]> git.donarmstrong.com Git - bamtools.git/tree
Merge BamMultiReader and SetRegion into bamtools convert
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-rw-r--r-- 10753 BGZF.h
-rw-r--r-- 23199 BamAux.h
-rw-r--r-- 15953 BamMultiReader.cpp
-rw-r--r-- 4865 BamMultiReader.h
-rw-r--r-- 45804 BamReader.cpp
-rw-r--r-- 3624 BamReader.h
-rw-r--r-- 12962 BamWriter.cpp
-rw-r--r-- 1566 BamWriter.h
-rw-r--r-- 1127 LICENSE
-rw-r--r-- 531 Makefile
-rw-r--r-- 3619 README
-rw-r--r-- 5472 bamtools.cpp
-rw-r--r-- 14130 bamtools_convert.cpp
-rw-r--r-- 987 bamtools_convert.h
-rw-r--r-- 6009 bamtools_count.cpp
-rw-r--r-- 989 bamtools_count.h
-rw-r--r-- 2337 bamtools_coverage.cpp
-rw-r--r-- 1032 bamtools_coverage.h
-rw-r--r-- 2679 bamtools_filter.cpp
-rw-r--r-- 1044 bamtools_filter.h
-rw-r--r-- 2400 bamtools_header.cpp
-rw-r--r-- 1036 bamtools_header.h
-rw-r--r-- 2129 bamtools_index.cpp
-rw-r--r-- 979 bamtools_index.h
-rw-r--r-- 3463 bamtools_merge.cpp
-rw-r--r-- 954 bamtools_merge.h
-rw-r--r-- 11992 bamtools_options.cpp
-rw-r--r-- 7240 bamtools_options.h
-rw-r--r-- 7319 bamtools_sam.cpp
-rw-r--r-- 949 bamtools_sam.h
-rw-r--r-- 10426 bamtools_sort.cpp
-rw-r--r-- 1008 bamtools_sort.h
-rw-r--r-- 1985 bamtools_stats.cpp
-rw-r--r-- 1003 bamtools_stats.h
-rw-r--r-- 969 bamtools_tool.h
-rw-r--r-- 8903 bamtools_utilities.cpp
-rw-r--r-- 1363 bamtools_utilities.h
-rw-r--r-- 3871 bamtools_variant.h