]> git.donarmstrong.com Git - ape.git/blobdiff - man/summary.phylo.Rd
adding bd.time
[ape.git] / man / summary.phylo.Rd
index 13aaf13730364fda0e2a4b5e56fda4ff51396740..984b65adfe176d7d039aa8b29dddb2c525324602 100644 (file)
@@ -12,7 +12,7 @@ Nedge(phy)
 }
 \arguments{
   \item{object, phy}{an object of class \code{"phylo"}.}
-  \item{...}{further arguments passed to or from other methods.}
+  \item{\dots}{further arguments passed to or from other methods.}
   \item{internal.only}{a logical indicating whether to return the number
     of internal nodes only (the default), or of internal and terminal
     (tips) nodes (if \code{FALSE}).}
@@ -31,10 +31,6 @@ Nedge(phy)
   optional elements (branch lengths, node labels, and root edge) are not
   found in the tree.
 
-  If the tree was estimated by maximum likelihood with
-  \code{\link{mlphylo}}, a summary of the model fit and the parameter
-  estimated is printed.
-
   \code{summary} simply prints its results on the standard output and is
   not meant for programming.
 }
@@ -42,10 +38,10 @@ Nedge(phy)
   A NULL value in the case of \code{summary}, a single numeric value for
   the three other functions.
 }
-\author{Emmanuel Paradis \email{Emmanuel.Paradis@mpl.ird.fr}}
+\author{Emmanuel Paradis}
 \seealso{
   \code{\link{read.tree}}, \code{\link[base]{summary}} for the generic R
-  function
+  function, \code{\link{multiphylo}}, \code{\link{c.phylo}}
 }
 \examples{
 data(bird.families)