]> git.donarmstrong.com Git - biopieces.git/blobdiff - bp_test/out/patscan_seq.out.5
fixed overlap bug in patscan_seq
[biopieces.git] / bp_test / out / patscan_seq.out.5
index bf37a96b58ac8909eae15bc09c09521e99c8c104..42fb5f5893ce6e4ed87919aa992cf8b935393e5c 100644 (file)
@@ -3,20 +3,28 @@ KEY: VALUE
 SEQ_NAME: test1
 SEQ: LLRVDNIIRARPRTANRQHM
 SEQ_LEN: 20
-PATTERN: RARP
+---
+REC_TYPE: PATSCAN
+S_ID: test1
+Q_ID: RARP
 MATCH: RARP
 S_BEG: 8
 S_END: 11
 STRAND: +
+SCORE: 100
 MATCH_LEN: 4
 ---
 SEQ_NAME: test2
 SEQ: NIIRARPRTAN
 SEQ_LEN: 11
-PATTERN: RARP
+---
+REC_TYPE: PATSCAN
+S_ID: test2
+Q_ID: RARP
 MATCH: RARP
 S_BEG: 3
 S_END: 6
 STRAND: +
+SCORE: 100
 MATCH_LEN: 4
 ---