensure that emacsclient will show just the note to be edited when invoked
1506   ;; from Mutt, and that it will shut down emacsclient once finished;
1507   ;; fallback to legacy behavior when not invoked via org-protocol.
1508   (require 'org-protocol)
1509   ; (add-hook 'org-capture-mode-hook 'delete-other-windows)
1510   (setq my-org-protocol-flag nil)
1511   (defadvice org-capture-finalize (after delete-frame-at-end activate)
1512     "Delete frame at remember finalization"
1513     (progn (if my-org-protocol-flag (delete-frame))
1514            (setq my-org-protocol-flag nil)))
1515   (defadvice org-capture-refile (around delete-frame-after-refile activate)
1516     "Delete frame at remember refile"
1517     (if my-org-protocol-flag
1518         (progn
1519           (setq my-org-protocol-flag nil)
1520           ad-do-it
1521           (delete-frame))
1522       ad-do-it)
1523     )
1524   (defadvice org-capture-kill (after delete-frame-at-end activate)
1525     "Delete frame at remember abort"
1526     (progn (if my-org-protocol-flag (delete-frame))
1527            (setq my-org-protocol-flag nil)))
1528   (defadvice org-protocol-capture (before set-org-protocol-flag activate)
1529     (setq my-org-protocol-flag t))
1530
1531   (defadvice org-insert-todo-heading (after dla/create-id activate)
1532     (org-id-get-create)
1533     )
1534
1535   ;; org modules
1536   (add-to-list 'org-modules 'org-habit)
1537
1538   ; this comes from http://upsilon.cc/~zack/blog/posts/2010/02/integrating_Mutt_with_Org-mode/
1539   (defun open-mail-in-mutt (message)
1540     "Open a mail message in Mutt, using an external terminal.
1541
1542   Message can be specified either by a path pointing inside a
1543   Maildir, or by Message-ID."
1544     (interactive "MPath or Message-ID: ")
1545     (shell-command
1546      (format "faf xterm -e \"%s %s\""
1547          (substitute-in-file-name "$HOME/bin/mutt_open") message)))
1548
1549   ;; add support for "mutt:ID" links
1550   (org-add-link-type "mutt" 'open-mail-in-mutt)
1551
1552   (defun my-org-mode-setup ()
1553     ; (load-library "reftex")
1554     (and (buffer-file-name)
1555          (file-exists-p (buffer-file-name))
1556          (progn
1557            ; (reftex-parse-all)
1558            (reftex-set-cite-format
1559             '((?b . "[[bib:%l][%l-bib]]")
1560               (?n . "[[notes:%l][%l-notes]]")
1561               (?c . "\\cite{%l}")
1562               (?h . "*** %t\n:PROPERTIES:\n:Custom_ID: %l\n:END:\n[[papers:%l][%l xoj]] [[papers-pdf:%l][pdf]]")))
1563            ))
1564     (define-key org-mode-map (kbd "C-c )") 'reftex-citation)
1565     (define-key org-mode-map (kbd "C-c [") 'reftex-citation)
1566     (define-key org-mode-map (kbd "C-c (") 'org-mode-reftex-search)
1567     (define-key org-mode-map (kbd "C-c 0") 'reftex-view-crossref)
1568     )
1569   (add-hook 'org-mode-hook 'my-org-mode-setup)
1570
1571   (defun org-mode-reftex-search ()
1572     (interactive)
1573     (org-open-link-from-string (format "[[notes:%s]]" (first (reftex-citation t)))))
1574
1575   (defun open-research-paper (bibtexkey)
1576     "Open a paper by bibtex key"
1577     (interactive "bibtex key: ")
1578     (shell-command
1579      (format "%s %s"
1580          (substitute-in-file-name "$HOME/bin/bibtex_to_paper") bibtexkey)))
1581   (org-add-link-type "papers" 'open-research-paper)
1582   (defun open-research-paper-pdf (bibtexkey)
1583     "Open a paper pdf by bibtex key"
1584     (interactive "bibtex key: ")
1585     (shell-command
1586      (format "%s -p evince_annot %s"
1587          (substitute-in-file-name "$HOME/bin/bibtex_to_paper") bibtexkey)))
1588   (org-add-link-type "papers-pdf" 'open-research-paper-pdf)
1589
1590   (add-to-list 'org-link-abbrev-alist
1591                '("notes" .
1592                  "~/projects/research/paper_notes.org::#%s"))
1593
1594   ; I pretty much always want hiearchical checkboxes
1595   (setq org-hierachical-checkbox-statistics nil)
1596
1597   ;; Add \begin{equation}\end{equation} templates to the org mode easy templates
1598   (add-to-list 'org-structure-template-alist
1599                '("E" "\\begin{equation}\n?\n\\end{equation}"))
1600
1601    ;; stolen from
1602   ;; http://www-public.it-sudparis.eu/~berger_o/weblog/2012/03/23/how-to-manage-and-export-bibliographic-notesrefs-in-org-mode/
1603   (defun my-rtcite-export-handler (path desc format)
1604     (message "my-rtcite-export-handler is called : path = %s, desc = %s, format = %s" path desc format)
1605     (let* ((search (when (string-match "::#?\\(.+\\)\\'" path)
1606                      (match-string 1 path)))
1607            (path (substring path 0 (match-beginning 0))))
1608       (cond ((eq format 'latex)
1609              (if (or (not desc)
1610                      (equal 0 (search "rtcite:" desc)))
1611                  (format "\\cite{%s}" search)
1612                (format "\\cite[%s]{%s}" desc search))))))
1613
1614   (org-add-link-type "rtcite"
1615                      'org-bibtex-open
1616                      'my-rtcite-export-handler)
1617
1618
1619 #+END_SRC
1620 ** Org Mobile Configuration
1621 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1622   (setq-default org-mobile-directory "/linnode.donarmstrong.com:/sites/dav.donarmstrong.com/root/org/")
1623   (when (string= system-name "linnode")
1624     (setq-default org-mobile-directory "/sites/dav.donarmstrong.com/root/org/"))
1625   (setq-default org-directory "/home/don/org-mode/")
1626   (setq-default org-mobile-inbox-for-pull "/home/don/org-mode/from-mobile.org")
1627
1628 #+END_SRC
1629 ** Org iCal Support
1630 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1631   ;; org mode ical export
1632   (setq org-icalendar-timezone "America/Los_Angeles")
1633   (setq org-icalendar-use-scheduled '(todo-start event-if-todo))
1634   ;; we already add the id manually
1635   (setq org-icalendar-store-UID t)
1636
1637 #+END_SRC
1638 ** General Org Babel Configuration
1639 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1640   ;; org babel support
1641   (org-babel-do-load-languages
1642    'org-babel-load-languages
1643    '((emacs-lisp . t )
1644      (R . t)
1645      (latex . t)
1646      (ditaa . t)
1647      (dot . t)
1648      ))
1649   ;; use graphviz-dot for dot things
1650   (add-to-list 'org-src-lang-modes '("dot" . graphviz-dot))
1651   ;; org-babel-by-backend
1652   (defmacro org-babel-by-backend (&rest body)
1653      `(case (if (boundp 'backend)
1654                 (org-export-backend-name backend)
1655               nil) ,@body))
1656
1657   (defun my/fix-inline-images ()
1658     (when org-inline-image-overlays
1659       (org-redisplay-inline-images)))
1660
1661   (add-hook 'org-babel-after-execute-hook
1662              'my/fix-inline-images)
1663
1664 #+END_SRC
1665 ** LaTeX configuration
1666    :PROPERTIES:
1667    :ID:       7135ba17-6a50-4eed-84ca-b90afa5b12f8
1668    :END:
1669 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
1670   (require 'ox-latex)
1671   (add-to-list 'org-latex-classes
1672            '("memarticle"
1673          "\\documentclass[11pt,oneside,article]{memoir}\n"
1674          ("\\section{%s}" . "\\section*{%s}")
1675          ("\\subsection{%s}" . "\\subsection*{%s}")
1676          ("\\subsubsection{%s}" . "\\subsubsection*{%s}")
1677          ("\\paragraph{%s}" . "\\paragraph*{%s}")
1678          ("\\subparagraph{%s}" . "\\subparagraph*{%s}")))
1679
1680   (setq org-beamer-outline-frame-options "")
1681   (add-to-list 'org-latex-classes
1682            '("beamer"
1683          "\\documentclass[ignorenonframetext]{beamer}
1684   [NO-DEFAULT-PACKAGES]
1685   [PACKAGES]
1686   [EXTRA]"
1687          ("\\section{%s}" . "\\section*{%s}")
1688          ("\\subsection{%s}" . "\\subsection*{%s}")
1689          ("\\subsubsection{%s}" . "\\subsubsection*{%s}")
1690          ("\\paragraph{%s}" . "\\paragraph*{%s}")
1691          ("\\subparagraph{%s}" . "\\subparagraph*{%s}")))
1692
1693   (add-to-list 'org-latex-classes
1694            '("membook"
1695          "\\documentclass[11pt,oneside]{memoir}\n"
1696          ("\\chapter{%s}" . "\\chapter*{%s}")
1697          ("\\section{%s}" . "\\section*{%s}")
1698          ("\\subsection{%s}" . "\\subsection*{%s}")
1699          ("\\subsubsection{%s}" . "\\subsubsection*{%s}")))
1700
1701   (add-to-list 'org-latex-classes
1702            '("letter"
1703          "\\documentclass[11pt]{letter}
1704   [NO-DEFAULT-PACKAGES]
1705   [PACKAGES]
1706   [EXTRA]"
1707      ("\\section{%s}" . "\\section*{%s}")
1708          ("\\subsection{%s}" . "\\subsection*{%s}")
1709          ("\\subsubsection{%s}" . "\\subsubsection*{%s}")
1710          ("\\paragraph{%s}" . "\\paragraph*{%s}")
1711          ("\\subparagraph{%s}" . "\\subparagraph*{%s}")))
1712
1713   (add-to-list 'org-latex-classes
1714            '("dlacv"
1715          "\\documentclass{dlacv}
1716   [NO-DEFAULT-PACKAGES]
1717   [NO-PACKAGES]
1718   [NO-EXTRA]"
1719          ("\\section{%s}" . "\\section*{%s}")
1720          ("\\subsection{%s}" . "\\subsection*{%s}")
1721          ("\\subsubsection{%s}" . "\\subsubsection*{%s}")
1722          ("\\paragraph{%s}" . "\\paragraph*{%s}")
1723          ("\\subparagraph{%s}" . "\\subparagraph*{%s}")))
1724
1725
1726   (add-to-list 'org-latex-classes
1727            '("dlaresume"
1728          "\\documentclass{dlaresume}
1729   [NO-DEFAULT-PACKAGES]
1730   [NO-PACKAGES]
1731   [NO-EXTRA]"
1732          ("\\section{%s}" . "\\section*{%s}")
1733          ("\\subsection{%s}" . "\\subsection*{%s}")
1734          ("\\subsubsection{%s}" . "\\subsubsection*{%s}")
1735          ("\\paragraph{%s}" . "\\paragraph*{%s}")
1736          ("\\subparagraph{%s}" . "\\subparagraph*{%s}")))
1737
1738
1739   ;; Originally taken from Bruno Tavernier: http://thread.gmane.org/gmane.emacs.orgmode/31150/focus=31432
1740   ;; but adapted to use latexmk 4.22 or higher.
1741   (setq org-latex-pdf-process '("latexmk -f -pdflatex=xelatex -bibtex -use-make -pdf %f"))
1742
1743   ;; Default packages included in /every/ tex file, latex, pdflatex or xelatex
1744   (setq org-latex-default-packages-alist
1745     '(("" "amsmath" t)
1746       ("" "unicode-math" t)
1747       ))
1748   (setq org-latex-packages-alist
1749     '(("" "graphicx" t)
1750       ("" "fontspec" t)
1751       ("" "xunicode" t)
1752       ("" "hyperref" t)
1753       ("" "url" t)
1754       ("" "rotating" t)
1755       ("" "longtable" nil)
1756       ("" "float" )))
1757
1758   ;; make equations larger
1759   (setq org-format-latex-options (plist-put org-format-latex-options :scale 2.0))
1760
1761   (defun org-create-formula--latex-header ()
1762     "Return LaTeX header appropriate for previewing a LaTeX snippet."
1763     (let ((info (org-combine-plists (org-export--get-global-options
1764              (org-export-get-backend 'latex))
1765             (org-export--get-inbuffer-options
1766              (org-export-get-backend 'latex)))))
1767       (org-latex-guess-babel-language
1768        (org-latex-guess-inputenc
1769     (org-splice-latex-header
1770      org-format-latex-header
1771      org-latex-default-packages-alist
1772      nil t
1773      (plist-get info :latex-header)))
1774        info)))
1775
1776
1777   ; support ignoring headers in org mode export to latex
1778   ; from http://article.gmane.org/gmane.emacs.orgmode/67692
1779   (defadvice org-latex-headline (around my-latex-skip-headlines
1780                     (headline contents info) activate)
1781     (if (member "ignoreheading" (org-element-property :tags headline))
1782     (setq ad-return-value contents)
1783       ad-do-it))
1784
1785   ;; keep latex logfiles
1786
1787   (setq org-latex-remove-logfiles nil)
1788
1789   ;; Resume clocking task when emacs is restarted
1790   (org-clock-persistence-insinuate)
1791   ;;
1792   ;; Show lot of clocking history so it's easy to pick items off the C-F11 list
1793   (setq org-clock-history-length 23)
1794   ;; Resume clocking task on clock-in if the clock is open
1795   (setq org-clock-in-resume t)
1796   ;; Change tasks to NEXT when clocking in; this avoids clocking in when
1797   ;; there are things like PHONE calls
1798   (setq org-clock-in-switch-to-state 'bh/clock-in-to-next)
1799   ;; Separate drawers for clocking and logs
1800   (setq org-drawers (quote ("PROPERTIES" "LOGBOOK")))
1801   ;; Save clock data and state changes and notes in the LOGBOOK drawer
1802   (setq org-clock-into-drawer t)
1803   (setq org-log-into-drawer t)
1804   ;; Sometimes I change tasks I'm clocking quickly - this removes clocked tasks with 0:00 duration
1805   (setq org-clock-out-remove-zero-time-clocks t)
1806   ;; Clock out when moving task to a done state
1807   (setq org-clock-out-when-done t)
1808   ;; Save the running clock and all clock history when exiting Emacs, load it on startup
1809   (setq org-clock-persist t)
1810   ;; Do not prompt to resume an active clock
1811   (setq org-clock-persist-query-resume nil)
1812   ;; Enable auto clock resolution for finding open clocks
1813   (setq org-clock-auto-clock-resolution (quote when-no-clock-is-running))
1814   ;; Include current clocking task in clock reports
1815   (setq org-clock-report-include-clocking-task t)
1816
1817   ;; the cache seems to be broken
1818   (setq org-element-use-cache nil)
1819
1820   (defvar bh/keep-clock-running nil)
1821
1822   (defun bh/is-task-p ()
1823     "Any task with a todo keyword and no subtask"
1824     (save-restriction
1825       (widen)
1826       (let ((has-subtask)
1827             (subtree-end (save-excursion (org-end-of-subtree t)))
1828             (is-a-task (member (nth 2 (org-heading-components)) org-todo-keywords-1)))
1829         (save-excursion
1830           (forward-line 1)
1831           (while (and (not has-subtask)
1832                       (< (point) subtree-end)
1833                       (re-search-forward "^\*+ " subtree-end t))
1834             (when (member (org-get-todo-state) org-todo-keywords-1)
1835               (setq has-subtask t))))
1836         (and is-a-task (not has-subtask)))))
1837   (defun bh/is-project-p ()
1838     "Any task with a todo keyword subtask"
1839     (save-restriction
1840       (widen)
1841       (let ((has-subtask)
1842             (subtree-end (save-excursion (org-end-of-subtree t)))
1843             (is-a-task (member (nth 2 (org-heading-components)) org-todo-keywords-1)))
1844         (save-excursion
1845           (forward-line 1)
1846           (while (and (not has-subtask)
1847                       (< (point) subtree-end)
1848                       (re-search-forward "^\*+ " subtree-end t))
1849             (when (member (org-get-todo-state) org-todo-keywords-1)
1850               (setq has-subtask t))))
1851         (and is-a-task has-subtask))))
1852
1853   (defun bh/is-subproject-p ()
1854     "Any task which is a subtask of another project"
1855     (let ((is-subproject)
1856           (is-a-task (member (nth 2 (org-heading-components)) org-todo-keywords-1)))
1857       (save-excursion
1858         (while (and (not is-subproject) (org-up-heading-safe))
1859           (when (member (nth 2 (org-heading-components)) org-todo-keywords-1)
1860             (setq is-subproject t))))
1861       (and is-a-task is-subproject)))
1862
1863
1864   (defun bh/clock-in-to-next (kw)
1865     "Switch a task from TODO to NEXT when clocking in.
1866   Skips capture tasks, projects, and subprojects.
1867   Switch projects and subprojects from NEXT back to TODO"
1868     (when (not (and (boundp 'org-capture-mode) org-capture-mode))
1869       (cond
1870        ((and (member (org-get-todo-state) (list "TODO"))
1871          (bh/is-task-p))
1872     "NEXT")
1873        ((and (member (org-get-todo-state) (list "NEXT"))
1874          (bh/is-project-p))
1875     "TODO"))))
1876
1877   (defun bh/punch-in (arg)
1878     "Start continuous clocking and set the default task to the
1879   selected task.  If no task is selected set the Organization task
1880   as the default task."
1881     (interactive "p")
1882     (setq bh/keep-clock-running t)
1883     (if (equal major-mode 'org-agenda-mode)
1884     ;;
1885     ;; We're in the agenda
1886     ;;
1887     (let* ((marker (org-get-at-bol 'org-hd-marker))
1888            (tags (org-with-point-at marker (org-get-tags-at))))
1889       (if (and (eq arg 4) tags)
1890           (org-agenda-clock-in '(16))
1891         (bh/clock-in-organization-task-as-default)))
1892       ;;
1893       ;; We are not in the agenda
1894       ;;
1895       (save-restriction
1896     (widen)
1897     ; Find the tags on the current task
1898     (if (and (equal major-mode 'org-mode) (not (org-before-first-heading-p)) (eq arg 4))
1899         (org-clock-in '(16))
1900       (bh/clock-in-organization-task-as-default)))))
1901
1902   (defun bh/punch-out ()
1903     (interactive)
1904     (setq bh/keep-clock-running nil)
1905     (when (org-clock-is-active)
1906       (org-clock-out))
1907     (org-agenda-remove-restriction-lock))
1908
1909   (defun bh/clock-in-default-task ()
1910     (save-excursion
1911       (org-with-point-at org-clock-default-task
1912     (org-clock-in))))
1913
1914   (defun bh/clock-in-parent-task ()
1915     "Move point to the parent (project) task if any and clock in"
1916     (let ((parent-task))
1917       (save-excursion
1918     (save-restriction
1919       (widen)
1920       (while (and (not parent-task) (org-up-heading-safe))
1921         (when (member (nth 2 (org-heading-components)) org-todo-keywords-1)
1922           (setq parent-task (point))))
1923       (if parent-task
1924           (org-with-point-at parent-task
1925         (org-clock-in))
1926         (when bh/keep-clock-running
1927           (bh/clock-in-default-task)))))))
1928
1929   (defvar bh/organization-task-id "e22cb8bf-07c7-408b-8f60-ff3aadac95e4")
1930
1931   (defun bh/clock-in-organization-task-as-default ()
1932     (interactive)
1933     (org-with-point-at (org-id-find bh/organization-task-id 'marker)
1934       (org-clock-in '(16))))
1935
1936   (defun bh/clock-out-maybe ()
1937     (when (and bh/keep-clock-running
1938            (not org-clock-clocking-in)
1939            (marker-buffer org-clock-default-task)
1940            (not org-clock-resolving-clocks-due-to-idleness))
1941       (bh/clock-in-parent-task)))
1942
1943   ; (add-hook 'org-clock-out-hook 'bh/clock-out-maybe 'append)
1944
1945   (require 'org-id)
1946   (defun bh/clock-in-task-by-id (id)
1947     "Clock in a task by id"
1948     (org-with-point-at (org-id-find id 'marker)
1949       (org-clock-in nil)))
1950
1951   (defun bh/clock-in-last-task (arg)
1952     "Clock in the interrupted task if there is one
1953   Skip the default task and get the next one.
1954   A prefix arg forces clock in of the default task."
1955     (interactive "p")
1956     (let ((clock-in-to-task
1957        (cond
1958         ((eq arg 4) org-clock-default-task)
1959         ((and (org-clock-is-active)
1960           (equal org-clock-default-task (cadr org-clock-history)))
1961          (caddr org-clock-history))
1962         ((org-clock-is-active) (cadr org-clock-history))
1963         ((equal org-clock-default-task (car org-clock-history)) (cadr org-clock-history))
1964         (t (car org-clock-history)))))
1965       (widen)
1966       (org-with-point-at clock-in-to-task
1967     (org-clock-in nil))))
1968
1969
1970   (defun org-export-to-ods ()
1971     (interactive)
1972     (let ((csv-file "data.csv"))
1973       (org-table-export csv-file "orgtbl-to-csv")
1974       (org-odt-convert csv-file "ods" 'open)))
1975
1976   ; allow for zero-width-space to be a break in regexp too
1977   ; (setcar org-emphasis-regexp-components " [:space:] \t('\"{")
1978   ; (setcar (nthcdr 1 org-emphasis-regexp-components) " [:space:]- \t.,:!?;'\")}\\")
1979   ; (org-set-emph-re 'org-emphasis-regexp-components org-emphasis-regexp-components)
1980
1981   ;; support inserting screen shots
1982   (defun my/org-insert-screenshot ()
1983     "Take a screenshot into a time stamped unique-named file in the
1984   same directory as the org-buffer and insert a link to this file."
1985     (interactive)
1986     (defvar my/org-insert-screenshot/filename)
1987     (setq my/org-insert-screenshot/filename
1988       (read-file-name
1989        "Screenshot to insert: "
1990        nil
1991        (concat (buffer-file-name) "_" (format-time-string "%Y%m%d_%H%M%S") ".png")
1992        )
1993       )
1994     (call-process "import" nil nil nil my/org-insert-screenshot/filename)
1995     (insert (concat "[[" my/org-insert-screenshot/filename "]]"))
1996     (org-display-inline-images))
1997
1998   (defun my/fix-inline-images ()
1999     (when org-inline-image-overlays
2000       (org-redisplay-inline-images)))
2001
2002   (add-hook 'org-babel-after-execute-hook 'my/fix-inline-images)
2003
2004   ;; use xelatex to preview with imagemagick
2005   (add-to-list 'org-preview-latex-process-alist
2006            '(xelateximagemagick
2007         :programs ("xelatex" "convert")
2008         :description "pdf > png"
2009         :message "you need to install xelatex and imagemagick"
2010         :use-xcolor t
2011         :image-input-type "pdf"
2012         :image-output-type "png"
2013         :image-size-adjust (1.0 . 1.0)
2014         :latex-compiler ("xelatex -interaction nonstopmode -output-directory %o %f")
2015         :image-converter ("convert -density %D -trim -antialias %f -quality 100 %O"))
2016            )
2017   ;; use xelatex by default
2018   (setq org-preview-latex-default-process 'xelateximagemagick)
2019
2020   ; from http://orgmode.org/Changes.html
2021   (defun my/org-repair-property-drawers ()
2022     "Fix properties drawers in current buffer.
2023    Ignore non Org buffers."
2024     (interactive)
2025     (when (eq major-mode 'org-mode)
2026       (org-with-wide-buffer
2027        (goto-char (point-min))
2028        (let ((case-fold-search t)
2029          (inline-re (and (featurep 'org-inlinetask)
2030                  (concat (org-inlinetask-outline-regexp)
2031                      "END[ \t]*$"))))
2032      (org-map-entries
2033       (lambda ()
2034         (unless (and inline-re (org-looking-at-p inline-re))
2035           (save-excursion
2036         (let ((end (save-excursion (outline-next-heading) (point))))
2037           (forward-line)
2038           (when (org-looking-at-p org-planning-line-re) (forward-line))
2039           (when (and (< (point) end)
2040                  (not (org-looking-at-p org-property-drawer-re))
2041                  (save-excursion
2042                    (and (re-search-forward org-property-drawer-re end t)
2043                     (eq (org-element-type
2044                      (save-match-data (org-element-at-point)))
2045                     'drawer))))
2046             (insert (delete-and-extract-region
2047                  (match-beginning 0)
2048                  (min (1+ (match-end 0)) end)))
2049             (unless (bolp) (insert "\n"))))))))))))
2050
2051 #+END_SRC
2052 ** Org-Gcal
2053 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2054   (use-package calfw
2055     :ensure f
2056     )
2057   (use-package calfw-org
2058     :ensure f
2059     )
2060   (use-package org-gcal
2061     :ensure f
2062     :config '((if (file-readable-p "~/.hide/org_gcal.el")
2063                   (load-file "~/.hide/org_gcal.el"))
2064               )
2065     )
2066 #+END_SRC
2067 ** appt integration
2068 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2069   (use-package appt
2070     :ensure f
2071     :config
2072     ;; Show notification 10 minutes before event
2073     (setq appt-message-warning-time 10)
2074     ;; Disable multiple reminders
2075     (setq appt-display-interval appt-message-warning-time)
2076     (setq appt-display-mode-line nil)
2077
2078     ;; add automatic reminders for appointments
2079     (defun my/org-agenda-to-appt ()
2080       (interactive)
2081       (setq appt-time-msg-list nil)
2082       (org-agenda-to-appt))
2083     ;; add reminders when starting emacs
2084     (my/org-agenda-to-appt)
2085     ;; when rebuilding the agenda
2086     (defadvice  org-agenda-redo (after org-agenda-redo-add-appts)
2087       "Pressing `r' on the agenda will also add appointments."
2088       (my/org-agenda-to-appt)
2089       )
2090     ;; when saving all org buffers
2091     (defadvice org-save-all-org-buffers (after org-save-all-org-buffers-add-appts)
2092       "Re-add appts after saving all org buffers"
2093       (my/org-agenda-to-appt))
2094     ;; Display appointments as a window manager notification
2095     (setq appt-disp-window-function 'my/appt-display)
2096     (setq appt-delete-window-function (lambda () t))
2097
2098     (setq my/appt-notification-app (concat (getenv "HOME") "/bin/appt_notification"))
2099
2100     (defun my/appt-display (min-to-app new-time msg)
2101       (if (atom min-to-app)
2102       (start-process "my/appt-notification-app" nil my/appt-notification-app min-to-app msg)
2103     (dolist (i (number-sequence 0 (1- (length min-to-app))))
2104       (start-process "my/appt-notification-app" nil my/appt-notification-app
2105                      (nth i min-to-app) (nth i msg))))
2106       )
2107     )
2108
2109
2110 #+END_SRC
2111 ** End use-package
2112 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2113   )
2114 #+END_SRC
2115 * Keybindings
2116 ** Goto line
2117 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2118   (global-unset-key "\M-g")
2119   (global-set-key (kbd "M-g l") 'goto-line)
2120 #+END_SRC
2121 * Debian
2122 ** debian-changelog
2123 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2124   (use-package debian-changelog
2125     :ensure f
2126     :mode "debian/changelog"
2127     :config
2128     (setq debian-changelog-mailing-address "don@debian.org")
2129     (setq debian-changelog-full-name "Don Armstrong"))
2130 #+END_SRC
2131 * Misc (uncharacterized)
2132 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2133   (setq calendar-latitude 38.6)
2134   (setq calendar-longitude -121.5)
2135   (setq case-fold-search t)
2136   (setq confirm-kill-emacs (quote y-or-n-p))
2137   (setq cperl-lazy-help-time nil)
2138   (display-time)
2139   (setq display-time-24hr-format t)
2140   (setq display-time-day-and-date t)
2141   (display-time-mode 1)
2142   (global-font-lock-mode 1)
2143   (icomplete-mode 1)
2144   (setq log-edit-keep-buffer t)
2145   (setq mail-user-agent (quote sendmail-user-agent))
2146   (setq markdown-enable-math t)
2147   (setq markdown-follow-wiki-link-on-enter nil)
2148   (setq mutt-alias-file-list (quote ("~/.mutt/aliases" "~/.mail_aliases")))
2149   (setq ps-footer-font-size (quote (8 . 10)))
2150   (setq ps-header-font-size (quote (8 . 10)))
2151   (setq ps-header-title-font-size (quote (10 . 10)))
2152   (setq ps-line-number-color "blue")
2153   (setq ps-print-footer t)
2154   (setq ps-print-footer-frame nil)
2155   (setq ps-print-only-one-header t)
2156   (setq sentence-end "[.?!][]\"')]*\\($\\|   \\| \\)[
2157   ]*")
2158   (setq sentence-end-double-space nil)
2159   ; enable matching parenthesis
2160   (show-paren-mode 1)
2161   (tool-bar-mode -1)
2162   (setq user-mail-address "don@donarmstrong.com")
2163   (setq vc-delete-logbuf-window nil)
2164   (setq vc-follow-symlinks t)
2165
2166   ;; use git before SVN; use CVS earlier, because I have CVS
2167   ;; repositories inside of git directories
2168   (setq vc-handled-backends (quote (CVS Git RCS SVN SCCS Bzr Hg Mtn Arch)))
2169
2170   ;; switch back to the old primary selection method
2171   (setq x-select-enable-clipboard nil)
2172   (setq x-select-enable-primary t)
2173   ; (setq mouse-drag-copy-region t)
2174
2175   (fset 'perl-mode 'cperl-mode)
2176   ;;(load-file "cperl-mode.el")
2177
2178   ;; tramp configuration
2179   (setq tramp-use-ssh-controlmaster-options nil)
2180
2181   (setq-default c-indent-level 4)
2182   (setq-default c-brace-imaginary-offset 0)
2183   (setq-default c-brace-offset -4)
2184   (setq-default c-argdecl-indent 4)
2185   (setq-default c-label-offset -4)
2186   (setq-default c-continued-statement-offset 4)
2187   ; tabs are annoying
2188   (setq-default indent-tabs-mode nil)
2189   (setq-default tab-width 4)
2190
2191
2192   ;; (autoload 'php-mode "php-mode" "PHP editing mode" t)
2193   ;; (add-to-list 'auto-mode-alist '("\\.php3?\\'" . php-mode))
2194   ;; (add-to-list 'auto-mode-alist '("\\.phtml?\\'" . php-mode))
2195   ;; (add-to-list 'auto-mode-alist '("\\.php?\\'" . php-mode))
2196   ;; (add-to-list 'auto-mode-alist '("\\.php4?\\'" . php-mode))
2197
2198
2199   (defun insert-date ()
2200     "Insert date at point."
2201     (interactive)
2202     (insert (format-time-string "%A, %B %e, %Y %k:%M:%S %Z")))
2203   (global-set-key "\C-[d" 'insert-date)
2204
2205   (defun unfill-paragraph (arg)
2206     "Pull this whole paragraph up onto one line."
2207     (interactive "*p")
2208     (let ((fill-column 10000))
2209       (fill-paragraph arg))
2210     )
2211
2212   (column-number-mode t)
2213
2214 #+END_SRC
2215 ** Desktop-save-mode
2216 If the envvar EMACS_SERVER_NAME is set, consider this a separate
2217 emacs, and use a different desktop file to restore history
2218 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2219   (use-package emacs
2220     :demand
2221     :config
2222     (setq desktop-base-file-name
2223           (convert-standard-filename
2224            (concat ".emacs"
2225                    (or (getenv "EMACS_SERVER_NAME")
2226                        "")
2227                    ".desktop")
2228            ))
2229     (setq desktop-base-lock-name
2230           (convert-standard-filename
2231            (concat desktop-base-file-name
2232                    ".lock")))
2233     (setq desktop-auto-save-timeout 60)
2234     (setq desktop-restore-eager 5)
2235     (setq desktop-lazy-verbose nil)
2236     (desktop-save-mode 1)
2237     ; (desktop-read)
2238   )
2239 #+END_SRC
2240 ** Misc (Uncharacterized)
2241 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2242   '(icomplete-mode on)
2243   (custom-set-faces
2244    ;; custom-set-faces was added by Custom.
2245    ;; If you edit it by hand, you could mess it up, so be careful.
2246    ;; Your init file should contain only one such instance.
2247    ;; If there is more than one, they won't work right.
2248    '(menu ((((type x-toolkit)) (:background "black" :foreground "grey90")))))
2249
2250
2251   (put 'upcase-region 'disabled nil)
2252   (put 'downcase-region 'disabled nil)
2253   (put 'narrow-to-region 'disabled nil)
2254
2255   ; (defun turn-on-flyspell ()
2256   ;    "Force flyspell-mode on using a positive arg.  For use in hooks."
2257   ;    (interactive)
2258   ;    (flyspell-mode 1))
2259
2260
2261    ; Outline-minor-mode key map
2262    (define-prefix-command 'cm-map nil "Outline-")
2263    ; HIDE
2264    (define-key cm-map "q" 'outline-hide-sublevels)    ; Hide everything but the top-level headings
2265    (define-key cm-map "t" 'outline-hide-body)         ; Hide everything but headings (all body lines)
2266    (define-key cm-map "o" 'outline-hide-other)        ; Hide other branches
2267    (define-key cm-map "c" 'outline-hide-entry)        ; Hide this entry's body
2268    (define-key cm-map "l" 'outline-hide-leaves)       ; Hide body lines in this entry and sub-entries
2269    (define-key cm-map "d" 'outline-hide-subtree)      ; Hide everything in this entry and sub-entries
2270    ; SHOW
2271    (define-key cm-map "a" 'outline-show-all)          ; Show (expand) everything
2272    (define-key cm-map "e" 'outline-show-entry)        ; Show this heading's body
2273    (define-key cm-map "i" 'outline-show-children)     ; Show this heading's immediate child sub-headings
2274    (define-key cm-map "k" 'outline-show-branches)     ; Show all sub-headings under this heading
2275    (define-key cm-map "s" 'outline-show-subtree)      ; Show (expand) everything in this heading & below
2276    ; MOVE
2277    (define-key cm-map "u" 'outline-up-heading)                ; Up
2278    (define-key cm-map "n" 'outline-next-visible-heading)      ; Next
2279    (define-key cm-map "p" 'outline-previous-visible-heading)  ; Previous
2280    (define-key cm-map "f" 'outline-forward-same-level)        ; Forward - same level
2281    (define-key cm-map "b" 'outline-backward-same-level)       ; Backward - same level
2282    (global-set-key "\M-o" cm-map)
2283   ; fix up tmux xterm keys
2284   ; stolen from http://unix.stackexchange.com/questions/24414/shift-arrow-not-working-in-emacs-within-tmux
2285   (defun fix-up-tmux-keys ()
2286       "Fix up tmux xterm keys"
2287       (if (getenv "TMUX")
2288           (progn
2289             (let ((x 2) (tkey ""))
2290               (while (<= x 8)
2291                 ;; shift
2292                 (if (= x 2)
2293                     (setq tkey "S-"))
2294                 ;; alt
2295                 (if (= x 3)
2296                     (setq tkey "M-"))
2297                 ;; alt + shift
2298                 (if (= x 4)
2299                     (setq tkey "M-S-"))
2300                 ;; ctrl
2301                 (if (= x 5)
2302                     (setq tkey "C-"))
2303                 ;; ctrl + shift
2304                 (if (= x 6)
2305                     (setq tkey "C-S-"))
2306                 ;; ctrl + alt
2307                 (if (= x 7)
2308                     (setq tkey "C-M-"))
2309                 ;; ctrl + alt + shift
2310                 (if (= x 8)
2311                     (setq tkey "C-M-S-"))
2312
2313                 ;; arrows
2314                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d A" x)) (kbd (format "%s<up>" tkey)))
2315                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d B" x)) (kbd (format "%s<down>" tkey)))
2316                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d C" x)) (kbd (format "%s<right>" tkey)))
2317                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d D" x)) (kbd (format "%s<left>" tkey)))
2318                 ;; home
2319                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d H" x)) (kbd (format "%s<home>" tkey)))
2320                 ;; end
2321                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d F" x)) (kbd (format "%s<end>" tkey)))
2322                 ;; page up
2323                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 5 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<prior>" tkey)))
2324                 ;; page down
2325                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 6 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<next>" tkey)))
2326                 ;; insert
2327                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 2 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<delete>" tkey)))
2328                 ;; delete
2329                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 3 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<delete>" tkey)))
2330                 ;; f1
2331                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d P" x)) (kbd (format "%s<f1>" tkey)))
2332                 ;; f2
2333                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d Q" x)) (kbd (format "%s<f2>" tkey)))
2334                 ;; f3
2335                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d R" x)) (kbd (format "%s<f3>" tkey)))
2336                 ;; f4
2337                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 1 ; %d S" x)) (kbd (format "%s<f4>" tkey)))
2338                 ;; f5
2339                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 15 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f5>" tkey)))
2340                 ;; f6
2341                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 17 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f6>" tkey)))
2342                 ;; f7
2343                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 18 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f7>" tkey)))
2344                 ;; f8
2345                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 19 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f8>" tkey)))
2346                 ;; f9
2347                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 20 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f9>" tkey)))
2348                 ;; f10
2349                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 21 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f10>" tkey)))
2350                 ;; f11
2351                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 23 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f11>" tkey)))
2352                 ;; f12
2353                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 24 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f12>" tkey)))
2354                 ;; f13
2355                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 25 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f13>" tkey)))
2356                 ;; f14
2357                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 26 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f14>" tkey)))
2358                 ;; f15
2359                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 28 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f15>" tkey)))
2360                 ;; f16
2361                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 29 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f16>" tkey)))
2362                 ;; f17
2363                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 31 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f17>" tkey)))
2364                 ;; f18
2365                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 32 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f18>" tkey)))
2366                 ;; f19
2367                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 33 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f19>" tkey)))
2368                 ;; f20
2369                 (define-key key-translation-map (kbd (format "M-[ 34 ; %d ~" x)) (kbd (format "%s<f20>" tkey)))
2370
2371                 (setq x (+ x 1))
2372                 ))
2373             )
2374         )
2375       )
2376   ; (add-hook 'tty-setup-hook 'fix-up-tmux-keys)
2377
2378   (defadvice ask-user-about-supersession-threat (around ask-user-about-supersession-threat-if-necessary)
2379     "Call ask-user-about-supersession-threat only if the buffer is actually obsolete."
2380     (if (or (buffer-modified-p)
2381             (verify-visited-file-modtime)
2382             (< (* 8 1024 1024) (buffer-size))
2383             (/= 0 (call-process-region 1 (+ 1 (buffer-size)) "diff" nil nil nil "-q" (buffer-file-name) "-")))
2384         ad-do-it
2385       (clear-visited-file-modtime)
2386       (not-modified)))
2387   (ad-activate 'ask-user-about-supersession-threat)
2388 #+END_SRC
2389
2390 * Start Server
2391 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2392   (use-package server
2393     :config
2394     (setq server-name
2395           (or (getenv "EMACS_SERVER_NAME")
2396               "server"))
2397     (unless (server-running-p)
2398       (global-set-key "\C-xp" 'server-edit)
2399       (server-start)))
2400 #+END_SRC
2401
2402
2403
2404 * END
2405 #+BEGIN_SRC emacs-lisp
2406   (provide 'don-configuration)
2407 #+END_SRC