]> git.donarmstrong.com Git - biopieces.git/blobdiff - bp_test/test_all
fixed encoding bug in read_454
[biopieces.git] / bp_test / test_all
index afed9f17ceab00f6f323d08f2a1f8e8d2508955a..fd358e7bae2f1b8d86e90d5057e976be30d137f4 100755 (executable)
@@ -15,11 +15,15 @@ test_perl_module "Time::HiRes"
 test_ruby
 test_ruby_gem "gnuplot"
 test_ruby_gem "narray"
+test_ruby_gem "RubyInline"
+test_ruby_gem "terminal-table"
 test_aux_program "blastall"
 test_aux_program "blat"
 test_aux_program "bwa"
 test_aux_program "bowtie"
+test_aux_program "bowtie2"
 test_aux_program "formatdb"
+test_aux_program "hmmsearch"
 test_aux_program "gnuplot"
 test_aux_program "idba"
 test_aux_program "muscle"
@@ -28,7 +32,7 @@ test_aux_program "mysql"
 test_aux_program "prodigal"
 test_aux_program "Ray"
 test_aux_program "scan_for_matches"
-test_aux_program "uclust"
+test_aux_program "usearch"
 test_aux_program "velveth"
 test_aux_program "velvetg"
 test_aux_program "vmatch"