]> git.donarmstrong.com Git - biopieces.git/blobdiff - bp_test/test/test_read_fastq
rewrite of FASTQ internals
[biopieces.git] / bp_test / test / test_read_fastq
index 6c597640c5880e7adbbafb473de478d20f8a9e5e..cf7d324101df4cb54f24f46ce2ad240a8ca696a9 100755 (executable)
@@ -6,14 +6,22 @@ run "$bp -i $in.1 -O $tmp"
 assert_no_diff $tmp $out.1
 clean
 
+run "$bp -i $in.1 -e base_33 -O $tmp"
+assert_no_diff $tmp $out.1
+clean
+
 run "$bp -i $in.2 -O $tmp"
 assert_no_diff $tmp $out.2
 clean
 
-run "$bp -i $in.2.gz -O $tmp"
+run "$bp -i $in.2 -e base_64 -O $tmp"
 assert_no_diff $tmp $out.2
 clean
 
-run "$bp -i $in.2 -n 1 -O $tmp"
+run "$bp -i $in.1.gz -O $tmp"
+assert_no_diff $tmp $out.1
+clean
+
+run "$bp -i $in.1 -n 1 -O $tmp"
 assert_no_diff $tmp $out.3
 clean