archive_analysis

   1 #!/usr/bin/perl
   2 # archive_analysis archives a set of analysis files
   3 # and is released under the terms of the GNU GPL version 3, or any
   4 # later version, at your option. See the file README and COPYING for
   5 # more information.
   6 # Copyright 2013 by Don Armstrong <don@donarmstrong.com>.
   7
   8
   9 use warnings;
  10 use strict;
  11
  12 use Getopt::Long;
  13 use Pod::Usage;
  14
  15 =head1 NAME
  16
  17 archive_analysis - archives a set of analysis files
  18
  19 =head1 SYNOPSIS
  20
  21 archive_analysis [options]
  22
  23  Options:
  24   --debug, -d debugging level (Default 0)
  25   --help, -h display this help
  26   --man, -m display manual
  27
  28 =head1 OPTIONS
  29
  30 =over
  31
  32 =item B<--debug, -d>
  33
  34 Debug verbosity. (Default 0)
  35
  36 =item B<--help, -h>
  37
  38 Display brief usage information.
  39
  40 =item B<--man, -m>
  41
  42 Display this manual.
  43
  44 =back
  45
  46 =head1 EXAMPLES
  47
  48 archive_analysis
  49
  50 =cut
  51
  52
  53 use File::Spec;
  54 use File::Copy;
  55 use Cwd;
  56
  57 use vars qw($DEBUG);
  58
  59 my %options = (debug           => 0,
  60                help            => 0,
  61                man             => 0,
  62                );
  63
  64 GetOptions(\%options,
  65            'archive_dir|archive-dir=s@',
  66            'git_annex|git-annex!',
  67            'debug|d+','help|h|?','man|m');
  68
  69 pod2usage() if $options{help};
  70 pod2usage({verbose=>2}) if $options{man};
  71
  72 $DEBUG = $options{debug};
  73
  74 # maybe eventually use Config::IniFiles or similar
  75 my @USAGE_ERRORS;
  76 if (not defined $options{archive_dir}) {
  77     push @USAGE_ERRORS, "You must pass an --archive-dir";
  78 }
  79
  80 if (not @ARGV) {
  81      push @USAGE_ERRORS,"You must give files to archive";
  82 }
  83
  84 pod2usage(join("\n",@USAGE_ERRORS)) if @USAGE_ERRORS;
  85
  86
  87 for my $file (@ARGV) {
  88     if (not -r $file) {
  89         fail("file $file does not exist or is not readable.\n");
  90     }
  91     # figure out which VCS is in use
  92     my $vcs = determine_vcs($file);
  93     if (not defined $vcs) {
  94         fail("Unable to determine which VCS this is");
  95     }
  96     my $revision = find_vcs_revision($file,$vcs);
  97     if (not defined $revision) {
  98         fail("Unable to determine which revision this is");
  99     }
 100     my $new_file = $file;
 101     $new_file =~ s/(\.[^\.\/]{1,5}|)$/_$revision$1/;
 102     my ($v,$d,$nf) = File::Spec->splitpath($new_file);
 103     for my $dir (make_list($options{archive_dir})) {
 104         my $loc = File::Spec->join($dir,$nf);
 105         next if -e $loc;
 106         copy($file,$loc) or
 107             fail("Unable to copy file $file to $loc: $!\n");
 108         if ($options{git_annex}) {
 109             git_annex($loc);
 110         }
 111     }
 112 }
 113
 114 sub git_annex{
 115     my ($file) = @_;
 116
 117     my $abs_path = File::Spec->rel2abs($file);
 118     my ($v,$d,$nf) = File::Spec->splitpath($abs_path);
 119     my $old_dir = getcwd();
 120     chdir($d);
 121     system('git','annex','add',$nf);
 122     chdir($old_dir);
 123 }
 124
 125 sub determine_vcs {
 126     my ($file) = @_;
 127
 128     my $abs_path = File::Spec->rel2abs($file);
 129     my @dirs = File::Spec->splitdir($abs_path);
 130     for my $i (reverse 0..$#dirs) {
 131         my $dir = File::Spec->catdir(@dirs[0..$i]);
 132         for my $vcs (qw(git svn bzr)) {
 133             if ( -e File::Spec->catdir($dir,'.'.$vcs)) {
 134                 return $vcs;
 135             }
 136         }
 137     }
 138     return undef;
 139 }
 140
 141 sub find_vcs_revision{
 142     my ($file,$vcs) = @_;
 143     if (not defined $vcs) {
 144         $vcs = determine_vcs($file);
 145     }
 146
 147     if ($vcs eq 'git') {
 148         my $old_dir = getcwd();
 149         my $abs_path = File::Spec->rel2abs($file);
 150         my ($v,$d,$nf) = File::Spec->splitpath($abs_path);
 151         chdir($d);
 152         my $branch = qx(git name-rev --name-only HEAD);
 153         chomp $branch;
 154         my $rev = qx(git rev-parse --short HEAD);
 155         chomp $rev;
 156         chdir($old_dir);
 157         return $branch.'@'.$rev;
 158     } else {
 159         fail("vcs $vcs not currently supported");
 160     }
 161 }
 162
 163
 164
 165 sub fail {
 166     print STDERR @_;
 167     exit 1;
 168 }
 169
 170 sub make_list {
 171      return map {(ref($_) eq 'ARRAY')?@{$_}:$_} @_;
 172 }
 173
 174
 175 __END__